目录

  • 1 第一单元
    • 1.1 晶体衍射实验实践指导
    • 1.2 晶体学介绍
  • 2 晶体上样操作
    • 2.1 衍射实验-晶体上样及对心介绍
    • 2.2 晶体样品装样过程
    • 2.3 显微镜下的晶体挑选
    • 2.4 Synergy仪器的开关门及上样
    • 2.5 FRX仪器的开关门及上样
    • 2.6 大分子晶体预先冷冻上样方法
    • 2.7 晶体对心过程
  • 3 数据收集软件操作
    • 3.1 CrysAlispro-小分子数据采集
    • 3.2 CrysAlispro-大分子晶体粗筛设置
    • 3.3 晶体衍射实验仪器操作
    • 3.4 晶体衍射数据质量判定
  • 4 结构解析和精修
    • 4.1 结构解析介绍
    • 4.2 分析软件安装
    • 4.3 结构解析操作
    • 4.4 checkcif report生成
    • 4.5 CIF文件生成晶体学数据表
    • 4.6 蛋白晶体数据处理
    • 4.7 晶面指标化
    • 4.8 移除无序部分,保存为有序结构
    • 4.9 去除精修的限制命令
  • 5 checkcif回复及其修正
    • 5.1 412_ALERT_2_B修正
    • 5.2 PLAT342_ALERT_3_B回复
    • 5.3 THETM01_ALERT_3_A
    • 5.4 PLAT029_ALERT_3_A
    • 5.5 PLAT910_ALERT_3_B
    • 5.6 VRF回复方法
  • 6 审稿人意见回复案例
    • 6.1 实际案例1-限制与对称
  • 7 虚拟仿真实验
    • 7.1 虚拟仿真实验体验介绍
    • 7.2 虚拟仿真实验体验项目
  • 8 FAQ常见问题
    • 8.1 如何查看晶体结构?
    • 8.2 TwinRot不正常工作
    • 8.3 twin检测
    • 8.4 OLEX多个溶剂分子的输入格式
    • 8.5 如何生成二维衍射图片
    • 8.6 如何判断预实验结果的好坏?
  • 9 结晶实验操作
    • 9.1 结晶实验-结晶机器人操作
      • 9.1.1 结晶机器人操作
      • 9.1.2 结晶机器人关机步骤
      • 9.1.3 LCP设置不当与96板运行
      • 9.1.4 仪器未按照流程关机事故
  • 10 JAN UVEX-P 操作
    • 10.1 UVEX - P 操作步骤
CrysAlispro-大分子晶体粗筛设置

蛋白质晶体学的数据收集

LN2 操作方法:

开启 点击Cyro àrestart à set à set temperature 100K à cool

关闭 点击Cyro --> set --> end --> Ok

第一步,如果软件处于小分子模式,请改为蛋白质模式

 点击CRYSALISSM(Small)→CRYSALIS PX(protein)→OK

 右下角的logo允许用户在蛋白质模式和小分子模式之间切换。一旦PX复选框被选中,默认设置就会显示在SM\PX界面中。


第二步,晶体对心

按下START/STOP然后选择New experiment,点击mount sample

第三步,样品筛选


A. 在Compound/SampleDescription部分,可以在复合框中输入样品名称,并在注释中输入相关描述

B. 在Control部分,使用Mount sample来打开摄像机并到样品安装位置。Videosnap抓拍样本的一张图片,并将其保存为jpg文件。

C. Screening Experiment部分:选择Two scans选项和Reliable resolution limit and exp. timeprediction选项。采用默认设置: exposure time (20), resolution(2.0), scan width(0.5).

D. 对于典型的筛选实验,在曝光时间小于60秒的情况下,这些选项都不需要。

E. 其他格式中的导出部分,允许用户使用其他外部程序读取图像。这里的选项是XDS,Mosflm和Denze (HKL 2000)。

 筛选实验优化后,按Start。数据将被收集和晶体衍射信息将显示在Crystal Screening tab。