目录

  • 1 绪论
    • 1.1 生物化学的定义与研究内容
    • 1.2 生物化学的内容组成
    • 1.3 生物化学的形成与发展
    • 1.4 生物化学与专业的关系
  • 2 蛋白质的化学
    • 2.1 概述
    • 2.2 蛋白质总论
    • 2.3 氨基酸的分类与物理性质
    • 2.4 蛋白质的构件——氨基酸
    • 2.5 肽
    • 2.6 蛋白质的结构
    • 2.7 蛋白质的结构与功能
    • 2.8 蛋白质的分离纯化
    • 2.9 蛋白质的性质与分离纯化
    • 2.10 蛋白质的鉴定与分析
    • 2.11 肌红蛋白与血红蛋白
    • 2.12 测验1氨基酸组成、结构与性质
    • 2.13 测验2 肽、蛋白质的结构和功能
    • 2.14 测验3 蛋白质的理化性质
  • 3 核酸化学
    • 3.1 DNA是遗传物质的发现
    • 3.2 概述
    • 3.3 核酸分子的化学组成
    • 3.4 DNA的结构
    • 3.5 tRNA结构
    • 3.6 核酸的分子结构
    • 3.7 核酸的理化性质
    • 3.8 核酸的变性、复性与分子杂交
    • 3.9 核酸的分离、纯化与鉴定
    • 3.10 训练4 核酸的组成、结构基础练习
    • 3.11 训练5 核酸的性质基础练习
  • 4 糖类化学
    • 4.1 第五次拓展训练
  • 5 脂类化学
    • 5.1 脂类概述
    • 5.2 单脂
    • 5.3 复脂
    • 5.4 类脂
    • 5.5 第六次拓展训练
  • 6 酶与维生素
    • 6.1 概述
    • 6.2 酶的分类及命名
    • 6.3 酶的结构
    • 6.4 酶的结构与功能
    • 6.5 酶的作用机理
    • 6.6 酶的高效性机制
    • 6.7 诱导契合学说
    • 6.8 酶促反应动力学
    • 6.9 训练6 酶概述部分基础练习
    • 6.10 训练7 酶组成、结构、作用机理基础练习
    • 6.11 训练8 酶促动力学基础练习
  • 7 生物氧化
    • 7.1 概述
    • 7.2 生物氧化的特点
    • 7.3 生物氧化体系——呼吸链
    • 7.4 ATP的生成方式
    • 7.5 化学渗透假说
    • 7.6 氧化磷酸化的抑制
    • 7.7 线粒体的穿梭系统
    • 7.8 训练9 生物氧化的特点、呼吸链的组成及功能基础练习
    • 7.9 训练10 ATP的生成方式、机理及抑制基础练习
  • 8 糖代谢
    • 8.1 糖原的降解
    • 8.2 葡萄糖的分解代谢
    • 8.3 糖酵解
    • 8.4 糖有氧氧化
    • 8.5 三羧酸循环
    • 8.6 糖有氧氧化的能量计算
    • 8.7 磷酸戊糖途径
    • 8.8 糖异生
    • 8.9 寡糖和多糖的合成
    • 8.10 葡萄糖的合解代谢
    • 8.11 糖代谢的调节
    • 8.12 训练11 多糖降解、糖酵解途径基础练习
    • 8.13 训练12 糖的有氧氧化、磷酸戊糖途径基础练习
    • 8.14 训练13 糖异生途径、糖的合成基础练习
  • 9 脂类代谢
    • 9.1 脂类的贮存、动员与运输
    • 9.2 脂肪的代谢
    • 9.3 脂肪酸氧化
    • 9.4 脂肪酸氧化的能量计算
    • 9.5 酮体的生成与利用
    • 9.6 乙醛酸循环
    • 9.7 脂肪的合成
    • 9.8 磷脂的代谢
    • 9.9 胆固醇代谢
    • 9.10 吉林省教学名师常桂英教授教学视频
    • 9.11 训练14脂肪降解、脂肪酸分解代谢
    • 9.12 训练15 脂肪酸的合成、磷脂、胆固醇的代谢基础练习
  • 10 蛋白质与氨基酸代谢
    • 10.1 氨基酸的一般代谢
    • 10.2 氨的代谢——鸟氨酸循环
    • 10.3 鸟氨酸循环
    • 10.4 氨的转运
    • 10.5 氨基酸的化学反应
    • 10.6 芳香族氨基酸的代谢
    • 10.7 氨基酸的合成代谢
    • 10.8 个别氨基酸的分解代谢
    • 10.9 嘧啶的分解代谢
    • 10.10 训练16蛋白质降解、氨基酸分解代谢基础练习
    • 10.11 训练17 鸟氨酸循环、个别氨基酸分解代谢基础练习
  • 11 核苷酸代谢
    • 11.1 概述
    • 11.2 核苷酸的降解
    • 11.3 嘌呤的分解代谢
    • 11.4 嘌呤核苷酸的合成代谢
    • 11.5 嘌呤核苷酸的从头合成
    • 11.6 嘧啶核糖核苷酸的生物合成
    • 11.7 核苷酸合成的抗代谢物
    • 11.8 脱氧核糖核苷酸和胸苷酸的生成
    • 11.9 训练18 核苷酸的分解、合成代谢基础练习
  • 12 DNA生物合成——复制
    • 12.1 概述
    • 12.2 DNA复制的过程
    • 12.3 半保留复制的发现
    • 12.4 DNA的半保留复制
    • 12.5 参与DNA的复制的酶与蛋白质
    • 12.6 原核生物(大肠杆菌)DNA的复制过程
    • 12.7 真核生物DNA复制
    • 12.8 逆转录 (RNA指导的DNA合成)
    • 12.9 基因突变和DNA的损伤修复
    • 12.10 PCR反应过程
    • 12.11 端粒的复制
    • 12.12 DNA的损伤修复
    • 12.13 训练19 参与DNA合成的酶及过程基础练习
    • 12.14 训练20 逆转录、DNA损伤和修复基础练习
  • 13 RNA 生物合成——转录
    • 13.1 RNA聚合酶
    • 13.2 原核生物的转录
    • 13.3 启动子
    • 13.4 转录的过程
    • 13.5 转录终止机制
    • 13.6 转录后加工
    • 13.7 真核生物的转录
    • 13.8 真核生物的转录后修饰
    • 13.9 训练21 RNA生物合成基础练习
  • 14 蛋白质的生物合成——翻译
    • 14.1 概述
    • 14.2 蛋白质合成体系的组分
    • 14.3 遗传密码的特性
    • 14.4 rRNA与蛋白质合成场所
    • 14.5 蛋白质生物合成过程(原核生物)
    • 14.6 翻译的过程
    • 14.7 肽链合成后的加工
    • 14.8 代谢调节
    • 14.9 蛋白质生物合成的干扰与抑制
    • 14.10 训练22 蛋白质生物合成基础练习
    • 14.11 第二十五次训练  蛋白质合成过程
  • 15 基因表达的调控
    • 15.1 乳糖操纵子
    • 15.2 色氨酸操纵子
    • 15.3 第二十六次训练  物质代谢调节及基因表达调节
  • 16 综合训练
    • 16.1 第二十七次训练  综合训练一
    • 16.2 第二十八次训练  综合训练二
    • 16.3 第二十九次训练  综合训练三
    • 16.4 第三十次训练    综合训练四
  • 17 实验视频
    • 17.1 胰蛋白酶比活力的测定
    • 17.2 离心机的使用
    • 17.3 移液管的使用
    • 17.4 紫外分光光度计的使用
    • 17.5 血清γ球蛋白的分离纯化与鉴定
    • 17.6 血清白蛋白的分离纯化与鉴定
核酸的分子结构


一、DNA的结构

一、DNA的结构

一级结构:  DNA核苷酸链中脱氧核苷酸的组成和排列顺序。

二级结构:DNA的两条多聚链间通过氢键形成的双螺旋结构。

三级结构:DNA双链进一步折叠卷曲形成的构象。

(一)DNA的一级结构(primary structure)

1.由dAMP、dGMP、 dCMP、 dTMP核苷酸单体组成;

2.核苷酸的连接方式:3,5磷酸二酯键;

3.核酸的基本结构形式:

信息量:4n

末端: 5 端、 3端

多核苷酸链的方向: 5ˊ端→3ˊ端(由左至右)

4.多核苷酸链表示方法:结构式、线条式、文字缩写.

(二)DNA的二级结构

Watson 和 Crick 于1953年提出了DNA 双螺旋结构模型,说明了DNA 的二级结构。(即B型DNA)

1.提出DNA双螺旋结构模型的根据 

(1)Chargaff定则  (1950s,E. Chargaff发现)

① DNA碱基组成符合: A=T;G=C; A+G=T+C。

② 不对称比率:A+T/G+C;

物种不同,DNA碱基组成不同;

物种亲缘愈接近,碱基组成也愈接近,该比

率越相近似。

③ 具有种的特异性,没有器官和组织的特异性,年龄、营养状况

环境的改变不影响DNA的碱基组成。


(2)x-光衍射分析 

20世纪40年代Astbury   1952年M.Wilkins 


(3)double helix model


2.DNA双螺旋结构的要点


(1)DNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称DNA单链)组成。两条链沿着同一根轴平行盘绕,形成右手双螺旋结构。螺旋中的两条链方向相反,即其中一条链的方向为5′端→3′端,而另一条链的方向为3′端→5′端。


(2)嘌呤和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧。碱基环平面与螺旋轴垂直,糖基环平面与碱基环平面成90°角。

(3)螺旋横截面的直径约为2nm,每条链相邻两个碱基平面之间的距离为0.34nm,每10个核苷酸形成一个螺旋,其螺矩(即螺旋旋转一圈的高度)为3.4 nm。

(4)维持两条DNA链相互结合的力是链间碱基对形成的氢键。碱基结合具有严格的配对规律:A与T结合,G与C结合,这种配对关系,称为碱基互补。A和T之间形成两个氢键,G与C之间形成三个氢键。在DNA分子中,嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。



(5)螺旋表面形成大沟(major groove)及小沟(minor groove),彼此相间排列。小沟较浅;大沟较深,是蛋白质识别DNA碱基序列的基础。

(6)氢键维持双链横向稳定性,碱基堆积力维持双链纵向稳定性。

3. DNA的双螺旋结构稳定因素

▲ 氢键 

▲ 碱基堆积力 

▲ 磷酸基上负电荷被胞内组蛋白或正离子中和

▲ 碱基处于疏水环境中

4. DNA的双螺旋结构的意义

该模型揭示了DNA作为遗传物质的稳定性特征,最有价值的是确认了碱基配对原则,这是DNA复制、转录和反转录的分子基础,亦是遗传信息传递和表达的分子基础。该模型的提出是上个世纪生命科学的重大突破之一,它奠定了生物化学和分子生物学乃至整个生命科学飞速发展的基石。

5.DNA双螺旋构象的类型


(三)DNA的三级结构---超螺旋



真核生物染色质的结构单位——核小体

■ 真核生物中DNA双螺旋沿着组蛋白八聚体核心的短轴绕1.75圈,形成左手超螺旋,称核小体。

■ 染色质的基本结构单位是核小体。

■ 串珠状结构进一步卷曲形成螺线管,后者再进一步卷曲形成超螺旋管,形成染色单体。

核小体(nucleosome): 由DNA和组蛋白构成。


二、RNA的分子结构

(一)RNA的特点及分类

结构特点:

1. 碱基组成:A、G、C、U (A-U/G-C);

2. 稀有碱基较多,稳定性较差,易水解;

3. 多为单链结构,少数局部形成螺旋(发夹结构);

4. 分子较小。

分类:

1. 信使RNA(mRNA)

2. 转运RNA (tRNA)

3. 核糖体RNA (rRNA)

1.信使RNA (Messenger RNA)

(1)约占总RNA的3%-5%,含量最少,种类最多。

(2)成熟mRNA不含内含子,hnRNA含有。

(3)mRNA从DNA转录遗传信息,并作为蛋白质合成的模板,决定蛋白质的氨基酸顺序。


* 真核生物mRNA成熟过程

* 真核生物mRNA的结构特点


帽子结构和多聚A尾的功能


2.转运RNA(Transfer RNA)

(1)约占总RNA的10-15%,分子最小。

(2)它在蛋白质生物合成中起翻译mRNA信息,并将相应的氨基酸转运到核糖体,参与蛋白质体的合成。

(3)已知每一个氨基酸至少有一个相应的tRNA。

tRNA的结构与功能

* tRNA的一级结构特点

● 含 10~20% 稀有碱基;

 3´末端为 - CCA-OH;

 5´末端大多数为G;

 由70~90个核苷酸组成;


3.核糖体RNA(Ribosome RNA) 

(1)约占全部RNA的80%,含量最多。

(2)与多种蛋白质结合成核糖体,后者是合成蛋白质的场所。

核糖体——蛋白质和核酸的复合体


核糖体的组成


(二)RNA的一级结构

RNA分子中各核苷之间的连接方式(3´-5´磷酸二酯键)和排列顺序叫做RNA的一级结构

(三)RNA的二级结构

* tRNA的二级结构

——三叶草形

氨基酸臂

DHU环

反密码环

额外环

TΨC环

① 氨基酸臂(接受茎) :七对碱基,末端为—CCA ,能接受活化的氨基酸;

② 二氢尿嘧啶环(DHU环 或D环):8—12个核苷酸,因具两个二氢尿嘧啶而得名。与分类有关,通过二氢尿嘧啶臂(D茎)与其它相连;

③ 反密码环 :7个核苷酸,中部为反密码子,与mRNA密码子配对。通过反密码茎与其它相连;

④ 额外环 :3—18个核苷酸,是tRNA分类的依据。

⑤ TψC环 :7个核苷酸,可能与在核糖体处落下有关。通过TψC臂与其它相连。

(四)RNA的三级结构