武夷山茶树种质资源十分丰富，号称“茶树品种王国”。茶树种类的来源分为两大类：一类是武夷山当地的各类单丛、名丛以及从中选育的茶树品种，另一类是从其它茶区引进的品种。20世纪80年代以来，武夷茶区主栽品种突出，搭配品种多样，名丛栽培增多。

大红袍

大红袍被誉为“茶中之王”，居武夷岩茶名丛之首，享誉海内外。原产天心岩九龙窠，其岩壁上有 6 株大红袍母树，其中最早的株丛距今已有350 多年的生长历史。相传清代中期就有大红袍名。大红袍优异品质的形成，离不开得天独厚的地理环境，这里日照短，反射光多，昼夜温差大，岩顶终年有细泉浸润流滴。2012年，大红袍正本无性系群体经福建省农作物品种审定委员会认定为省级良种。现有的纯种大红袍，即奇丹，是来自母树大红袍的扦插无性繁殖。大红袍属无性系，灌木型，中叶类，晚生种。制乌龙茶，品质优异，干茶外形条索紧结、壮实、稍扭曲；色泽褐绿润，带宝色；汤色橙黄至橙红，清澈亮丽；滋味醇厚、回甘，岩韵显，杯底有余香；香气锐浓而悠长，耐泡；叶底软亮匀齐，带砂色或具红绿相间的绿叶红镶边。

水仙

水仙原产于福建省建阳市小湖乡大湖村，主要分布于福建北部、南部。1985年全国农作物品种审定委员会认定为国家级品种。崇安县新志记载：“水仙母树在水吉县大湖桃子岗祝仙洞下，道光时由农人苏姓者发现，繁殖较广，因名其茶为祝仙，水吉方言祝水同音遂讹为水仙，清末移植于武夷。”水仙茶自清末引种武夷山以来，至今约有一百多年的栽培历史，栽培面积不断扩大，成为稳定的主栽品种之一，栽培面积约占全市茶叶栽培面积三分之一以上，故又称武夷水仙。水仙属无性系，小乔木型，大叶类，晚生种，三倍体。适制乌龙茶、红茶、绿茶。制乌龙茶，成茶外形肥壮、紧结，有宝光色；冲泡后兰花香显，浓而醇；汤色深橙黄，耐冲泡；叶底黄亮朱砂边，为武夷岩茶传统的珍品。尤以岩老丛水仙更佳，老丛水仙一般指树龄50 年以上的水仙品种。老丛水仙制成的干茶冲泡品饮有腐木味、棕叶味、青苔味等独特风味。

肉桂

肉桂原产马枕峰，原为武夷名丛之一,是从名丛培育而成的优质高产品种。1985年福建省农作物品种审定委员会认定为省级品种。20 世纪 40 年代初期，肉桂虽已引起人们的注意，想进一步鉴定其品质，但由于当时栽培管理不善，树势衰弱，未加以重视和繁育。从 20 世纪 60 年代初期起，由于在单丛采制中对其优异的品质特征有新的认识，肉桂才逐渐开始繁育并扩大栽种面积。通过多次反复的品质鉴定，至 20 世纪 70 年代初才肯定肉桂的高产优质的特性，并得到更多茶人的肯定和青睐。从 20 世纪80年代起，栽培面积迅速扩大，现已成为武夷山主栽品种，栽培面积约占全市茶叶面积的40%以上。其中，牛栏坑肉桂被茶界称为“牛肉”，马头岩的则被称为“马肉”，是知名的正岩岩茶。肉桂属无性系，灌木型，中叶类，晚生种。制乌龙茶，条索紧实，香气浓郁辛锐似桂皮香，滋味醇厚甘爽，岩韵显。肉桂茶香气高，品质辛锐，有强烈的刺激性，是不可多得的高香品种。