药学分子生物学

林丽彬,陈小萍,吴志鹏,蔡丽希

目录

  • 1 绪论
    • 1.1 分子生物学与药学分子生物学
    • 1.2 分子生物学的发展历史
    • 1.3 分子生物学与生物医药
  • 2 基因与基因组
    • 2.1 基因概念及分类
    • 2.2 基因结构与功能
    • 2.3 基因组
    • 2.4 基因组学
  • 3 DNA的复制、损伤与修复
    • 3.1 复制的概念及特征
    • 3.2 复制的相关酶学
      • 3.2.1 章节测验
    • 3.3 复制的过程
    • 3.4 阻止DNA复制的药物(了解)
    • 3.5 DNA损伤
    • 3.6 DNA损伤修复
  • 4 转录及其调控
    • 4.1 原核生物转录
      • 4.1.1 原核生物转录模板、酶及相关因子
      • 4.1.2 原核生物转录过程
    • 4.2 真核生物转录
      • 4.2.1 真核生物转录酶及相关因子
      • 4.2.2 真核生物转录过程(了解)
      • 4.2.3 真核生物RNA成熟
    • 4.3 转录调控
  • 5 翻译及其调控
    • 5.1 蛋白质的生物合成
    • 5.2 蛋白质合成后的折叠加工
    • 5.3 蛋白质转运与定位
    • 5.4 蛋白质合成的调控(了解)
  • 6 细胞信号转导基础
    • 6.1 第一节 信号传导的概述
    • 6.2 第二节 主要信号传导途径
    • 6.3 第三节 细胞信号传导的特性
    • 6.4 第四节 信号传导与分子靶向药物
  • 7 常用分子生物学技术
    • 7.1 第一节 分子杂交技术
    • 7.2 第二节 目的基因制备技术
    • 7.3 第三节 基因敲除技术
    • 7.4 第四节 RNA干扰技术
    • 7.5 第五节 CRISPR/Cas9系统介导的基因组编辑技术
    • 7.6 第六节 大分子间的相互作用概述
  • 8 药物基因组学
    • 8.1 第一节 概述
    • 8.2 第二节 药物基因组学与精准医疗
    • 8.3 第三节 药物基因组学与药物研发
  • 9 药物转录组学
    • 9.1 第一节 转录组学概述
    • 9.2 第二节 转录组学在药学中的应用
  • 10 药物蛋白质组学
    • 10.1 第一节 蛋白质组学概述
    • 10.2 第二节 药物蛋白质组学在药学中的应用
  • 11 外源基因表达与基因工程药物
    • 11.1 第一节 概述
    • 11.2 第二节 外源基因表达基本过程
    • 11.3 第三节 原核细胞表达系统
    • 11.4 第四节 真核细胞表达系统
    • 11.5 第五节 重组基因工程药物
第二节 主要信号传导途径


第二节 主要信号传导途径


G蛋白偶联受体信号传导途径

酶偶联受体(酶受体)信号传导途径

依赖于受调蛋白水解信号传导途径

胞内受体信号传导途径

 

一、G蛋白偶联受体信号传导途径
(一) G蛋白简介

三聚体G蛋白( αβγ 100kD)具有一个鸟苷酸结合位点 。作为信号转导分子,在各种细胞信号转导途径中转导信号给不同的效应分子(如AC)。

 

三聚体G蛋白结构特点和功能

①与受体结合并受其活化调节的部位

②βγ亚基结合部位

③GDP/GTP结合部位

④与下游效应分子相互作用部位

 

α亚基具有多个功能位点

α亚基具有GTP酶活性(能催化所结合的GTP水解,霍乱毒素可使其丧失GTP酶的活性)

 

α亚基:(Gα)

 

β、γ亚基:(Gβγ)

 

主要作用是与α亚基形成复合体并定位于质膜内侧;

在哺乳细胞,βγ亚基也可直接调节某些效应蛋白。

附:α亚基种类众多,可与β、γ亚基形成不同功能的三聚体G蛋白。

哺乳动物细胞中Ga亚基种类及效应

(s代表stimulate);i代表inhibit)

(二) G蛋白偶联受体信号传导的基本过程

①配体(信号分子)结合受体并激活受体;

②G蛋白活化及G蛋白循环;

③G蛋白激活下游效应分子;

④第二信使产生及分布变化;

⑤第二信使激活蛋白激酶进而激活效应蛋白,有快慢调节。

 

G蛋白循环

①GDP结合G蛋白,G蛋白不能激活效应分子。

②信号分子作用受体后,可使G蛋白上的GDP被GTP取代,βγ与α解聚, 游离的α能激活效应分子。

③α水解α-GTP成α-GDP,后者失去催化活性与βγ亚基重新聚合。

 

(三)AC-cAMP-PKA途径和PLC-IP3/DAG途径
 1、AC-cAMP-PKA途径

最早发现的信号传导途径。1957年Sutherland在研究肾上腺素促进肝糖原分解的机制时发现,这些激素的作用依赖于cAMP,从而提出了cAMP是激素在细胞内的第二信使这一著名的激素信号跨膜传递学说。

现在发现有刺激型AC-cAMP-PKA途径(如肾上腺素作用于心肌细胞)和抑制型AC-cAMP-PKA途径(如肾上腺素作用于平滑肌细胞)。共同维持机体的动态平衡。

 

典例:胰高血糖素的AC-cAMP-PKA途径

胰高血糖素的AC-cAMP-PKA途径

①胰高血糖素结合于受体;

②受体构象改变使与G蛋白结合GDP被GTP取代,Gα获得活性;

③通过G蛋白循环激活AC;

④AC使胞内cAMP浓度增加;

⑤cAMP激活PKA;

⑥PKA磷酸化胞内代谢酶或基因调控蛋白,可通过快慢调节引起相应生物学效应;

⑦cAMP可被PDE降解为5’-AMP,PKA失活。

PKA功能

PKA活化后,可使多种蛋白质底物的丝氨酸或苏氨酸残基发生磷酸化,改变其活性状态,底物分子包括一些糖、脂代谢相关的酶类(快速调节)、离子通道和某些转录因子(CREB-CRE慢速调节)。

CREB: cAMP response element binding protein(反式作用因子)

CRE: cAMP response element(顺式作用元件)

 

AC-cAMP-PKA途径快速应答
 --对代谢相关酶活性的调节

激素→ G蛋白偶联受体→G蛋白→AC→cAMP– →PKA→磷酸化靶酶→生物学效应。

例如在肝细胞中,激活的PKA有多个底物,包括磷酸化酶激酶(磷酸化激活)和糖原合成酶(磷酸化抑制)。被激活的磷酸化酶可将糖原磷酸化而分解成1-磷酸葡萄糖,最后生成葡萄糖进入血液循环。

 

AC-cAMP-PKA途径慢速应答
--对基因表达的调节

激素→ G蛋白偶联受体→G蛋白→AC→cAMP→ PKA →磷酸化基因调控蛋白→调控基因转录→生物学效应。

例如某些分泌细胞内需要几个小时。激活的PKA进入细胞核,将CREB磷酸化,磷酸化的CREB以二聚体形式结合于DNA上的CRE,从而激活受CRE调控的基因的转录。

利用AC-cAMP-PKA途径转导的信息分子

 

2、PLC-IP3/DAG途径(双信使系统视频演示3,注意动画中缺少G蛋白)



DAG--PKC途径

IP3-- Ca2+途径

磷脂酶C(PLC):催化PIP2 → IP3 +DAG

 

血管紧张素II的PLC-IP3/DAG途径

①血管紧张素II(或抗利尿激素)结合于受体;

②受体构象改变使与G蛋白结合GDP被GTP取代,Gα获得活性;

③通过G蛋白循环激活PLC;

④PLC使胞内IP3、DAG浓度增加;

⑤IP3结合内质网膜上的Ca2+通道,Ca2+通道打开,胞液中Ca2+浓度增加;

⑥一方面DAG和Ca2+共同激活靶分子PKC ;另一方面Ca2+通过与CaM结合,进一步激活CaM-K;

⑦PKC或CaM-K磷酸化胞内代谢酶或基因调控蛋白,可通过快慢调节引起相应生物学效应(血管收缩或抗利尿)。

 

Ca2+和CaM

Ca2+在细胞中的分布具有明显的区域特征(胞外和内质网内、线粒体内高,胞液中很低);

Ca2+信号功能主要是通过钙调蛋白(calmodulin,CaM)实现。

4个Ca2+ 结合1个CaM后,导致CaM发生构象变化后,作用于Ca2+/CaM依赖性激酶(CaM-K), CaM-K再激活效应蛋白。

利用PLC-IP3/DAG途径转导的信息分子

 

小结:G蛋白参与信号转导的基本模式

水溶性信息分子(肾上、胰高;血管、抗利尿)+7次跨膜受体

G蛋白(G蛋白循环)

激活效应分子(如AC、PLC)

第二信使(如cAMP、IP3、DAG、Ca2+ 、 cGMP)

靶分子(PKA,PKC, CaM-K )

生物学效应(快慢调节:磷酸化胞内代谢酶或基因调控蛋白)

 

二、酶偶联受体/酶受体信号传导途径

受体型酪氨酸激酶(RTK)介导的信号传导

酪氨酸激酶偶联受体介导的信号传导

受体型丝/苏氨酸激酶介导的信号传导

 

酶偶联受体/酶受体信号传导特点

①信息分子结合受体,受体形成二聚体或寡聚体,同时激发受体本身酶活性(如EGF受体)或受体偶联酶的活性(如IFN受体)使信号继续向下游传递。

②主要特征是级联磷酸化反应。

③一般是通过蛋白质-蛋白质相互作用激活胞内蛋白激酶。

④蛋白激酶通过磷酸化修饰激活代谢途径中的关键酶(快速调节)、反式作用因子(慢速调节)等,影响代谢途径、基因表达、细胞运动、细胞增殖等。

 

(一)受体型酪氨酸激酶(RTK)介导的信号传导
1、 RTK的结构与RTK的活化

(1)RTK的结构

单次跨膜受体,胞外(N端)具有配体结合结构域;胞内(C端)具有酪氨酸激酶结构域。见右图

(2)RTK的活化

配体结合—-受体多聚化,构象改变---胞内的酪氨酸激酶结构域中的酪氨酸残基自身磷酸化—-下一级具有SH2结构域的信号分子与之结合-—信号依次传递。见下图

 

表皮生长因子受体作用机制:

2、RTK信号传导途径

(1)Ras-MAPK级联反应信号传导途径:表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor, EGFR)是一个典型的受体型PTK。

(2)其他RTK信号传导途径。略

 

表皮生长因子(epidermal growth factor)

Grb2 (growth factor  binding protein) : 生长因子结合蛋白,一种衔接蛋白,具有SH2结构域(能识别磷酸化的酪氨酸残基并与之结合)。

Sos(son of sevenless):具有鸟苷酸交换因子GEF的活性

Raf具有丝/苏氨酸蛋白激酶活性

 

表皮生长因子的细胞信号传导途径

①表皮生长因子结合于细胞膜上受体型酪氨酸蛋白激酶,通过自身磷酸化改变其活性;

②再通过Grb2以及Sos,使Ras原来结合GDP被GTP取代,Ras被激活;

③有活性的Ras激活MAPK三级体系(Raf→ MEK→ ERK);

④ERK磷酸化相应底物(转录因子或蛋白激酶等),导致的相关基因表达和细胞周期的改变。

 

哺乳动物细胞三个重要的MAPK亚家族

细胞外调节激酶(extracellular regulated kinase,ERK);

c-Jun N -末端激酶/应激激活的蛋白激酶(c-Jun N-terminal kinase/stress-activated protein kinase,JNK/SAPK)

P38-MAPK (韩家淮)

MAPK三级级联激活是多种信号通路的中心。

 

MAPK作用机制和调控的生物学效应

MAPK作用机制:被激活后转移至细胞核内,使一些转录因子发生磷酸化,改变细胞内基因表达的状态(慢调节)。另外,它也可以使一些酶发生磷酸化使之活性发生改变(快调节)。

MAPK调控的生物学效应:参与多种细胞功能的调控,尤其是在细胞增殖、分化、应激及凋亡过程中,是多种信号转导途径的共同作用部位。

 

(二)酪氨酸激酶偶联受体介导的信号传导

STAT(signal transducer and activator of transcription):
一种转录因子,被磷酸化后以二聚体进入核内调节基因表达。

酪氨酸激酶偶联受体介导的信号传导 (以α-干扰素信号传导为例)

①α-干扰素与受体结合,相邻受体偶联的jak引发对方磷酸化。

②激活的jak使受体磷酸化。

③stat锚定于受体的磷酸化位点并被jak磷酸化。

④磷酸化的stat与受体解离,形成二聚体,进入细胞核与其他基因调节蛋白结合成复合物。

⑤此复合物作用于靶基因上的干扰素反应元件,调节相关基因表达。

 

(三)受体型丝/苏氨酸激酶介导的信号传导
以转化生长因子β 为例

Smad家族被磷酸化后形成多聚体进入核内调节基因表达。其取名来自果蝇mad和线虫sma基因。

 

三、依赖于受调蛋白水解信号传导途径

肿瘤坏死因子

2种衔接蛋白-RIPK-IKKK  NF-B(nuclear factor-B)是一种几乎存在于所有细胞的转录因子,广泛参与机体防御反应、组织损伤和应激、细胞分化和凋亡以及肿瘤生长抑制等过程。

I B (inhibitor of NF-B,)是 NF-B抑制蛋白,也可被PKA,PKC等磷酸化去抑制作用。

 

四、胞内受体信号传导途径

胞内受体通常为400-900个AA残基组成的蛋白质,包括4区:其中配体结合区、DNA结合区、转录激活区、NLS。

其多为转录因子,与脂溶性信息分子(如类固醇激素、甲状腺素、维甲酸、维生素D)结合后,复合物能与DNA的顺式作用元件结合,在转录水平调节基因表达。

 

类固醇激素的信息传递途径

①类固醇激素的受体位于胞内,受体与热休克蛋白结合,没有活性;

②当类固醇激素进入胞内与受体结合后,受体与热休克蛋白分离,而与激素结合为激素受体复合物;

③该复合物进入核内与DNA上HRE结合,从而促进或抑制某些特异基因的转录,引起相应生物学效应。

 

糖皮质激素类药物(可的松,强的松,地塞米松等)抗炎作用机制

糖皮质激素抗炎作用机制:

①GC由血清蛋白携带到达靶细胞;

②GC扩散进入胞浆内,并与胞内GR—Hsp结合,同时Hsp被分离。

③GC和GR复合物进入细胞核,与靶基因启动子序列的GRE结合,增加抗炎细胞因子基因转录。与nGRE结合,抑制致炎因子的基因转录,而产生抗炎作用。

注意:甲状腺素是与核受体结合。

 

体内的NO生成

NO合酶(NOS)催化生成。 Ca2+/CaM可增加NOS的活性。

NO是非极性小分子,易穿过细胞膜,从产生的细胞扩散到临近细胞中发挥作用。NO是心血管中重要的信号分子。

Furchgott、Ignarro、Murad发现NO是心血管系统的信号分子获1998年诺贝尔生理和医学奖。

 

NO的细胞信号传导途径

①NO结合于细胞内鸟苷酸环化酶(GC);

②GC活性增加使第二信使cGMP浓度增加;

③cGMP激活靶分子PKG;

④PKG磷酸化相应底物,并改变底物活性,产生相应的生物学效应(导致血管平滑肌舒张)。

 

临床运用

硝酸甘油等药物在临床上作为血管扩张剂(降压作用)使用是因为它们能自发地产生NO;

Viagra(万艾可,俗名伟哥)通过抑制cGMP分解酶的作用而提高cGMP的浓度,促使阴茎血管舒张而勃起。