生物信息数据库与网络基础
(Biological Databases and internet fundamentals)
具体内容:生物信息数据库概述、核酸数据库、蛋白质数据库、生物大分子结构数据库、其他数据库、数据库搜索。
重点:重要的核酸、蛋白质及生物大分子结构的数据库。
难点:重要生物数据库的使用方法。
教学目标:使学生了解掌握几个重要生物信息数据库的使用方法。
1.The development charactersof Bio-databases (生物数据库的发展特点)
First of all, as the data keep updating, the data sizegrowing exponentially. Second, the developmentof Bio-databases is towards networking. Third,The complexity of databases is increasing.(首先,数据更新速度加快,数据量呈指数增长。第二,数据库的发展趋向网络化。第三,数据库复杂程度增加)
2. Thetype ofthe Bio-databases.(生物数据库的类型)
Generally, the Bio-databases can be divided into fourtypes. The first one is nucleotide sequence databases. The second one isprotein sequence databases. The third one is protein structure databases. Thelast one is genomic databases.(一般来说,生物数据主要分为4大类,第一类是核酸序列数据库;第二类是蛋白质序列数据库;第三类是蛋白质结构数据库;第四类是基因组数据库。)
3.Someworld famous Bio-databases.(著名的生物数据库)
Threelargest famous nucleotide sequence databases : GenBank database, EMBL database andDDBJ database.(三大著名的核酸序列数据库:GenBank数据库、EMBL数据库和DDBJ数据库。)
Proteinsequence databases: PIR database andUniProtdatabase(includingSwiss-Prot and TrEMBL databases) 蛋白质序列数据库:PIR数据库,UniProt数据库(包括Swiss-Prot和TrEMBL数据库)