生物化学
武林芝
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1 蛋白质
1.1 学习目标
1.2 氨基酸
1.2.1 氨基酸的结构通式
1.2.2 氨基酸的分类
1.2.3 氨基酸的理化性质
1.3 肽
1.3.1 肽的结构
1.3.2 生物活性肽的功能
1.3.3 生物活性肽的来源
1.3.4 生物活性肽的应用
1.4 蛋白质的结构
1.4.1 蛋白质的一级结构
1.4.2 蛋白质的空间结构
1.5 蛋白质结构与功能的关系
1.6 蛋白质的性质
1.7 蛋白质的分离
1.8 蛋白质测序
1.9 知识清单
2 核酸
2.1 知识目标
2.2 核酸的组成
2.3 核酸的一级结构
2.4 DNA的二级结构
2.5 DNA的高级结构
2.6 DNA和基因组
2.7 RNA的结构和功能
2.8 核酸的性质
2.9 核酸的序列测定
2.10 知识清单
3 糖类
3.1 学习目标
3.2 糖概述
3.3 单糖
3.4 寡糖
3.5 多糖
3.6 糖复合物
3.7 知识清单
4 脂质
4.1 知识目标
4.2 脂类概述
4.3 三酰甘油
4.4 脂肪酸
4.5 甘油磷脂
4.6 鞘脂
4.7 类固醇
4.8 生物膜
4.9 知识清单
5 酶
5.1 学习目标
5.2 酶的概念和特点
5.3 酶的化学本质
5.4 酶的组成
5.5 酶的命名与分类
5.6 酶的专一性
5.7 酶的作用机制
5.8 酶促反应动力学
5.9 影响酶促反应的因素
5.10 酶活性的调节
5.11 酶的研究方法
5.12 知识清单
6 新陈代谢总论与生物氧化
6.1 知识目标
6.2 新陈代谢总论
6.3 生物氧化
6.4 知识清单
7 糖代谢
7.1 酶促降解
7.2 糖的分解代谢
7.3 糖的合成代谢
8 脂质代谢
8.1 酶促水解
8.2 分解代谢
8.3 合成代谢
8.4 其他物质代谢
9 蛋白质的降解与氨基酸代谢
9.1 酶促水解
9.2 氨基酸的分解代谢
9.3 氨基酸的合成代谢
10 核苷酸代谢
10.1 核苷酸分解代谢
10.2 核苷酸合成代谢
10.3 核苷酸生物合成的调节
10.4 核苷酸合成的抗代谢物
11 物质代谢的调节控制
11.1 物质代谢的相互联系
11.2 分子水平的调节
11.3 细胞水平的调节
11.4 多细胞整体水平的调节
12 DNA的生物合成
13 RNA的生物合成
14 蛋白质的生物合成
15 每行填写一个目录,目录的层级用两个空格区分,只支持三级目录
16 比如:
17 蛋白质的结构和功能
17.1 前置问题及学习目标
17.2 蛋白质的分子组成
17.2.1 氨基酸是蛋白质的基本组成单位
17.2.1.1 氨基酸的基本结构
17.2.1.2 氨基酸的分类
17.2.1.3 氨基酸的理化性质
17.2.2 蛋白质是氨基酸通过肽键相连而成的生物大分子
17.3 蛋白质的分子结构
17.3.1 氨基酸的排列顺序是蛋白质的一级结构
17.3.2 多肽链主链的局部空间构象是蛋白质的二级结构
17.3.2.1 肽单元
17.3.2.2 主要二级结构形式
17.3.2.3 超二级结构-模体
17.3.3 侧链R基团的相互作用形成蛋白质的三级结构
17.3.4 亚基缔合成分子—蛋白质的四级结构
17.4 蛋白质结构与功能的关系
17.4.1 蛋白质一级结构是空间构象和功能的基础
17.4.2 蛋白质的功能依赖其特定的空间构象
17.5 蛋白质的理化性质及应用
17.5.1 蛋白质具有和氨基酸相同的和自身特殊的理化性质
17.5.2 利用蛋白质的性质分离纯化蛋白质
17.6 必交作业
18 核酸的结构与功能
18.1 前置问题及学习目标
18.2 核酸的化学组成和一级结构
18.2.1 核酸分类及基本组成单位—核苷酸
18.2.2 核酸的一级结构是核苷酸的排列顺序
18.3 DNA的结构和功能
18.3.1 DNA的二级结构是双螺旋结构
18.3.2 DNA的三级结构是超螺旋结构
18.4 RNA的结构与功能
18.4.1 mRNA从DNA转录遗传信息指导蛋白质合成
18.4.2 tRNA是蛋白质合成的接合器分子
18.4.3 rRNA参与蛋白质的合成场所-核糖体的组成
18.4.4 细胞内其它小分子RNA参与体内重要过程
18.5 核酸的理化性质
18.5.1 核酸的酸性和紫外吸收特性
18.5.2 核酸的变性和分子杂交技术
18.6 必交作业
19 酶与辅酶
19.1 前置问题及学习目标
19.2 酶的分子结构
19.2.1 酶的分子组成
19.2.2 酶的空间结构
19.3 酶的分类与命名
19.4 酶的反应特点与机制
19.4.1 酶促反应的特点
19.4.2 酶促反应的机制
19.5 酶促反应的动力学
19.5.1 底物浓度对反应速度的影响
19.5.2 酶浓度对反应速度的影响
19.5.3 温度对反应速度的影响
19.5.4 pH对反应速度的影响
19.5.5 抑制剂对反应速度的影响
19.5.6 激活剂对酶促反应速度的影响
19.6 酶活性的调节
19.6.1 酶原与酶原激活
19.6.2 酶的变构调节
19.6.3 酶的共价修饰调节
19.6.4 细胞外基质
19.6.5 酶含量的调节
19.6.6 同工酶
19.7 必交作业
20 糖复合物
20.1 前置问题及学习目标
20.2 糖蛋白
20.2.1 糖蛋白的结构
20.2.2 糖蛋白的功能
20.3 蛋白聚糖
20.3.1 蛋白聚糖的结构
20.3.2 蛋白聚糖的功能
20.4 糖脂
21 糖代谢
21.1 前置问题及学习目标
21.2 代谢概述
21.3 糖代谢
21.3.1 糖代谢概述
21.3.1.1 糖的生理功能
21.3.1.2 糖的消化
21.3.1.3 糖的吸收
21.3.1.4 糖的转运
21.3.2 糖的无氧酵解
21.3.2.1 糖酵解途径
21.3.2.2 乳酸生成
21.3.2.3 糖酵解能量生成
21.3.2.4 糖酵解的调节
21.3.2.5 糖酵解的生理意义和临床联系
21.3.2.6 如何学习代谢?
21.3.3 糖的有氧氧化
21.3.3.1 反应过程-丙酮酸氧化
21.3.3.2 反应过程-柠檬酸循环1
21.3.3.3 柠檬酸循环2--三羧酸循环总结
21.3.3.4 柠檬酸循环3--有氧氧化的调节
21.3.3.5 糖有氧氧化的生理意义
21.3.3.6 糖酵解与有氧氧化的协调
21.3.4 磷酸戊糖途径
21.3.4.1 磷酸戊糖途径反应过程
21.3.4.2 磷酸戊糖途径生理意义
21.3.5 糖醛酸代谢
21.3.6 糖异生
21.3.6.1 糖异生代谢途径
21.3.6.2 糖异生原料
21.3.6.3 糖异生调节
21.3.6.4 糖异生生理意义
21.3.7 糖原合成与分解
21.3.7.1 反应过程、分支酶作用及合成起始
21.3.7.2 反应过程及脱枝酶
21.3.7.3 变构、化学修饰和临床的相关性
21.3.8 血糖与血糖调节
21.4 必交作业
22 生物氧化
22.1 前置问题及学习目标
22.2 生物氧化的概述
22.3 线粒体氧化体系
22.3.1 呼吸链
22.3.1.1 呼吸链的组成成分
22.3.1.2 呼吸链的排列次序
22.3.2 氧化磷酸化
22.3.2.1 氧化磷酸化的偶联数目与偶联部位
22.3.2.2 氧化磷酸化的偶联机制
22.3.2.3 ATP合酶
22.3.2.4 氧化磷酸化的影响因素
22.3.3 ATP的转运与储存
22.3.4 胞液NADH的氧化
22.4 其它氧化体系
22.5 必交作业
23 脂类代谢
23.1 前置问题及学习目标
23.2 脂类概述
23.2.1 脂类的一般概念
23.2.2 脂类的分布与生理功能
23.2.3 脂类的消化和吸收
23.3 脂肪的分解代谢
23.3.1 脂肪动员与激素敏感脂肪酶
23.3.2 脂肪酸的氧化分解
23.3.3 酮体的生成与利用
23.3.4 甘油的氧化分解
23.4 脂肪的合成代谢
23.4.1 脂肪酸的合成部位与原料
23.4.2 丙二酰CoA的合成
23.4.3 软脂酸的合成
23.4.4 脂肪酸链的延长
23.4.5 不饱和脂肪酸的合成
23.4.6 多不饱和脂肪酸的衍生物
23.4.7 3-磷酸甘油的合成
23.4.8 脂肪的合成
23.5 磷脂的代谢
23.5.1 磷脂的分类、结构与功能
23.5.2 甘油磷脂的代谢
23.5.3 鞘磷脂的代谢
23.6 胆固醇代谢
23.6.1 胆固醇的合成
23.6.2 胆固醇在体内的转变与排泄
23.7 血浆脂蛋白代谢
23.7.1 血脂
23.7.2 血浆脂蛋白的分类、组成及结构
23.7.3 血浆脂蛋白代谢
23.8 必交作业
24 氨基酸代谢
24.1 前置问题及学习目标
24.2 氨基酸的生理功能与营养价值
24.3 体内氨基酸的来源
24.3.1 蛋白质的消化、吸收和腐败
24.3.2 体内氨基酸的降解
24.3.3 非必需氨基酸的合成
24.3.4 氨基酸代谢池
24.4 氨基酸的分解代谢
24.4.1 氨基酸的脱氨基作用
24.4.1.1 转氨基作用
24.4.1.2 氧化脱氨
24.4.1.3 联合脱氨
24.4.1.4 其他脱氨方式
24.4.2 氨的代谢
24.4.2.1 氨的来源与去路
24.4.2.2 氨的转运
24.4.2.3 尿素的合成
24.4.3 α-酮酸的代谢
24.5 氨基酸的分类代谢
24.5.1 氨基酸的脱羧基作用
24.5.2 一碳单位的代谢
24.5.3 含硫氨基酸的代谢
24.5.4 肌酸的代谢
24.5.5 芳香族氨基酸的代谢
24.5.6 支链氨基酸的代谢
24.6 必交作业
25 核苷酸代谢
25.1 前置问题及学习目标
25.2 嘌呤核苷酸代谢
25.2.1 嘌呤核苷酸的合成代谢
25.2.1.1 嘌呤核苷酸的从头合成途径
25.2.1.2 嘌呤核苷酸的补救合成途径
25.2.2 嘌呤核苷酸的分解代谢
25.3 嘧啶核苷酸代谢
25.4 脱氧核糖核苷酸的合成
25.4.1 核苷酸的抗代谢物
26 DNA的生物合成
26.1 前置问题及学习目标
26.2 DNA复制—导言
26.3 DNA复制原则
26.3.1 半保留复制
26.3.2 双向复制
26.3.3 半不连续复制
26.4 DNA复制过程所需酶
26.4.1 解螺旋酶
26.4.2 拓扑异构酶
26.4.3 单链DNA结合蛋白
26.4.4 引物酶
26.4.5 聚合酶
26.4.6 连接酶
26.5 DNA复制过程起始,延长和终止
26.6 逆转录
26.7 DNA损伤与修复--损伤
26.8 DNA损伤与修复--修复
26.9 必交作业
27 RNA的生物合成
27.1 前置问题及学习目标
27.2 概述
27.3 RNA 转录体系
27.3.1 RNA聚合酶
27.3.2 DNA 转录模板
27.3.3 真核和原核的启动子特点和功能
27.3.4 终止子和增强子
27.4 RNA 生物合成过程
27.4.1 原核生物RNA转录
27.4.2 真核生物RNA转录
27.5 RNA 转录后加工
27.5.1 原核细胞RNA转录后加工
27.5.2 真核细胞RNA转录后加工
27.5.2.1 rRNA和tRNA的转录后加工
27.5.2.2 mRNA的转录后加工
27.6 RNA 复制
27.7 必交作业
28 蛋白质的翻译
28.1 前置问题及学习目标
28.2 概述
28.3 蛋白质生物合成体系
28.3.1 遗传密码载体-mRNA
28.3.2 氨基酸载体—tRNA/adaptor
28.3.3 蛋白质合成场所: 核糖体(Ribosomes)
28.4 蛋白质生物合成过程
28.4.1 氨基酸的活化
28.4.2 翻译的起始
28.4.3 翻译的延长
28.4.4 翻译的终止
28.4.5 总结蛋白质生物合成过程
28.4.6 真核生物蛋白质生物合成的主要区别
28.4.7 总结参与蛋白质翻译合成的因子
28.4.8 理解遗传信息传递在科研的应用
28.5 蛋白质生物合成后加工(PTM)
28.5.1 一级结构加工
28.5.2 高级结构加工
28.5.3 蛋白质折叠异常所导致的疾病
28.5.4 蛋白质的靶向输送(protein targeting)
28.6 蛋白质翻译的抑制
28.6.1 抗生素类
28.6.2 干扰蛋白质生物合成的活性物质
28.7 必交作业
29 蛋白质的结构和功能
29.1 前置问题及学习目标
29.2 蛋白质的分子组成
29.2.1 氨基酸是蛋白质的基本组成单位
29.2.1.1 氨基酸的基本结构
29.2.1.2 氨基酸的分类
29.2.1.3 氨基酸的理化性质
29.2.2 蛋白质是氨基酸通过肽键相连而成的生物大分子
29.3 蛋白质的分子结构
29.3.1 氨基酸的排列顺序是蛋白质的一级结构
29.3.2 多肽链主链的局部空间构象是蛋白质的二级结构
29.3.2.1 肽单元
29.3.2.2 主要二级结构形式
29.3.2.3 超二级结构-模体
29.3.3 侧链R基团的相互作用形成蛋白质的三级结构
29.3.4 亚基缔合成分子—蛋白质的四级结构
29.4 蛋白质结构与功能的关系
29.4.1 蛋白质一级结构是空间构象和功能的基础
29.4.2 蛋白质的功能依赖其特定的空间构象
29.5 蛋白质的理化性质及应用
29.5.1 蛋白质具有和氨基酸相同的和自身特殊的理化性质
29.5.2 利用蛋白质的性质分离纯化蛋白质
29.6 必交作业
30 核酸的结构与功能
30.1 前置问题及学习目标
30.2 核酸的化学组成和一级结构
30.2.1 核酸分类及基本组成单位—核苷酸
30.2.2 核酸的一级结构是核苷酸的排列顺序
30.3 DNA的结构和功能
30.3.1 DNA的二级结构是双螺旋结构
30.3.2 DNA的三级结构是超螺旋结构
30.4 RNA的结构与功能
30.4.1 mRNA从DNA转录遗传信息指导蛋白质合成
30.4.2 tRNA是蛋白质合成的接合器分子
30.4.3 rRNA参与蛋白质的合成场所-核糖体的组成
30.4.4 细胞内其它小分子RNA参与体内重要过程
30.5 核酸的理化性质
30.5.1 核酸的酸性和紫外吸收特性
30.5.2 核酸的变性和分子杂交技术
30.6 必交作业
31 酶与辅酶
31.1 前置问题及学习目标
31.2 酶的分子结构
31.2.1 酶的分子组成
31.2.2 酶的空间结构
31.3 酶的分类与命名
31.4 酶的反应特点与机制
31.4.1 酶促反应的特点
31.4.2 酶促反应的机制
31.5 酶促反应的动力学
31.5.1 底物浓度对反应速度的影响
31.5.2 酶浓度对反应速度的影响
31.5.3 温度对反应速度的影响
31.5.4 pH对反应速度的影响
31.5.5 抑制剂对反应速度的影响
31.5.6 激活剂对酶促反应速度的影响
31.6 酶活性的调节
31.6.1 酶原与酶原激活
31.6.2 酶的变构调节
31.6.3 酶的共价修饰调节
31.6.4 细胞外基质
31.6.5 酶含量的调节
31.6.6 同工酶
31.7 必交作业
32 糖复合物
32.1 前置问题及学习目标
32.2 糖蛋白
32.2.1 糖蛋白的结构
32.2.2 糖蛋白的功能
32.3 蛋白聚糖
32.3.1 蛋白聚糖的结构
32.3.2 蛋白聚糖的功能
32.4 糖脂
33 糖代谢
33.1 前置问题及学习目标
33.2 代谢概述
33.3 糖代谢
33.3.1 糖代谢概述
33.3.1.1 糖的生理功能
33.3.1.2 糖的消化
33.3.1.3 糖的吸收
33.3.1.4 糖的转运
33.3.2 糖的无氧酵解
33.3.2.1 糖酵解途径
33.3.2.2 乳酸生成
33.3.2.3 糖酵解能量生成
33.3.2.4 糖酵解的调节
33.3.2.5 糖酵解的生理意义和临床联系
33.3.2.6 如何学习代谢?
33.3.3 糖的有氧氧化
33.3.3.1 反应过程-丙酮酸氧化
33.3.3.2 反应过程-柠檬酸循环1
33.3.3.3 柠檬酸循环2--三羧酸循环总结
33.3.3.4 柠檬酸循环3--有氧氧化的调节
33.3.3.5 糖有氧氧化的生理意义
33.3.3.6 糖酵解与有氧氧化的协调
33.3.4 磷酸戊糖途径
33.3.4.1 磷酸戊糖途径反应过程
33.3.4.2 磷酸戊糖途径生理意义
33.3.5 糖醛酸代谢
33.3.6 糖异生
33.3.6.1 糖异生代谢途径
33.3.6.2 糖异生原料
33.3.6.3 糖异生调节
33.3.6.4 糖异生生理意义
33.3.7 糖原合成与分解
33.3.7.1 反应过程、分支酶作用及合成起始
33.3.7.2 反应过程及脱枝酶
33.3.7.3 变构、化学修饰和临床的相关性
33.3.8 血糖与血糖调节
33.4 必交作业
34 生物氧化
34.1 前置问题及学习目标
34.2 生物氧化的概述
34.3 线粒体氧化体系
34.3.1 呼吸链
34.3.1.1 呼吸链的组成成分
34.3.1.2 呼吸链的排列次序
34.3.2 氧化磷酸化
34.3.2.1 氧化磷酸化的偶联数目与偶联部位
34.3.2.2 氧化磷酸化的偶联机制
34.3.2.3 ATP合酶
34.3.2.4 氧化磷酸化的影响因素
34.3.3 ATP的转运与储存
34.3.4 胞液NADH的氧化
34.4 其它氧化体系
34.5 必交作业
35 脂类代谢
35.1 前置问题及学习目标
35.2 脂类概述
35.2.1 脂类的一般概念
35.2.2 脂类的分布与生理功能
35.2.3 脂类的消化和吸收
35.3 脂肪的分解代谢
35.3.1 脂肪动员与激素敏感脂肪酶
35.3.2 脂肪酸的氧化分解
35.3.3 酮体的生成与利用
35.3.4 甘油的氧化分解
35.4 脂肪的合成代谢
35.4.1 脂肪酸的合成部位与原料
35.4.2 丙二酰CoA的合成
35.4.3 软脂酸的合成
35.4.4 脂肪酸链的延长
35.4.5 不饱和脂肪酸的合成
35.4.6 多不饱和脂肪酸的衍生物
35.4.7 3-磷酸甘油的合成
35.4.8 脂肪的合成
35.5 磷脂的代谢
35.5.1 磷脂的分类、结构与功能
35.5.2 甘油磷脂的代谢
35.5.3 鞘磷脂的代谢
35.6 胆固醇代谢
35.6.1 胆固醇的合成
35.6.2 胆固醇在体内的转变与排泄
35.7 血浆脂蛋白代谢
35.7.1 血脂
35.7.2 血浆脂蛋白的分类、组成及结构
35.7.3 血浆脂蛋白代谢
35.8 必交作业
36 氨基酸代谢
36.1 前置问题及学习目标
36.2 氨基酸的生理功能与营养价值
36.3 体内氨基酸的来源
36.3.1 蛋白质的消化、吸收和腐败
36.3.2 体内氨基酸的降解
36.3.3 非必需氨基酸的合成
36.3.4 氨基酸代谢池
36.4 氨基酸的分解代谢
36.4.1 氨基酸的脱氨基作用
36.4.1.1 转氨基作用
36.4.1.2 氧化脱氨
36.4.1.3 联合脱氨
36.4.1.4 其他脱氨方式
36.4.2 氨的代谢
36.4.2.1 氨的来源与去路
36.4.2.2 氨的转运
36.4.2.3 尿素的合成
36.4.3 α-酮酸的代谢
36.5 氨基酸的分类代谢
36.5.1 氨基酸的脱羧基作用
36.5.2 一碳单位的代谢
36.5.3 含硫氨基酸的代谢
36.5.4 肌酸的代谢
36.5.5 芳香族氨基酸的代谢
36.5.6 支链氨基酸的代谢
36.6 必交作业
37 核苷酸代谢
37.1 前置问题及学习目标
37.2 嘌呤核苷酸代谢
37.2.1 嘌呤核苷酸的合成代谢
37.2.1.1 嘌呤核苷酸的从头合成途径
37.2.1.2 嘌呤核苷酸的补救合成途径
37.2.2 嘌呤核苷酸的分解代谢
37.3 嘧啶核苷酸代谢
37.4 脱氧核糖核苷酸的合成
37.4.1 核苷酸的抗代谢物
38 DNA的生物合成
38.1 前置问题及学习目标
38.2 DNA复制—导言
38.3 DNA复制原则
38.3.1 半保留复制
38.3.2 双向复制
38.3.3 半不连续复制
38.4 DNA复制过程所需酶
38.4.1 解螺旋酶
38.4.2 拓扑异构酶
38.4.3 单链DNA结合蛋白
38.4.4 引物酶
38.4.5 聚合酶
38.4.6 连接酶
38.5 DNA复制过程起始,延长和终止
38.6 逆转录
38.7 DNA损伤与修复--损伤
38.8 DNA损伤与修复--修复
38.9 必交作业
39 RNA的生物合成
39.1 前置问题及学习目标
39.2 概述
39.3 RNA 转录体系
39.3.1 RNA聚合酶
39.3.2 DNA 转录模板
39.3.3 真核和原核的启动子特点和功能
39.3.4 终止子和增强子
39.4 RNA 生物合成过程
39.4.1 原核生物RNA转录
39.4.2 真核生物RNA转录
39.5 RNA 转录后加工
39.5.1 原核细胞RNA转录后加工
39.5.2 真核细胞RNA转录后加工
39.5.2.1 rRNA和tRNA的转录后加工
39.5.2.2 mRNA的转录后加工
39.6 RNA 复制
39.7 必交作业
40 蛋白质的翻译
40.1 前置问题及学习目标
40.2 概述
40.3 蛋白质生物合成体系
40.3.1 遗传密码载体-mRNA
40.3.2 氨基酸载体—tRNA/adaptor
40.3.3 蛋白质合成场所: 核糖体(Ribosomes)
40.4 蛋白质生物合成过程
40.4.1 氨基酸的活化
40.4.2 翻译的起始
40.4.3 翻译的延长
40.4.4 翻译的终止
40.4.5 总结蛋白质生物合成过程
40.4.6 真核生物蛋白质生物合成的主要区别
40.4.7 总结参与蛋白质翻译合成的因子
40.4.8 理解遗传信息传递在科研的应用
40.5 蛋白质生物合成后加工(PTM)
40.5.1 一级结构加工
40.5.2 高级结构加工
40.5.3 蛋白质折叠异常所导致的疾病
40.5.4 蛋白质的靶向输送(protein targeting)
40.6 蛋白质翻译的抑制
40.6.1 抗生素类
40.6.2 干扰蛋白质生物合成的活性物质
40.7 必交作业
鞘脂
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