冷战时期，美国通过扶植东南亚的资本主义国家，在亚洲建立了一条军事阵线，防范中国、苏联等社会主义国家。而当冷战已经成为陈年旧事的时候，美国对东南亚的军事影响也就逐渐减弱了。

这一情况在“9·11”事件爆发后发生了改变，美国开始意识到恐怖主义的威胁，出于战略考虑决定重返东南亚，所以开始重新和东南亚各国建立密切的军事联系。虽然美国是超级大国，但是东南亚也不完全是它的后花园，所以借着美国想与东南亚进行军事合作的机会，各国纷纷从美国政府的口袋中榨取了不少军费，获得了美国的援助。

最大的受益者自然是与美国联系最紧密的菲律宾。从2002年开始，美国连续四年向它提供了上亿美元的援助，理由是帮助菲律宾打击恐怖势力，实际上则是增强菲律宾的军事实力，让它的东南亚盟友变得更强大一些。而2002年，两国还签订了关于后勤支援的协议，美军在东南亚进行军事活动，菲律宾会为其提供后勤支持，这无疑增强了美国的远洋打击能力。同时，在装备、心理训练、战斗技术等方面，美国也提供了不少帮助。

印尼和美国曾一度中断军事合作，借着这次机会也重新建立起了联系。美国给印尼的好处是，将原本针对印尼的武器禁运令放宽，并陆续向印尼提供将近5000万美元的发展资金，而印尼则以答应美军在自己的海岸线上建立军港作为交换。

除了将手伸到印尼和菲律宾，在泰国、新加坡，美国也陆续有了建造军港、基地的计划。这下美军可以把东南亚当自家阵营了，不管走到哪里都不缺后勤援助。同时，美国还与泰国、新加坡进行了反恐演习，为两国军队提供了不少针对性支持，以提高它们的反恐能力。