第二章 第二节 核酸序列数据库
上一节
下一节
第二节PPT： 本节重点介绍核酸序列数据库，要求掌握核酸序列的检索方法，读懂数据记录格式
第二节电子教材：
目录
-
1 第一章 生物信息学概述
-
1.1 视频：引言“生物信息学与药物开发”
-
1.2 视频：人类基因组计划与生物信息学
-
1.3 视频：人类基因组测序的策略
-
1.4 第一章 第一节生物信息学及其发展
-
1.5 第一章 第二节 生物信息学研究领域
-
1.6 第一章 第三节 生物信息学在药学领域的应用
-
1.7 第一章 习题
-
1.8 资料:An explosion of bioinformatics careers
-
-
2 第二章 生物信息学数据库
-
2.1 视频：序列数据检索
-
2.2 视频：蛋白质结构检索
-
2.3 第二章 第一节 数据库的基本概念
-
2.4 第二章 第二节 核酸序列数据库
-
2.5 第二章 第三节 蛋白质序列数据库
-
2.6 第二章 第四节 蛋白质结构数据库
-
2.7 第二章 习题
-
2.8 资料:Database resources of NCBI
-
2.9 资料：DRAMP2.0, an antimicrobial peptide database
-
2.10 资料：Computational resources and tools for AMPs
-
-
3 第三章 序列比对和相似性搜索
-
3.1 视频：本周话题_寻找科学亚当
-
3.2 视频：新冠溯源
-
3.3 视频：序列比对
-
3.4 视频：blast搜索
-
3.5 视频：用mega软件构建进化树
-
3.6 第三章 第一节 概述
-
3.7 第三章 第二节 序列比对算法
-
3.8 第三章 第三节 多重序列比对
-
3.9 第三章 第四节 相似性搜索
-
3.10 第三章 第五节 分子进化研究
-
3.11 第三章 习题
-
3.12 资料：Site-directed mutagenesis
-
3.13 资料：菌种筛选与鉴定
-
-
4 第四章 测序技术的发展
-
4.1 视频：DNA测序发展简介
-
4.2 第四章 第一节 DNA测序简史
-
4.3 第四章 第二节 三代测序原理
-
4.4 第四章 第三节 测序技术的应用
-
4.5 第四章 习题
-
4.6 资料：Identification of a novel candidate gene for hearing loss
-
-
5 第五章 核酸序列分析
-
5.1 视频：蛋白质编码区分析
-
5.2 第五章 第一节 基因结构分析
-
5.3 第五章 第二节 核酸序列电子延伸和电子基因定位
-
5.4 第五章 第三节 新基因的发现及功能预测
-
5.5 第五章 第四节 非编码RNA
-
5.6 第五章 习题
-
5.7 资料：利用基因组数据挖掘发现新抗生素
-
-
6 第六章 蛋白质序列分析
-
6.1 视频：同源模建
-
6.2 第六章 第一节 蛋白质组成及物理性质分析
-
6.3 第六章 第二节 蛋白质二级结构预测
-
6.4 第六章 第三节 特殊结构或结构特征分析
-
6.5 第六章 第四节 蛋白质三级结构预测
-
6.6 第六章 第五节 蛋白质功能预测
-
6.7 第六章 习题
-
6.8 资料：Asp120Asn mutation impairs the catalytic activity of NDM-1
-
-
7 第七章 计算机辅助药物设计
-
7.1 第七章 第一节 概述
-
7.2 第七章 第二节 生物信息学在药靶发现中应用
-
7.3 第七章 第三节 计算机辅助药物设计
-
7.4 第七章 习题
-
7.5 资料：Rational design of aminoacyl-tRNA synthetase
-
7.6 资料：3D Structure Based Model
-
-
8 第八章 新药研发中的生物信息学软件
-
8.1 第八章 生物信息分析软件
-
8.2 第八章 MOE软件及其应用
-
8.3 第八章 Discovery Studio软件及其应用
-
8.4 第八章 习题
-
-
9 第九章 宏基因组学
-
9.1 第九章 第一节 宏基因组概述
-
9.2 第九章 第二节 宏基因组研究案例
-
9.3 第九章习题
-
