一、物理性质
1. DNA白色纤维状固体,RNA白色粉末状固体,都微溶于水,不溶于乙醇,因此常用乙醇来沉淀DNA ;DNA溶液黏度大于RNA 。
2. DNA难溶于0.14mol/L的NaCl溶液,可溶于1~2 mol/L的NaCl溶液,RNA则相反,可据此分离二者。
3. 加热条件下
D-核糖+浓盐酸+苔黑酚 绿色
D-2-脱氧核糖+酸+二苯胺 蓝紫色
二、溶解度
1.核酸的水解
□微溶于水,不溶于有机溶剂
□ 核酸分子中的磷酸二酯键可在酸或碱性条件下水解切断。
□ DNA和RNA对酸或碱的耐受程度有很大差别。室温条件下,DNA在碱中变性,但不水解,RNA水解。
□ 在细胞内核酸分子受DNA酶作用。
三、酸性化合物
1.两性解离,但酸性强
□ 核酸含酸性的磷酸基团,又含弱碱性的碱基,为两性电解质,可发生两性解离;
□ 核酸相当于多元酸,pH大于4时,呈阴离子状态;
□ 等电点:都小于3.5,且UMP ﹤ GMP ﹤ AMP ﹤ CMP
四、高分子性质
□沉淀行为——加盐(中和电荷);乙醇
□粘度 DNA>RNA
□ 超离心沉降
□凝胶过滤
□分子大小单位:分子量(道尔顿,D)、碱基对数目(bp)
□离心沉降常数(S):生物大分子在单位离心力场里的沉降速度为恒定值。
五、紫外吸收
□ 在核酸分子中嘌呤碱和嘧啶碱都含有共轭双键体系,在260 nm有吸收;
□ 可以作为区别蛋白质和对核酸及其组份定性和定量测定的依据,进行核酸纯度鉴定,也可作为核酸变性和复性的指标。

OD260的应用
1.DNA或RNA的定量
OD260=1.0相当于
50μg/ml双链DNA
40μg/ml单链DNA(或RNA)
20μg/ml寡核苷酸

六、DNA的变性、复性与分子杂交
(一)DNA的变性
1. 概念
2. 变性条件
3. 变性的特征

1. 概念

2.DNA的变性的条件
能够引起核酸变性的因素有:
(1)温度升高;
(2)酸碱度改变、 pH(>11.3或<5.0);
(3)有机溶剂如甲醛和尿素、甲酰胺等;
(4)低离子强度。
3.DNA变性的特征
□ 变性核酸将失去其部分或全部的生物活性。
□ 变性改变了DNA的二级结构。核酸的变性并不涉及磷酸二酯键的断裂,所以它的一级结构(碱基顺序)保持不变。
□ DNA的变性过程是突变性的,它在很窄的温度区间内完成。 DNA解链温度
□ 紫外吸收值明显增加,即增色效应。
□ 粘度降低,沉降系数增加。

影响Tm值的因素
① DNA的均一性:均一DNA(如病毒)的Tm值范围较小;
② DNA中G-C对的含量 :分子中G和C的含量越高,越不易变性,Tm值越高。可通过经验公式计算:
(G+C)%=(Tm-69.3) ×2.44
③ 盐离子强度:Tm值随溶液盐浓度增加而增大;
一般DNA的Tm值在70-85C之间, Tm值较低,易变性,不易保存
增色效应与减色效应
天然DNA分子在热变性条件下,双螺旋结构破坏,碱基暴露,在紫外光260nm波长处的吸收度明显增加,此现象称为增色效应。
变性DNA分子复性形成双螺旋结构时其紫外吸收降低的现象称为减色效应。

(二)DNA的复性
1.变性DNA在适当的条件下,两条彼此分开的单链可以重新缔合成为双螺旋结构,其物理性质和生物活性随之恢复,这一过程称为复性;
2.对于热变性的DNA,在缓慢冷却的条件下可重新结合恢复双螺旋结构,称为退火。
3.DNA复性后,一系列性质将得到恢复,但是生物活性一般只能得到部分的恢复。

DNA的复性条件
1.将热变性的DNA骤然冷却至低温时,DNA不可能复性。即淬火。
2.将变性的DNA缓慢冷却时,可以复性。
退火温度=Tm-25℃
3.分子量越大复性越难。浓度越大,复性越容易。此外,DNA的复性需要一定的盐浓度,也与它本身的组成和结构有关。
影响复性的因素

(三)分子杂交
1.在变性的DNA溶液中加入外源DNA单链分子或RNA单链分子(与原DNA具有同源性),去掉变性条件后复性形成双螺旋结构的过程。
2.这样形成的新分子称为杂交DNA分子。
3.利用核酸杂交可检测特定的核苷酸片段或研究同源性等。

分子杂交的种类
△ Southern Blot:DNA-DNA杂交
△ Northern Blot:DNA-RNA杂交
△ Western Blot:抗原-抗体进行杂交
△ 原位杂交:活体组织上进行杂交,显出荧光


