学习要求
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1.生物信息学数据库与网络资源
掌握生物信息学和数据库的概念。了解数据库管理系统的分类。熟悉常见的数据库,尤其是NCBI、Ensembl、UCSC三大网站。
2.序列分析基础
熟悉基因可读框的预测。掌握限制性核酸内切酶位点分析方法。了解密码子使用模式分析和重复序列查找。掌握蛋白质理化特性分析、蛋白质结构域分析和蛋白质磷酸化糖基化位点分析,熟悉蛋白质跨膜区分析和信号肽预测。了解蛋白质二级结构分析。掌握同源建模的概念。熟悉蛋白质三级结构分析方法。熟悉相似性和同源性的概念。掌握与数据库中序列进行比对的方法(BLAST)。熟悉多序列比对的方法(ClustalW和Clustal Omega)。了解进化树分析。
3.高通量数据与基因富集分析
熟悉蛋白编码基因的预测和基因启动子区的预测。了解基因组注释的概念。了解蛋白质组学常用分析网站。熟悉归一化、聚类分析和主成分分析的概念。熟悉基于GO和KEGG的基因功能分析方法。了解基于GSEA的基因富集分析和数据挖掘。

