实验动物应选择进化程度与人类相近，在遗传和净化控制下与实验所需相匹配的，生理解剖特点符合实验要求，实验结果可以推论到人的实验动物。动物实验不宜采用处于特殊生理状态（如妊娠、哺乳等）动物。动物的健康状况直接影响实验结果，应选择健康动物用于实验研究。急性实验可选用微生物控制级别较低但无疾病的实验动物，慢性试验应选用级别较高的实验动物。在实验研究中如无特殊要求，一般宜采用雌雄各半，以避免由性别差异造成的误差。

在选择动物时，同批实验的动物年龄尽可能一致，体重应大致相近。一般选择成年动物：小鼠 18~22g，大鼠180~220g，豚鼠 350~650g，家兔2~3kg。慢性实验应选用未成年实验动物：小鼠 15~18g，大鼠80~100g，豚鼠 150~180g，家兔 1.5~1.8kg。

实验动物的种属不同，对于同一刺激物或致病因素的反应也不相同。例如，动物对致敏物质的反应程度的强弱大致为：豚鼠>家兔>狗>小白鼠>猫>蛙；吗啡对大鼠、兔、狗的作用是抑制性的，对小鼠猫的作用是兴奋性的，等等。因此，实验机能学教学采用何种动物，是决定实验研究成功与否的关键因素之一。

    转基因动物的应用。通过实验手段将新的遗传物质导入到动物胚细胞中，并能稳定遗传，由此获得的动物称为转基因动物。遗传的基本物质是DNA。基因则是位于染色体上有遗传效应的DNA片段，对于储存在生物全套染色体中的全部遗传信息称为基因组。由于不同种类、不同个体的生物基因组成是不同的，因此对动物个体来说，非自身的基因成分属于外源基因，若将外源基因整合或导入动物染色体基因中，则此外源基因就被称为转基因(transgene)（即转移来的基因），这种动物称为转基因动物（transgenicanimals）。转基因动物表达系统包括外源基因、表达载体和受体细胞等，基因组的转移可通过细胞核移植和动物克隆技术，也可利用合成生物学进行人工合成与设计基因、全基因乃至基因组转基因技术。