《生物信息学(双语)》
王亮灯
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1 绪论 Introduction
1.1 生物信息学概述(Bioinformatics Introduction)
1.2 中心法则(The Central Dogma)
1.3 分子同源性(Molecular Homolgy)
1.4 章节测验
2 数据库基础 Database Fundamentals
2.1 数据模型(Data Model)
2.2 数据库概述(Database Introduction)
2.3 章节测验
3 生物信息数据库 Bio-database
3.1 生物信息数据库(Bio-database)
3.2 文献检索(Literature Search)
3.3 序列检索(Sequence Query)
3.4 NCBI网站介绍 (Introduction of NCBI)
3.5 NCBI的数据库 (Databases in NCBI)
3.6 章节测验
4 序列比对 Sequence Alignment
4.1 序列比对概述(Sequence Alignment Introduction)
4.2 计分矩阵(Score Matrix)
4.3 序列两两比对(Pair-wise Sequence Alignment)
4.4 序列两两比对 上机实践(Pairwise Sequence Alignment)
4.5 Blast 上机实践 (Practice of BLAST in PC)
4.6 多序列比对的一般步骤(Multiple Sequence Alignment)
4.7 多序列比对 上机实践(Multiple Sequence Alignment)
4.8 章节测验
5 系统进化分析
5.1 分子进化理论(Hypothesis for Molecular Evolution)
5.2 系统进化树概述(Phylogenic Tree Introduction)
5.3 邻接法构建系统进化树(The Neighbor-joining Method for Phylogenetic Trees)
5.4 M-P法构建系统进化树(The Maximum Parsimony Method for Phylogenic Tree Construction)
5.5 系统进化树构建上机实践 (Construction of Phylogenetic Trees)
5.6 章节测验
6 基因组学
6.1 基因预测 上机实践(Practice of Gene Prediction)
6.2 PCR引物设计
6.3 章节测验
7 蛋白质组学
7.1 蛋白质组学(Proteomics Introduction)
7.2 蛋白质空间结构预测(Protein Structure Prediction)
7.3 蛋白质结构预测 上机实践(Prediction of Protein Structure
7.4 章节测验
8 生物信息学前沿
8.1 遗传诊断(Genetic Diagnosis)
8.2 生物芯片(Microarray)
8.3 高通量测序数据分析方法(Analysis of Data from High-throughput sequencing)
8.4 生物信息学前沿(文献)
8.4.1 比较基因组学在水产研究中的应用
8.4.2 比较代谢组学在水产研究中的应用
数据库概述(Database Introduction)
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