正确采集和运送临床标本是细菌学检验质量保证的前提，临床标本的采集和运送应满足细菌学检验的原则要求，对合格标本选择正确的细菌学检验方法进行及时处理，选用恰当的培养基适宜的温湿度和正确的培养方法是成功分离培养细菌的基本要求，而细菌鉴定和抗菌药物敏感性试验是临床标本细菌学检验的核心任务。

细菌学检验结果应遵循分级、限时报告的原则，即初级报告、预报告、终极报告。危急值报告可提供患者病情危急边缘状态，使医生及时对患者施以诊治。危急值报告制度是判定医院管理的重要标志之一，是增强检验人员责任心，提高工作水平，加强临床沟通，增强服务临床的意识。

临床常见标本包括来自无菌部位和有菌部位的标本。采集无菌部位的标本应严格执行无菌操作，在排除污染的前提下，只要有细菌生长即视为致病菌；有菌部位的标本采集时应尽量避免污染，分离的细菌应结合临床进行分析。不同的临床标本应采取不同的处理方法，如血液和骨髓标本要先增菌培养,阳性者进行分离培养鉴定；尿液标本要进行细菌计数，分析目的菌是否为致病菌；细菌含量少的体液标本要离心，取沉淀物涂片镜检及分离培养鉴定。