第二章 第一节 数据库的基本概念
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第一节PPT: 本节重点介绍数据库的一般概念及其应用
第一节电子教材：
目录
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1 第一章 生物信息学概述
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1.1 视频：引言“生物信息学与药物开发”
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1.2 视频：人类基因组计划与生物信息学
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1.3 视频：人类基因组测序的策略
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1.4 第一章 第一节生物信息学及其发展
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1.5 第一章 第二节 生物信息学研究领域
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1.6 第一章 第三节 生物信息学在药学领域的应用
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1.7 第一章 习题
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1.8 资料:An explosion of bioinformatics careers
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2 第二章 生物信息学数据库
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2.1 视频：序列数据检索
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2.2 视频：蛋白质结构检索
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2.3 第二章 第一节 数据库的基本概念
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2.4 第二章 第二节 核酸序列数据库
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2.5 第二章 第三节 蛋白质序列数据库
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2.6 第二章 第四节 蛋白质结构数据库
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2.7 第二章 习题
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2.8 资料:Database resources of NCBI
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2.9 资料：DRAMP2.0, an antimicrobial peptide database
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2.10 资料：Computational resources and tools for AMPs
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3 第三章 序列比对和相似性搜索
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3.1 视频：本周话题_寻找科学亚当
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3.2 视频：新冠溯源
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3.3 视频：序列比对
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3.4 视频：blast搜索
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3.5 视频：用mega软件构建进化树
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3.6 第三章 第一节 概述
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3.7 第三章 第二节 序列比对算法
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3.8 第三章 第三节 多重序列比对
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3.9 第三章 第四节 相似性搜索
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3.10 第三章 第五节 分子进化研究
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3.11 第三章 习题
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3.12 资料：Site-directed mutagenesis
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3.13 资料：菌种筛选与鉴定
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4 第四章 测序技术的发展
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4.1 视频：DNA测序发展简介
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4.2 第四章 第一节 DNA测序简史
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4.3 第四章 第二节 三代测序原理
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4.4 第四章 第三节 测序技术的应用
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4.5 第四章 习题
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4.6 资料：Identification of a novel candidate gene for hearing loss
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5 第五章 核酸序列分析
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5.1 视频：蛋白质编码区分析
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5.2 第五章 第一节 基因结构分析
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5.3 第五章 第二节 核酸序列电子延伸和电子基因定位
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5.4 第五章 第三节 新基因的发现及功能预测
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5.5 第五章 第四节 非编码RNA
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5.6 第五章 习题
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5.7 资料：利用基因组数据挖掘发现新抗生素
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6 第六章 蛋白质序列分析
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6.1 视频：同源模建
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6.2 第六章 第一节 蛋白质组成及物理性质分析
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6.3 第六章 第二节 蛋白质二级结构预测
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6.4 第六章 第三节 特殊结构或结构特征分析
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6.5 第六章 第四节 蛋白质三级结构预测
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6.6 第六章 第五节 蛋白质功能预测
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6.7 第六章 习题
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6.8 资料：Asp120Asn mutation impairs the catalytic activity of NDM-1
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7 第七章 计算机辅助药物设计
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7.1 第七章 第一节 概述
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7.2 第七章 第二节 生物信息学在药靶发现中应用
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7.3 第七章 第三节 计算机辅助药物设计
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7.4 第七章 习题
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7.5 资料：Rational design of aminoacyl-tRNA synthetase
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7.6 资料：3D Structure Based Model
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8 第八章 新药研发中的生物信息学软件
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8.1 第八章 生物信息分析软件
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8.2 第八章 MOE软件及其应用
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8.3 第八章 Discovery Studio软件及其应用
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8.4 第八章 习题
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9 第九章 宏基因组学
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9.1 第九章 第一节 宏基因组概述
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9.2 第九章 第二节 宏基因组研究案例
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9.3 第九章习题
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