植物表观遗传学

张庆祝、解莉楠、吴娟

目录

  • 1 Non-Mendelian Inheritances in Plant
    • 1.1 Non-Mendelian Inheritances in Plant
  • 2 Plant Transposable Elements
    • 2.1 Discovery of plant transposable elements
    • 2.2 Classification of plant transposable element
  • 3 Plants as Models for Epigenetic Research
    • 3.1 Similarity of plant epigenetics with mammals
    • 3.2 Unique aspects of plant development relevant to epigenetic regulation
    • 3.3 Arabidopsis as model plant for epigenetic analysis
    • 3.4 Genetic attributes of plants as model systems for epigenetics
  • 4 Techniques in Plant Epigenetic Analysis
    • 4.1 DNA methylation
    • 4.2 Histone modifications
  • 5 Components of Chromatin in Plant
    • 5.1 Plant DNA methylation
    • 5.2 Plant histone modifications and variants
    • 5.3 Plant nucleosome-organization
  • 6 RNA-Directed DNA Methylation
    • 6.1 RNA polymerases
    • 6.2 siRNA production
    • 6.3 DNA methylation of target loci
    • 6.4 Evolutionary conservation of RdDM
  • 7 Active DNA Demethylation in Plant
    • 7.1 DNA demethylation in plant
    • 7.2 Crosstalk between DNA methylation and demethylation in plant
  • 8 Maintenance of DNA Methylation in Plants
    • 8.1 Maintenance of CG methylation
    • 8.2 Maintenance of CHG methylation
    • 8.3 Maintenance of CHH methylation
  • 9 Plant Histone Modifications and Variants
    • 9.1 Enzymes involved in plant histone modifications
    • 9.2 Polycomb proteins and interacting components
    • 9.3 Maintenance of histone methylations
  • 10 Post Transcriptional Gene Silencing in Plant
    • 10.1 miRNA biogenesis and actions
    • 10.2 Crosstalk between PTS and PTGS
  • 11 Plant Epialleles
    • 11.1 Effects of TE on gene expression
    • 11.2 Spontaneous epimutation and epialleles
  • 12 Epigenetic Regulation in Plant
    • 12.1 Plant epigenetics and development
    • 12.2 Vernalization and plant epigenetics
    • 12.3 Epigenetic regulation in plant abiotic and biotic stress responses
    • 12.4 Plant transgenerational epigenetics
  • 13 Plant Epigenetics and Crop Improvements
    • 13.1 Natural and induced epigenetic variation
    • 13.2 Epigenome engineering for crop improvement
    • 13.3 Plant epigenetics and tree ecology
  • 14 拓展内容
    • 14.1 作业1
    • 14.2 作业2
    • 14.3 新建课程目录
Maintenance of CHG methylation

Maintenance of CHG methylation 

Cotents

  • CMT3 recognize hemimethylated CHG

  • Both BAH and Chromo are Important for CMT3

  • Chromo and BAH Bound with H3K9me2

  • SUVH4/5/6 control both of mCHH and H3K9me2

  • KYP/SUVH recognize mCHG

  • The 5mC is flipped out and inserted into SRA domain

  • Self-reinforcement of CMT3 and SUVHs in CHG methylation

课件

授课视频（主讲教师：张庆祝）