add symmetry via Platon
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目录
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1 第一单元
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1.1 版权声明
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1.2 晶体衍射实验实践指导
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1.3 晶体学介绍
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1.4 衍射实验室培训方案
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1.5 晶体衍射实验的总体步骤
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1.6 晶体图片
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2 晶体上样操作
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2.1 仪器开关机步骤
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2.2 液氮cryo开关操作
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2.3 晶体样品装样过程
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2.4 显微镜下的晶体挑选
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2.5 衍射实验-晶体上样及对心介绍
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2.6 晶体对心过程
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2.7 Synergy仪器的开关门及上样
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2.8 FRX仪器的开关门及上样
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2.9 大分子晶体预先冷冻上样方法
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2.10 测角头事故案例
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2.11 封管测试方法
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3 数据收集软件操作
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3.1 晶体衍射实验软件操作
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3.2 CrysAlispro-小分子数据采集
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3.3 CrysAlispro-大分子晶体粗筛设置
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3.4 高温实验操作步骤
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3.5 晶体衍射数据质量判定
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3.6 twin indexing
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3.7 append data collection
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4 结构解析和精修
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4.1 结构解析介绍
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4.2 分析软件安装
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4.3 结构解析操作
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4.4 checkcif report -olex2
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4.5 checkcif report - server
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4.6 CIF文件生成晶体学数据表
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4.7 晶体数据处理并生成MTZ
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4.8 晶面指标化-drag mode
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4.9 晶面指标化-snap mode
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4.10 去除精修的限制命令
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4.11 如何查看分析结果-cif文档？
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4.12 对称轴上的无序精修-part -1
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4.13 EXYZ和EADP-OLEX2
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4.14 phasing simulated annealing and refinement
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4.15 position disorder modeling - two methods
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4.16 phasing - shelxD
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4.17 EXYZ-disorder modeling
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4.18 Fragment DB application case
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4.19 import model using OLEX2
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4.20 add symmetry via Platon
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4.21 part-1 Na3HCO3CO3
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4.22 phasing by MR（分子置换）with PHENIX
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4.23 checkcif using platon
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5 粉末衍射技术
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5.1 粉末衍射样品制备
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5.2 简易的粉末衍射零点校正方法
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5.3 粉末衍射实验 - 步长0.02?
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5.4 结晶度
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5.5 实操-寻峰与报告
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5.6 溶剂体积计算软件
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5.7 择优取向对峰强和峰位置的影响
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5.8 样品研磨过筛与不研磨样品测试差异
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6 蛋白结构精修
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6.1 tutorial结构精修
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7 晶体结构缺陷分析技术
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7.1 案例1-弥散散射-对分布函数
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7.2 案例2-diffuse scattering
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7.3 run discus
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7.4 read and plot
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7.5 RMC fitting to pdf date
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8 checkcif回复及其修正
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8.1 VRF回复方法
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8.2 412_ALERT_2_B and 417_Alert_2_A and 416
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8.3 PLAT342_ALERT_3_B回复
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8.4 THETM01_ALERT_3_A
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8.5 PLAT029_ALERT_3_A
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8.6 PLAT910_ALERT_3_B
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8.7 PLAT035_ALERT_1_B
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8.8 Short H--H contacts
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8.9 196_alert_1_B no temp
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8.10 312_alert_2_A
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8.11 415_alert_2_A
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8.12 430_alert_2_A
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8.13 O70_Alert_1_A
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8.14 934_ALERT_3_A
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8.15 316_ALERT_2_A
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8.16 413_414_ALERT_2_A
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8.17 O35_ALERT_1_B
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8.18 196_ALERT_1_B
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8.19 112_ALERT_2_B
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8.20 417/410_short d-h and h-h
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9 审稿人意见回复案例
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9.1 实际案例1-限制与对称
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9.2 实际案例2- atom list out of sequence
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10 虚拟仿真实验
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10.1 虚拟仿真实验体验介绍
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10.2 虚拟仿真实验体验项目
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11 FAQ常见问题
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11.1 如何查看晶体结构？
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11.2 TwinRot不正常工作
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11.3 twin检测
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11.4 OLEX多个溶剂分子的输入格式
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11.5 如何生成二维衍射图片
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11.6 如何判断预实验结果的好坏？
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11.7 什么样的数据才能用于结构解析？
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11.8 如何查看晶体在测试过程中是否移动？
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11.9 衍射点拖尾能用来解析结构吗？
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11.10 label atom and bond
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11.11 Z and Z'
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11.12 Laue group 和 点群
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11.13 flack参数的意义
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11.14 0.63的占位可以限制在0.5吗？
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11.15 P21 或者 P21C
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11.16 rms sigma / rms deviation
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11.17 how to use CCDC
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11.18 change asymmetric unit
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11.19 change asymmetric unit - H2O
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11.20 data collection and refinement for paper writing
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11.21 变换晶胞参数取向和空间群
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11.22 查看无序分子占位信息
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11.23 crystalline boundary 晶界
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11.24 移除无序部分，保存为有序结构-1
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11.25 移除无序部分，保存为有序结构-2
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11.26 C2/c or I2/a? which one should be choosed?
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11.27 Conventional and reduced cell
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11.28 twinning introduction
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11.29 same.sadi mismatch
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11.30 TITL error
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11.31 COD结构数据库应用-查找AlF3
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11.32 Rint for HKLF4 and HKLF5
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11.33 optimal crystal size and shape
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11.34 修改datablock的名称
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11.35 cif生成粉末衍射图和比对
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12 结晶实验操作
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12.1 结晶实验-结晶机器人操作
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12.2 使用常见误操作
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12.3 维护
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12.4 考核方法
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13 JAN UVEX-P 操作
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13.1 UVEX - P 操作步骤
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13.2 问题1 - 紫外过曝使用
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14 液体配比仪操作
