微生物实验室的检测结果为感染性疾病的临床诊断、治疗和预防提供依据，因此，要求结果必须具有高度的准确性可靠性和重复性，并应及时、简单、注重成本。为了实现此目标，必须建立全面的质量控制体系。

微生物检验的质量控制范围贯穿于微生物检验的全过程，包括检验前、检验中和检验后各个环节的质量控制,其主要内容是：①检验前，合理、规范的检验申请，注重标本质量，标本采集与运送的正确性，符合检验目的要求；②检验中，包括人员专业能力，试剂、培养基、设备的质量监控，实验方法的选择及确认，标准化操作程序的建立；③检验后，检验结果要进行评审，报告要求准确及时，危急值及时到达临床，标本的处置方法适宜，符合生物安全；④检验行为严格遵循实验室文件(SOP)的规定，规范操作，并做好相应记录。