目录

  • 1 绪论
    • 1.1 生物化学的定义与研究内容
    • 1.2 生物化学的内容组成
    • 1.3 生物化学的形成与发展
    • 1.4 生物化学与专业的关系
  • 2 蛋白质的化学
    • 2.1 概述
    • 2.2 蛋白质总论
    • 2.3 氨基酸的分类与物理性质
    • 2.4 蛋白质的构件——氨基酸
    • 2.5 肽
    • 2.6 蛋白质的结构
    • 2.7 蛋白质的结构与功能
    • 2.8 蛋白质的分离纯化
    • 2.9 蛋白质的性质与分离纯化
    • 2.10 蛋白质的鉴定与分析
    • 2.11 肌红蛋白与血红蛋白
    • 2.12 测验1氨基酸组成、结构与性质
    • 2.13 测验2 肽、蛋白质的结构和功能
    • 2.14 测验3 蛋白质的理化性质
  • 3 核酸化学
    • 3.1 DNA是遗传物质的发现
    • 3.2 概述
    • 3.3 核酸分子的化学组成
    • 3.4 DNA的结构
    • 3.5 tRNA结构
    • 3.6 核酸的分子结构
    • 3.7 核酸的理化性质
    • 3.8 核酸的变性、复性与分子杂交
    • 3.9 核酸的分离、纯化与鉴定
    • 3.10 训练4 核酸的组成、结构基础练习
    • 3.11 训练5 核酸的性质基础练习
  • 4 糖类化学
    • 4.1 第五次拓展训练
  • 5 脂类化学
    • 5.1 脂类概述
    • 5.2 单脂
    • 5.3 复脂
    • 5.4 类脂
    • 5.5 第六次拓展训练
  • 6 酶与维生素
    • 6.1 概述
    • 6.2 酶的分类及命名
    • 6.3 酶的结构
    • 6.4 酶的结构与功能
    • 6.5 酶的作用机理
    • 6.6 酶的高效性机制
    • 6.7 诱导契合学说
    • 6.8 酶促反应动力学
    • 6.9 训练6 酶概述部分基础练习
    • 6.10 训练7 酶组成、结构、作用机理基础练习
    • 6.11 训练8 酶促动力学基础练习
  • 7 生物氧化
    • 7.1 概述
    • 7.2 生物氧化的特点
    • 7.3 生物氧化体系——呼吸链
    • 7.4 ATP的生成方式
    • 7.5 化学渗透假说
    • 7.6 氧化磷酸化的抑制
    • 7.7 线粒体的穿梭系统
    • 7.8 训练9 生物氧化的特点、呼吸链的组成及功能基础练习
    • 7.9 训练10 ATP的生成方式、机理及抑制基础练习
  • 8 糖代谢
    • 8.1 糖原的降解
    • 8.2 葡萄糖的分解代谢
    • 8.3 糖酵解
    • 8.4 糖有氧氧化
    • 8.5 三羧酸循环
    • 8.6 糖有氧氧化的能量计算
    • 8.7 磷酸戊糖途径
    • 8.8 糖异生
    • 8.9 寡糖和多糖的合成
    • 8.10 葡萄糖的合解代谢
    • 8.11 糖代谢的调节
    • 8.12 训练11 多糖降解、糖酵解途径基础练习
    • 8.13 训练12 糖的有氧氧化、磷酸戊糖途径基础练习
    • 8.14 训练13 糖异生途径、糖的合成基础练习
  • 9 脂类代谢
    • 9.1 脂类的贮存、动员与运输
    • 9.2 脂肪的代谢
    • 9.3 脂肪酸氧化
    • 9.4 脂肪酸氧化的能量计算
    • 9.5 酮体的生成与利用
    • 9.6 乙醛酸循环
    • 9.7 脂肪的合成
    • 9.8 磷脂的代谢
    • 9.9 胆固醇代谢
    • 9.10 吉林省教学名师常桂英教授教学视频
    • 9.11 训练14脂肪降解、脂肪酸分解代谢
    • 9.12 训练15 脂肪酸的合成、磷脂、胆固醇的代谢基础练习
  • 10 蛋白质与氨基酸代谢
    • 10.1 氨基酸的一般代谢
    • 10.2 氨的代谢——鸟氨酸循环
    • 10.3 鸟氨酸循环
    • 10.4 氨的转运
    • 10.5 氨基酸的化学反应
    • 10.6 芳香族氨基酸的代谢
    • 10.7 氨基酸的合成代谢
    • 10.8 个别氨基酸的分解代谢
    • 10.9 嘧啶的分解代谢
    • 10.10 训练16蛋白质降解、氨基酸分解代谢基础练习
    • 10.11 训练17 鸟氨酸循环、个别氨基酸分解代谢基础练习
  • 11 核苷酸代谢
    • 11.1 概述
    • 11.2 核苷酸的降解
    • 11.3 嘌呤的分解代谢
    • 11.4 嘌呤核苷酸的合成代谢
    • 11.5 嘌呤核苷酸的从头合成
    • 11.6 嘧啶核糖核苷酸的生物合成
    • 11.7 核苷酸合成的抗代谢物
    • 11.8 脱氧核糖核苷酸和胸苷酸的生成
    • 11.9 训练18 核苷酸的分解、合成代谢基础练习
  • 12 DNA生物合成——复制
    • 12.1 概述
    • 12.2 DNA复制的过程
    • 12.3 半保留复制的发现
    • 12.4 DNA的半保留复制
    • 12.5 参与DNA的复制的酶与蛋白质
    • 12.6 原核生物(大肠杆菌)DNA的复制过程
    • 12.7 真核生物DNA复制
    • 12.8 逆转录 (RNA指导的DNA合成)
    • 12.9 基因突变和DNA的损伤修复
    • 12.10 PCR反应过程
    • 12.11 端粒的复制
    • 12.12 DNA的损伤修复
    • 12.13 训练19 参与DNA合成的酶及过程基础练习
    • 12.14 训练20 逆转录、DNA损伤和修复基础练习
  • 13 RNA 生物合成——转录
    • 13.1 RNA聚合酶
    • 13.2 原核生物的转录
    • 13.3 启动子
    • 13.4 转录的过程
    • 13.5 转录终止机制
    • 13.6 转录后加工
    • 13.7 真核生物的转录
    • 13.8 真核生物的转录后修饰
    • 13.9 训练21 RNA生物合成基础练习
  • 14 蛋白质的生物合成——翻译
    • 14.1 概述
    • 14.2 蛋白质合成体系的组分
    • 14.3 遗传密码的特性
    • 14.4 rRNA与蛋白质合成场所
    • 14.5 蛋白质生物合成过程(原核生物)
    • 14.6 翻译的过程
    • 14.7 肽链合成后的加工
    • 14.8 代谢调节
    • 14.9 蛋白质生物合成的干扰与抑制
    • 14.10 训练22 蛋白质生物合成基础练习
    • 14.11 第二十五次训练  蛋白质合成过程
  • 15 基因表达的调控
    • 15.1 乳糖操纵子
    • 15.2 色氨酸操纵子
    • 15.3 第二十六次训练  物质代谢调节及基因表达调节
  • 16 综合训练
    • 16.1 第二十七次训练  综合训练一
    • 16.2 第二十八次训练  综合训练二
    • 16.3 第二十九次训练  综合训练三
    • 16.4 第三十次训练    综合训练四
  • 17 实验视频
    • 17.1 胰蛋白酶比活力的测定
    • 17.2 离心机的使用
    • 17.3 移液管的使用
    • 17.4 紫外分光光度计的使用
    • 17.5 血清γ球蛋白的分离纯化与鉴定
    • 17.6 血清白蛋白的分离纯化与鉴定
核酸的理化性质


一、物理性质

1. DNA白色纤维状固体,RNA白色粉末状固体,都微溶于水,不溶于乙醇,因此常用乙醇来沉淀DNA ;DNA溶液黏度大于RNA 。

2. DNA难溶于0.14mol/L的NaCl溶液,可溶于1~2 mol/L的NaCl溶液,RNA则相反,可据此分离二者。

3. 加热条件下

D-核糖+浓盐酸+苔黑酚           绿色  

D-2-脱氧核糖+酸+二苯胺         蓝紫色

二、溶解度

1.核酸的水解

微溶于水,不溶于有机溶剂

□ 核酸分子中的磷酸二酯键可在酸或碱性条件下水解切断。

□ DNA和RNA对酸或碱的耐受程度有很大差别。室温条件下,DNA在碱中变性,但不水解,RNA水解。

□ 在细胞内核酸分子受DNA酶作用。

三、酸性化合物

1.两性解离,但酸性强

□ 核酸含酸性的磷酸基团,又含弱碱性的碱基,为两性电解质,可发生两性解离;

□ 核酸相当于多元酸,pH大于4时,呈阴离子状态;

□ 等电点:都小于3.5,且UMP ﹤ GMP ﹤ AMP ﹤ CMP

四、高分子性质

 沉淀行为——加盐(中和电荷);乙醇

 粘度  DNA>RNA

  超离心沉降

 凝胶过滤

 分子大小单位:分子量(道尔顿,D)、碱基对数目(bp)

 离心沉降常数(S):生物大分子在单位离心力场里的沉降速度为恒定值。

五、紫外吸收

□ 在核酸分子中嘌呤碱和嘧啶碱都含有共轭双键体系,在260 nm有吸收;

□ 可以作为区别蛋白质和对核酸及其组份定性和定量测定的依据,进行核酸纯度鉴定,也可作为核酸变性和复性的指标。



                OD260的应用


1.DNA或RNA的定量

OD260=1.0相当于

50μg/ml双链DNA

40μg/ml单链DNA(或RNA)

20μg/ml寡核苷酸


六、DNA的变性、复性与分子杂交

(一)DNA的变性

1. 概念

2. 变性条件

3. 变性的特征

1. 概念


2.DNA的变性的条件

 

能够引起核酸变性的因素有:

(1)温度升高;

(2)酸碱度改变、 pH(>11.3或<5.0);

(3)有机溶剂如甲醛和尿素、甲酰胺等;

(4)低离子强度。

3.DNA变性的特征

 

□ 变性核酸将失去其部分或全部的生物活性。

□ 变性改变了DNA的二级结构。核酸的变性并不涉及磷酸二酯键的断裂,所以它的一级结构(碱基顺序)保持不变。

□ DNA的变性过程是突变性的,它在很窄的温度区间内完成。 DNA解链温度

□ 紫外吸收值明显增加,即增色效应。

□ 粘度降低,沉降系数增加。


影响Tm值的因素 

① DNA的均一性:均一DNA(如病毒)的Tm值范围较小;

② DNA中G-C对的含量 :分子中G和C的含量越高,越不易变性,Tm值越高。可通过经验公式计算:

   (G+C)%=(Tm-69.3) ×2.44

③ 盐离子强度:Tm值随溶液盐浓度增加而增大;

一般DNA的Tm值在70-85C之间, Tm值较低,易变性,不易保存

增色效应与减色效应

天然DNA分子在热变性条件下,双螺旋结构破坏,碱基暴露,在紫外光260nm波长处的吸收度明显增加,此现象称为增色效应。

变性DNA分子复性形成双螺旋结构时其紫外吸收降低的现象称为减色效应。

(二)DNA的复性

1.变性DNA在适当的条件下,两条彼此分开的单链可以重新缔合成为双螺旋结构,其物理性质和生物活性随之恢复,这一过程称为复性;

2.对于热变性的DNA,在缓慢冷却的条件下可重新结合恢复双螺旋结构,称为退火。

3.DNA复性后,一系列性质将得到恢复,但是生物活性一般只能得到部分的恢复。


DNA的复性条件

 

1.将热变性的DNA骤然冷却至低温时,DNA不可能复性。即淬火。

2.将变性的DNA缓慢冷却时,可以复性。

退火温度=Tm-25℃

3.分子量越大复性越难。浓度越大,复性越容易。此外,DNA的复性需要一定的盐浓度,也与它本身的组成和结构有关。

影响复性的因素 


(三)分子杂交

1.在变性的DNA溶液中加入外源DNA单链分子或RNA单链分子(与原DNA具有同源性),去掉变性条件后复性形成双螺旋结构的过程。

2.这样形成的新分子称为杂交DNA分子。

3.利用核酸杂交可检测特定的核苷酸片段或研究同源性等。


分子杂交的种类

△ Southern Blot:DNA-DNA杂交

△ Northern Blot:DNA-RNA杂交

△ Western Blot:抗原-抗体进行杂交

△ 原位杂交:活体组织上进行杂交,显出荧光