金黄色葡萄球菌是葡萄球菌属中最常见的致病菌。临床上主要依据镜下形态学特征、培养特征，以及血浆凝固酶试验、甘露醇发酵、触酶试验等加以鉴定。

链球菌，属种类多，形态与培养特征与葡萄球菌属相似，两者可借触酶试验进行鉴别。链球菌属营养要求高，分离培养常用血液琼脂平板。根据链球菌在血琼脂平板上的溶血现象可分为甲型溶血性链球菌、乙型溶血性链球菌和丙型链球菌；根据链球菌多糖抗原可将其分为A、B、C等群。杆菌肽试验、CAMP试验、BGUR试验分别有助于A、B、C群链球菌的鉴

定；胆盐溶菌试验、菊糖发酵试验、Optochin敏感试验有助于肺炎链球菌和甲型链球菌的鉴别。

肠球菌属是医院感染的重要致病菌，实验室鉴定主要依据触酶试验、PYR试验、胆汁七叶苷试验和6.5%NaCl耐盐试验等生化试验。

奈瑟菌属主要致病菌有脑膜炎奈瑟菌和淋病奈瑟菌，临床常通过染色镜检，以及氧化酶糖类发酵和血清学试验等方法进行鉴定，麦芽糖分解和30%触酶试验可鉴别二者。奈瑟菌属对外界抵抗力弱，尤其对寒冷、干燥和热更为敏感，因此在采集和运送标本时需保温、保湿送检，培养基预温，最好床边接种。