本例子介绍了同源模建、分子对接等方法在酶的定向设计上的应用。野生型的胺酰t-RNA合成酶识别的是天然氨基酸残基苯丙氨酸，为了使其能识别新底物并催化合成携带非天然氨基酸的tRNA，对酶活性口袋中的关键残基进行了虚拟突变，通过分子对接模拟，评估了不同突变体结合新底物——对乙酰苯丙氨酸的能力，为进一步实验研究奠定了基础。