高通量测序原理及技术应用

黄世臣

目录

  • 1 新建课程目录
    • 1.1 一代DNA测序原理
    • 1.2 二代DNA测序原理
    • 1.3 二代测序illumina边合成边测序（选看动画）
    • 1.4 三代DNA测序原理（纳米孔）
    • 1.5 一代、二代、三代测序比较
    • 1.6 第一、第二、第三代测序原理（PPT演示，无音频）
  • 2 新建课程目录
    • 2.1 16s测序与生物信息分析
    • 2.2 微生物与人类（选看）
    • 2.3 微生物物种分类（选看）
    • 2.4 微生物鉴定方法比较（选看）
    • 2.5 16Ｓ物种分类
    • 2.6 16Ｓ样品提取与测序
    • 2.7 几种16Ｓ测序技术的比较
    • 2.8 16Ｓ测序分析和常用流程
    • 2.9 16Ｓ测序分析常用数据库
    • 2.10 18Ｓ和ＩＴＳ数据分析
    • 2.11 ＨＭＰ计划与ＥＭＰ计划
    • 2.12 记念Carl Woese（选看）
    • 2.13 测试数据
    • 2.14 16S测序数据质控
    • 2.15 16Ｓ测序数据处理
    • 2.16 qiime base的安装
    • 2.17 qiime full安装
    • 2.18 qiime虚拟机安装
    • 2.19 qiime的使用
    • 2.20 mapping文件
    • 2.21 序列连接
    • 2.22 切分数据1
    • 2.23 切分数据2
    • 2.24 去除嵌合体
    • 2.25 ＯＴＵ物种分类
    • 2.26 ＯＴＵ聚类
    • 2.27 选择代表性ＯＵＴ序列
    • 2.28 参考序列比对
  • 3 切分数据2
  • 4 第一单元
    • 4.1 第一课时illumina测序原理
    • 4.2 高通量测序原理发展历史（美吉生物）
    • 4.3 第二课时
      • 4.3.1 基因的表达视频
        • 4.3.1.1 基因的转录、翻译、突变及PCR
          • 4.3.1.1.1 DNA对蛋白质完整过程
            • 4.3.1.1.1.1 转录、翻译过程中文版
              • 4.3.1.1.1.1.1 光合作用3D原版
              • 4.3.1.1.1.1.2 高通量基因分型（上）
      • 4.3.2 高通量测序领域常用名词解释
  • 5 第二单元
    • 5.1 宏基因组测序后数据处理主流操作方法
    • 5.2 微生物多样性数据上传至NCBI的SRA过程
    • 5.3 Venn图绘制
    • 5.4 物种分布柱状图绘制
    • 5.5 RDA分析
    • 5.6 PCA-PCoA-NMDS分析
参考序列比对