目录

  • 1 绪论
    • 1.1 生物化学发展史、研究内容和在生命科学中的重要地位
  • 2 第一章 蛋白质的结构与功能
    • 2.1 第一节 蛋白质的分子组成
    • 2.2 第二节 蛋白质的分子结构
    • 2.3 第三节 蛋白质结构与功能的关系
    • 2.4 第四节 蛋白质的理化性质
  • 3 第二章 酶与酶促反应
    • 3.1 第一节 酶的分子结构与功能
    • 3.2 第二节 酶的工作原理
    • 3.3 第三节 酶促反应动力学
    • 3.4 第四节 酶的调节
    • 3.5 第五节 酶的分类与命名
    • 3.6 第六节 酶在医学中的应用
  • 4 第三章 核酸的结构与功能
    • 4.1 第一节 核酸的化学组成及其一级结构
    • 4.2 第二节 DNA的空间结构与功能
    • 4.3 第三节 RNA的空间结构与功能
    • 4.4 第四节 核酸的理化性质
  • 5 第七章 糖代谢
    • 5.1 第一节 糖的摄取与利用
    • 5.2 第二节 糖的无氧氧化
    • 5.3 第三节 糖的有氧氧化
    • 5.4 第四节 磷酸戊糖途径
    • 5.5 第五节 糖原的合成与分解
    • 5.6 第六节 糖异生
    • 5.7 第七节 葡萄糖的其它代谢途径
    • 5.8 第八节 血糖及其调节
  • 6 第八章 脂质代谢
    • 6.1 第一节 脂质的构成、功能及分析
    • 6.2 ​第二节 脂质的消化与吸收
    • 6.3 第三节 甘油三脂代谢
    • 6.4 第四节 磷脂代谢
    • 6.5 第五节 胆固醇代谢
    • 6.6 ​第六节 血浆脂蛋白及其代谢
  • 7 第九章 氨基酸代谢
    • 7.1 第一节 蛋白质的营养价值与消化、吸收
    • 7.2 第二节 氨基酸的一般代谢
    • 7.3 第三节 氨的代谢
    • 7.4 第四节 个别氨基酸的代谢
  • 8 第十章 生物氧化
    • 8.1 第一节 生物氧化与能量代谢
    • 8.2 第二节 线粒体氧化体系与呼吸链
    • 8.3 第三节 氧化磷酸化与ATP的生成
    • 8.4 第四节 氧化磷酸化的影响因素
    • 8.5 第五节 其他氧化与抗氧化体系
  • 9 第二十五章 肝的生物化学
    • 9.1 第一节 肝在物质代谢中的作用
    • 9.2 第二节 肝的生物转化作用
    • 9.3 第三节 胆汁与胆汁酸的代谢
    • 9.4 第四节 胆色素的代谢与黄疸
  • 10 第十一章 核苷酸代谢
    • 10.1 第一节 核苷酸代谢概述
    • 10.2 第二节 嘌呤核苷酸的合成与分解代谢
    • 10.3 第三节 嘧啶核苷酸的合成与分解代谢
  • 11 第十三章 真核基因与基因组
    • 11.1 第一节 真核基因的结构与功能
    • 11.2 第二节 真核基因组的结构与功能
  • 12 第十四章 DNA的合成
    • 12.1 第一节 DNA复制的基本规律
    • 12.2 第二节 DNA复制的酶学和拓扑学(1)
    • 12.3 第二节 DNA复制的酶学和拓扑学(2)
    • 12.4 第三节 原核生物DNA复制过程
    • 12.5 第四节 真核生物DNA复制、第五节逆转录
  • 13 第十三章 DNA损伤和损伤修复
    • 13.1 DNA损伤和损伤修复
  • 14 第十五章 RNA的合成
    • 14.1 第一节 原核生物转录的模板和酶
    • 14.2 第二节 原核生物的转录过程
    • 14.3 第三节 真核生物的转录过程
    • 14.4 第四节 真核生物RNA前体的修饰加工及降解
  • 15 蛋白质的合成
    • 15.1 第一节 蛋白质合成体系
    • 15.2 第二节 氨基酸与tRNA的连接
    • 15.3 第三节 肽链的合成过程
    • 15.4 第四节翻译后 加工和靶向输送、第五节降解
    • 15.5 随堂测验
  • 16 基因表达调控
    • 16.1 第一节 基因表达调控的基本概念和特点
    • 16.2 第二节 原核基因表达调控(1)
    • 16.3 第二节 原核基因表达调控(2)
    • 16.4 第三节 真核基因表达调控
    • 16.5 随堂测验
  • 17 细胞信号转导的分子机制
    • 17.1 第一节 细胞信号转导概述
    • 17.2 第二节 细胞内信号转导分子
    • 17.3 第三节 细胞受体介导的细胞信号转导
    • 17.4 第四节,第五节
  • 18 癌基因抑癌基因
    • 18.1 重点难点
    • 18.2 癌基因
    • 18.3 抑癌基因
  • 19 DNA重组和重组DNA技术
    • 19.1 开篇概述、重点难点
    • 19.2 第一节
    • 19.3 第二节第三节
  • 20 常用分子生物学技术
    • 20.1 第一节
      • 20.1.1 第二节
      • 20.1.2 第三节
      • 20.1.3 第四节
      • 20.1.4 第五节
      • 20.1.5 第六节
  • 21 基因诊断基因治疗
    • 21.1 概述
第三节 蛋白质结构与功能的关系

第三节 蛋白质结构与功能的关系(2学时)

一、蛋白质的主要功能

二、蛋白质执行功能的主要方式

什么是protein-protein interaction(PPI)?

是指两个或两个以上的蛋白质分子通过非共价键相互作用并发挥功能的过程。

蛋白质是生命活动的执行者,蛋白质需要通过与其它蛋白质相互作用实现功能。例如:激素与受体的相互作用;抗原和抗体的特异性识别等。

三、蛋白质一级结构与功能的关系

一级结构是空间结构的基础;一级结构相似,空间结构相似,生物学功能相似。

1.Anfinsen实验

牛核糖核酸酶变性和复性实验,证明蛋白质氨基酸序列决定其构象。

这个经典的生化实验是由美国科学家Anfinsen所设计的,所以也叫做Anfinsen实验。实验的对象实际上是一个酶,就是来源于牛的胰脏里面的一种专门水解RNA的核糖核酸酶。

请注意!这个酶作为研究的对象完全出于偶然。因为当时Anfinsen所工作的研究所旁边有一家大型的宰牛场,这家宰牛场每天都会宰杀大量的牛,牛的胰脏作为废弃物被扔掉。那Anfinsen就以它作为实验对象,从中纯化出高纯度的牛胰核糖核酸酶。)

整个实验实际上分为两个方面:第一个方面就是首先用两种化学试剂,尿素和还原剂(二苏糖醇,也可以用β巯基乙醇)大家注意,在这两个化学试剂的作用下,原来的牛胰核糖核酸酶的三维结构会被完全破坏。

大家想一想:为什么这两种化学试剂可以破坏这种酶的三维结构?

那我们是怎么知道它的三维结构被破坏的?

第二个部分实际上更重要,就是当Anfinsen使用透析的方法把这两种小分子物质除掉,之后发现原来的牛胰核糖核酸酶可以获得差不多绝大多数酶活性。也就是说它可以重新获得水解RNA的能力。

大家想一想:这个酶为什么在三维结构已经破坏的情况下,可以重新回复它水解RNA的这个能力?

肯定是它重新折叠得到它原来正确的三维结构,但是这里有一个非常重要的问题,就是在折叠的时候,如何保证它原来的四个二硫键能够正确地配对?假如说无法保证原来四个二硫键正确配对的话,那么即使它重新折叠,折叠出来的三维结构也极有可能是不正确的 。这样就很难使得它获得原来水解RNA的这个活性。但是实验证明它几乎所有的酶活性都恢复了。这说明一点,就是这个蛋白质在一级结构没有被破坏的情况下,能够重新折叠。换句话说,就是这个蛋白质的一级结构包含了它重新折叠所需要的全部的化学信息。

由此Anfinsen就得出了一个非常重要的结论:蛋白质的一级结构决定蛋白质的空间结构,也就是说一个蛋白质的一级结构中已经包含了这个蛋白质折叠所需要的全部信息。

http://www.kunlunce.com/ssjj/guojipinglun/2018-08-06/127067.html

2.胰岛素及功能

哺乳动物的胰岛素都由A链和B链组成。由下图我们可以看到,牛胰岛素与人胰岛素有三个氨基酸的差别(绿色),而猪胰岛素相对更接近人,仅有一个氨基酸的差别(红色)。不同种族哺乳动物(人、牛、羊、猪等)的胰岛素分子的氨基酸序列和结构虽稍有差异,但关键氨基酸序列都相同,都具有相同生物学功能。

3.细胞色素c的氨基酸序列揭示物质进化关系

胞色素c是电子传递链中的关键蛋白,在生物氧化中发挥重要的作用,在各种生物中的氨基酸序列相对保守,尽管经历了15亿年的进化,细胞色素c的104个aa.中仍有21个保持不变,甚至黑猩猩和智人的序列完全相同。通过对多种生物细胞色素c的氨基酸序列差异程度的分析,可以绘制生物进化树。

4.一级结构改变与分子病一级结构中关键氨基酸改变会导致疾病的发生,称为分子病,如镰刀状红细胞贫血症。

四、蛋白质空间结构与功关系

1.构象决定性质和功能:纤维蛋白和球状蛋白性质和功能的差异;Mb和Hb结构及功能的差异。

2.别构改变活性:Hb的变构

协同效应(cooperative effect):寡聚蛋白质中的一个亚基与配体结合后,影响其它亚基与该配体结合能力的现象。分为正协同效应与负协同效应。(四联邮票)

别构效应(allosteric effect:当别构效应剂或别构配体与寡聚蛋白质中的一个亚基或单体蛋白质的别构部位结合后,改变该亚基或单体蛋白质的局部构象,随后引起其它亚基或单体蛋白质的其它部位构象,从而改变它们与配体结合能力的现象。

3.蛋白质的构象改变与疾病:阮病毒(Prp.),如疯牛病。

本节重点内容:氨基酸序列与功能的关系;变构效应。

本节难点内容:如何理解结构是功能的基础,变构改变功能

本节新进展:相关疾病发生发展的生化机制