《生物信息学(双语)》

吕家恪

目录

  • 1 绪论 Introduction
    • 1.1 生物信息学概述（Bioinformatics Introduction）
    • 1.2 中心法则（The Central Dogma）
    • 1.3 分子同源性（Molecular Homolgy）
    • 1.4 章节测验
  • 2 数据库基础 Database Fundamentals
    • 2.1 数据模型（Data Model）
    • 2.2 数据库概述（Database Introduction）
    • 2.3 章节测验
  • 3 生物信息数据库 Bio-database
    • 3.1 生物信息数据库（Bio-database）
    • 3.2 文献检索（Literature Search）
    • 3.3 序列检索（Sequence Query）
    • 3.4 NCBI网站介绍 （Introduction of NCBI）
    • 3.5 NCBI的数据库 （Databases in NCBI）
    • 3.6 章节测验
  • 4 序列比对 Sequence Alignment
    • 4.1 序列比对概述（Sequence Alignment Introduction）
    • 4.2 计分矩阵（Score Matrix）
    • 4.3 序列两两比对（Pair-wise Sequence Alignment）
    • 4.4 序列两两比对 上机实践（Pairwise Sequence Alignment）
    • 4.5 Blast 上机实践 （Practice of BLAST in PC）
    • 4.6 多序列比对的一般步骤（Multiple Sequence Alignment）
    • 4.7 多序列比对 上机实践（Multiple Sequence Alignment）
    • 4.8 章节测验
  • 5 系统进化分析
    • 5.1 分子进化理论（Hypothesis  for  Molecular Evolution）
    • 5.2 系统进化树概述（Phylogenic Tree Introduction）
    • 5.3 邻接法构建系统进化树（The Neighbor-joining Method for Phylogenetic Trees）
    • 5.4 M-P法构建系统进化树（The Maximum Parsimony Method for Phylogenic Tree Construction）
    • 5.5 系统进化树构建上机实践 （Construction of Phylogenetic Trees）
    • 5.6 章节测验
  • 6 基因组学
    • 6.1 基因预测 上机实践（Practice of Gene Prediction）
    • 6.2 PCR引物设计
    • 6.3 章节测验
  • 7 蛋白质组学
    • 7.1 蛋白质组学（Proteomics Introduction）
    • 7.2 蛋白质空间结构预测（Protein Structure Prediction）
    • 7.3 蛋白质结构预测 上机实践（Prediction of Protein Structure
    • 7.4 章节测验
  • 8 生物信息学前沿
    • 8.1 遗传诊断（Genetic Diagnosis）
    • 8.2 生物芯片（Microarray）
    • 8.3 高通量测序数据分析方法（Analysis of Data from High-throughput sequencing）
    • 8.4 生物信息学前沿（文献）
      • 8.4.1 比较基因组学在水产研究中的应用
      • 8.4.2 比较代谢组学在水产研究中的应用
邻接法构建系统进化树（The Neighbor-joining Method for Phylogenetic Trees）
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