AlfaFold将机器深度学习方法应用于蛋白质的结构预测，在2020年国际蛋白质结构预测竞赛（CASP 14）中，AlphaFold 2 在 CASP 的系列测试中获得 92.4 分，在最具挑战的自由建模蛋白质测试中获得 87 分，远高于其它算法，在精度上甚至超过了实验测定的晶体结构。算法的改进也大幅度地加快了蛋白质结构预测的速度。在2021年7月的Nature杂志上，98.5%的人类蛋白质结构被AlphaFold2预测出来了，并免费在网上公布。这代表了AI在生物学及医学领域应用的突破，或许会改变传统以实验测定为主的蛋白质结构研究方法，体现了计算生物学的重要发展。