1．明确分析目标与方法。首先要明确分析的目标，即通过空间分析所要解决的问题、要达到的预期结果。其次，需要弄清解决该问题的过程与方法，包括有哪些步骤、各个步骤中需要用到哪些分析方法、这些方法需要什么软硬件支撑、分析所用的数据是什么、各个阶段如何衔接等等。

2．准备空间数据。空间数据准备是空间分析的必备条件，它包括空间位置数据准备、属性数据准备等内容。前者包括空间几何数据的输入（如扫描矢量化）、编辑、处理（如坐标转换、裁切、拼接、多源数据融合）等，后者是指属性数据的输入与校验。在很多情况下，空间位置数据是现有的，而属性数据则需要在应用中添加。例如，在基于行政区的研究中，行政区的多边形数据往往是现成的，各行政单元的社会经济数据可能源于统计年鉴，需要在分析前进行属性的添加。

3．进行空间分析操作。基于GIS软硬件系统，采用合适的方法对空间数据进行分析，获取相应的空间信息。必要时，可以建立相关的数学模型、图解模型进行模型分析。

4．分析结果的解释与评价。对分析结果进行评价和解释，以确定运算结果是否符合原有要求、是否具有实际意义、是否与预期结果相符。如果分析的结果不能被接受，则需要分析产生问题的原因，是分析过程引起的，或是分析方法、分析数据等方面的不合理所致。必要时应返回前面的相应步骤，在补充适当的条件或调整相关数据与方法之后，重新进行分析操作。

5．结果输出。对于最终的分析结果，往往需要以专题图或报表的形式输出。两种形式的输出对应不同的分析问题：专题图形式对于表达空间关系具有直观性、简明性、易懂性；而报表形式则可以用表格数据显示计算结果，并根据实际情况对最终的数据进行分析，检验其合理性。