MOE （Molecular Operating Environment）分子操作环境，是由加拿大化学计算集团公司Chemical Computing Group Inc.开发的针对制药和生命科学的综合软件系统。它是一个综合的应用环境和技术开发平台，集可视化、模拟和应用开发于一体。且在统一的操作环境下能通过分子模拟、蛋白质结构分析、小分子数据处理以及蛋白质与小分子对接研究等应用工具全方位支持药物设计。 下面几节内容中，我们将通过一些具体的实例，介绍该软件在药物，尤其是生物药物领域的应用。