将置于磁场中的原子核的密度、环境及位置信息用一定的技术方法表达出来。

选层梯度：在主磁体中加一个梯度磁场，则被检测部位的质子群的进动频率可因为磁场强度不同而有所区别，这样可对被检测某一部位进行磁共振成像，其空间定位依靠梯度磁场，通过梯度磁场达到选层的目的。

编码是将研究的物体断层分为若干个体素，对每个体素定一个记号。

相位编码：在激励脉冲结束后，在沿层面的Y轴方向加一短时间的梯度磁场，由于不同Y坐标的自旋磁矩的进动频率不一样，从而在梯度磁场撤除后，磁矩的相位不一样。依据不同的相区分Y坐标，称为相位编码。

频率编码：在相位编码结束后，沿着X轴方向加一梯度磁场，从而使不同X坐标的自旋磁矩的进动频率不一样，进而依据这种进动频率的差异来确定X坐标，称为频率编码。

傅里叶变换就是将信号的时间-强度函数关系转变为频率-强度的函数关系。利用XY方向上的傅里叶变化，可实现XY平面内的MR信号的空间定位，实现断面图像的重建。