第三节 病毒的分类
病毒的种类多达数千种,为了研究及应用的方便,对病毒必须进行分类。20世纪50年代以前,由于对病毒的基本特性了解很少,主要根据病毒所致的疾病及组织或器官嗜性分类,未能反映病毒的本质。1961年Looper建议,以病毒核酸作为病毒分类的首要标准,从此病毒分类开始形成较合理的框架。
一、分 类 的 机 构 及 标 准
1966年建立了国际病毒命名委员会(1CNV),1973年更名为国际病毒分类委员会(International committee on taxonomy of viruses,ICTV),作为国际公认的病毒分类与命名的权威机构。
迄今为止,ICTV共出版7次分类报告,第6次报告由动物病毒学家Murphy主编,载有病毒形态及基因组结构的大量插图,反映了病毒已趋于完善。对第6次报告的内容稍作调整后,2000年出版了第7次分类报告。第1、2及4次分类报告有廖延雄教授主译出版了中文本,确定了许多病毒 的汉语名称,有关术语沿用至今。
病毒的名称由ICTV认定。其命名与细菌不同,不再采用拉丁文双名法,而是采用英文或英语化的拉丁文,只用单名,也不用斜体书写。但是目、科、亚科、属分别用拉丁文后缀“-virales”、“-viridae”、“-virinae”及“-virus”。
病毒分类根据形态与结构、核酸与多肽、复制以及对理化因素的稳定性等诸多方面。随着分子生物学技术的发展,至1998年4月,已完成包括76种人类病毒在内的572株病毒的基因组全序列测定,病毒基因组的特征对分类愈来愈显得重要。例如动脉炎病毒属原为披膜病毒科的一个属,现已独立为动脉炎病毒科(Arteriviridae),因其具有套式系列mRNA,与披膜病毒全然不同,尽管形态有相似之处。
二、分 类 的 现 状
根据ICTV的分类报告,目前可把所有已知病毒分为233个属。其中204个属归于64个科,脊椎动物病毒为主的有27科,无脊椎动物为主的有5科,其余分别为植物病毒、细菌病毒(嗜菌体)、真菌病毒,藻类和霉形体病毒。科下设属,有的科还分亚科,科和属是病毒分类的最主要单位。
从第6次分类报告开始,把病毒分为3大类:DNA病毒类、DNA反转录与RNA反转录病毒类、RNA病毒类。根据病毒进化的系统发生学的关系,第7次分类报告在部分科之上建立了3个目,其中1个尾病毒目(Caudovirales)涉及噬菌体,2个涉及动物病毒,分别是单负股病毒目“Mononegavirales”以及套式病毒目“Nidovirirales”。
病毒的种是一个不确定的分类单位。1990年ICTV将其定义为具有一定世代关系并占据一定生境(niche)的病毒群。也就是在有科和属的特征的前提下,把某些次要特征大致但不完全相同的病毒归为同一种病毒。该定义既符合病毒的易变性,又符合病毒学者的工作传统。
亚病毒(Subvirus)是比病毒结构更为简单的微生物,其分类及有关介绍一般均附于病毒学之内。最重要的亚病毒有类病毒(Viroid)及朊病毒(Prion),前者只含核酸不含蛋白质,仅感染植物;后者只有传染性蛋白质无核酸,对动物和人有致病性。

