结构解析介绍
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什么是晶体结构解析?
结构解析就是通过晶体衍射方法找到离子,原子或分子在晶体中的相对位置。通过晶体解析,能得到的基本的结构信息如下表,其中包括空间群(space group),晶胞参数 (unit cell),原子坐标(coordinates),原子占位(occupancy),温度因子参数(atomic displacement parameters)。晶体结构解析完毕后,这些信息会自动保存到cif文件。
单晶衍射晶体结构解析的步骤?
小分子:单晶样品培养 --> 晶体衍射实验(第二部分) --> 晶体衍射数据处理并得到ins和hkl文件(第三部分) --> 相角解析(常用软件shelx软件,可视化软件OLEX2)--> 结构精修 --> 结构确证与发表
大分子:单晶样品培养 --> 晶体衍射实验(第二部分) --> 晶体衍射数据处理并得到MTZ文件 --> 相角解析(常用软件ccp4, Phenix,COOT软件)--> 结构精修 --> 结构确证与发表
结构精修结果的判断?
小分子:结构合理;R1< 5%;修正和解释了A类和B类错误;

