科学方法论大体可分为四个层次：

1 、各种技术手段、操作规程等构成的最低层次——经验层次

2 、反映各门学科中的一些具体方法，它属于各门学科本身的研究对象

3 、科学研究中的一般方法，是从各门学科中总结、概括出来的，它不是某一学科独有的，而是各门学科共同适用的方法，如系统论方法等。

4 、第四层次是哲学方法，普遍适用于自然科学、社会科学和思维科学，是一切科学最一般的方法。