目录

  • 1 第一单元
    • 1.1 晶体衍射实验实践指导
    • 1.2 晶体学介绍
  • 2 晶体上样操作
    • 2.1 衍射实验-晶体上样及对心介绍
    • 2.2 晶体样品装样过程
    • 2.3 显微镜下的晶体挑选
    • 2.4 Synergy仪器的开关门及上样
    • 2.5 FRX仪器的开关门及上样
    • 2.6 大分子晶体预先冷冻上样方法
    • 2.7 晶体对心过程
  • 3 数据收集软件操作
    • 3.1 CrysAlispro-小分子数据采集
    • 3.2 CrysAlispro-大分子晶体粗筛设置
    • 3.3 晶体衍射实验仪器操作
    • 3.4 晶体衍射数据质量判定
  • 4 结构解析和精修
    • 4.1 结构解析介绍
    • 4.2 分析软件安装
    • 4.3 结构解析操作
    • 4.4 checkcif report生成
    • 4.5 CIF文件生成晶体学数据表
    • 4.6 蛋白晶体数据处理
    • 4.7 晶面指标化
    • 4.8 移除无序部分,保存为有序结构
    • 4.9 去除精修的限制命令
  • 5 checkcif回复及其修正
    • 5.1 412_ALERT_2_B修正
    • 5.2 PLAT342_ALERT_3_B回复
    • 5.3 THETM01_ALERT_3_A
    • 5.4 PLAT029_ALERT_3_A
    • 5.5 PLAT910_ALERT_3_B
    • 5.6 VRF回复方法
  • 6 审稿人意见回复案例
    • 6.1 实际案例1-限制与对称
  • 7 虚拟仿真实验
    • 7.1 虚拟仿真实验体验介绍
    • 7.2 虚拟仿真实验体验项目
  • 8 FAQ常见问题
    • 8.1 如何查看晶体结构?
    • 8.2 TwinRot不正常工作
    • 8.3 twin检测
    • 8.4 OLEX多个溶剂分子的输入格式
    • 8.5 如何生成二维衍射图片
    • 8.6 如何判断预实验结果的好坏?
  • 9 结晶实验操作
    • 9.1 结晶实验-结晶机器人操作
      • 9.1.1 结晶机器人操作
      • 9.1.2 结晶机器人关机步骤
      • 9.1.3 LCP设置不当与96板运行
      • 9.1.4 仪器未按照流程关机事故
  • 10 JAN UVEX-P 操作
    • 10.1 UVEX - P 操作步骤
CrysAlispro-小分子数据采集

             数据采集分为以下步骤
                                                    

1 设定温度(确保开启空气压缩机)
开启低温:点击cyro;点击restart;点击set;设定温度100K;点击cool;点击Ok;
关闭低温:点击cyro;点击set;点击end;点击Ok。

2 运行测试
1 点击exit/screen; 或者screen;或者start new;
晶体质量良好的判断标准:指标化率 > 80%;衍射强度:Moderately diffracting sample,Well diffracting sample; 

2 Pre-experiment测试
命名;点击pre-experiment;

3 Experiment stratedy设定
Resolution: 0.80;Laue group:默认;
Friedel pair...(手性化合物不要勾选);Detector distance:35(小分子);
Strategy mode:default;
Time prediction based on data to 0.8 Ang:exp time设定在I/sigma >15;
Scan width:默认。
点击calculate new strategy;和点击Update completeness。
点击start named experiment,设定晶体颜色,大小,形状等参数。
点击cancel。

4 点击autochem/Movie/Cyro
如果是过夜收集,点击Auto shut down cryo unit,确保数据收集后完毕关闭液氮。


5 点击start experiment开始实验