免疫系统主要由淋巴器官、淋巴组织和免疫细胞构成。免疫细胞包括淋巴细胞、巨噬细胞、抗原呈递细胞等，淋巴细胞是构成免疫系统的主要细胞。淋巴组织以网状组织为支架，网眼中含有大量淋巴细胞、浆细胞和巨噬细胞，淋巴组织分为弥散淋巴组织和淋巴小结2种。弥散淋巴组织中常见毛细血管后微静脉，是淋巴细胞从血液进入淋巴组织的重要通道。淋巴小结小结中央染色浅，称生发中心。淋巴器官分为中枢淋巴器官和周围淋巴器官。中枢淋巴器官包括胸腺和骨髓，是淋巴干细胞分化发育成T或B细胞的场所；发育较早，不断向周围淋巴器官输送淋巴细胞，并决定周围淋巴器官的发育程度。周围淋巴器官包括淋巴结、脾和扁桃体等，接受中枢淋巴器官输入的淋巴细胞，是进行免疫应答的主要场所。

胸腺大部分位于胸腔上纵隔前份，分为不对称的左右叶。胸腺表面覆有薄层结缔组织构成的被膜，被膜的结缔组织伸入胸腺实质，把胸腺实质分隔成许多分隔不全的小叶；小叶周边为皮质，深部为髓质。胸腺皮质部阻挡血液中的大分子物质进入胸腺的结构，称血-胸腺屏障。胸腺是培育和选择T细胞的重要器官。

淋巴结位于淋巴回流的通路上，呈豆形，在淋巴结凸面有数条输入淋巴管通入，淋巴结门部有1~2条输出淋巴管穿出。淋巴结的表面为薄层致密结缔组织构成的被膜，被膜伸入实质形成小梁，淋巴结实质分周边部的皮质和中央部的髓质。皮质位于被膜下方，分为浅层皮质、副皮质区和皮质淋巴窦3部分；髓质位于淋巴结深部，由髓索及其间的髓窦组成。淋巴结的功能为滤过淋巴液和参与免疫应答。

脾为人体最大的周围淋巴器官，位于左季肋部，恰与第9~11肋相对；脾分膈、脏两面，前、后两端和上、下两缘；上缘较锐，前部有2~3个切迹，称脾切迹。脾的表面覆有较厚的被膜，被膜伸入脾内形成许多分支的小梁，脾实质分白髓、边缘区和红髓。白髓为密集的淋巴组织，由动脉周围淋巴鞘和淋巴小结构成。边缘区位于白髓和红髓交界处，是脾捕获抗原，识别抗原和诱发免疫应答的重要部位。红髓位于白髓和边缘区的周围、被膜下方及小梁的周围，由脾索及脾血窦组成。脾的功能为滤血、造血和参与免疫应答。