质粒扩增及提纯
实验步骤:
一、准备工作
1. 配液体LB 蛋白胨10g,酵母7.5g,NaCl15g,去离子水定容至1000ml(如果嫌多,根据样品可以按比例减少)
2. 配CaCl2:4.44CaCl2+500ml去离子水
3. 固体培养基:蛋白胨1g,酵母0.5g,NaCl1g,琼脂1g,去离子水定容至100ml
4. 配抗生素(因质粒而异):
Ampicillin:工作液 100μg/ml ,可以先配成 100μg/μl ,用时1:1000
Kanamycin:工作液 25μg/ml ,可以先配成 25μg/μl ,用时1:1000
5. 玻璃珠(或者接种环,有啥用啥)、一套枪头、玻璃培养皿(没有玻璃的,塑料的也行)、离心管、EP管
二、实验步骤
1. 将大肠杆菌加到3-4mlLB培养基中,37℃,150-200r,18-24h;摇过的菌:LB=1:100~1:300,37℃,110r,3h(菌第一次摇过之后浑浊;再摇是为了让菌液处于对数期);
2. 高压固体培养基(灭菌),高压结束冷却到50~60℃(受能忍受就行,温度太低的话,没倒完就凝了)拿出来加入抗生素(按说明书来)倒入培养皿中(在超净台中);
3. 取出摇好活化的菌,取1~1.5ml加入EP管中,4℃,1000r,1min;
4. 用枪头吸出培养基(就是3中的在液体LB中培养的菌),加入200μl预冷过的4℃CaCl2 ,吹打混匀,分装 50μl 一管,制备感受态。
5. 把分装出的 EP 管在冰上静置 20min ,加入质粒 50~100ng,再冰上静置 20min , 热激42℃,90s (务必精准迅速),插回冰上,静置 10min 。(热激是为了打开孔道,让质粒进入,插回冰上是为了关闭孔道,让质粒出不来);
6. 加入无抗生素 LB 每管 500μl , 37℃ 慢摇( 80r ),1h(转进去质粒的细菌表达出抗性蛋白,使细菌耐对应的抗生素);
7. 涂板(玻璃珠滚也行,接种环划也行,不要太多,不然长出来菌太茂盛)。倒置平板, 37℃ 孵箱过夜;
注:同时要有空白对照(只有加了抗生素的培养基)和阴性对照(加了菌种)。如果第二天空白对照和阴性对照长了菌,做不下去了,污染了或者是抗生素不好使。样品没长出来菌,也做不下去了,要么是抗生素加多了,要么是质粒没进去。
8. 取出平皿,观察菌落是否生长,4℃倒置放。将抗生素按说明书浓度加入LB培养基中,3~4ml,挑出菌落(单个菌落,所以7不要太多,不然找不到单个的),连枪头一起打入。37℃ ,剧烈摇 150r 过夜。
9. 质粒小提(小提别把菌液都用了)用的试剂盒,看说明书。然后跑电泳,看质粒质量(琼脂糖凝胶电泳)
10.制备琼脂糖凝胶:选择足够点样口数量的塑料胶槽。(点样孔数量=的样品数量× 2+marke,因为要对比一下提出来的样品和原样品是否是一样的东西),配制 1×TAE/TBE电泳缓冲液放于三角烧瓶中,1g琼脂糖粉+50ml 1×TAE/TBE (1%-2% 均可)
微波炉大概冒泡泡三次就可以。控制火候,避免溢出。冷却至60℃左右后,按EB终结者的说明书加进去。迅速插上合适大小的梳子,以形成点样孔。待凝胶完全凝固后(约半小时以上),小心拔出梳子。将凝胶安放到电泳槽内。
点样:上样前预电泳3-5 min 。核酸样品与上样缓冲液混合后,点样,先加入 Marker 。6×loading的话就可以:1μl loading,3μl去离子水,2μl核酸样品
电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压60-100V,样品由负极(黑色)向正极(红色)方向移动。电压升高,琼脂糖凝胶的有效分离范围降低,当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约 25px处时,停止电泳。
电泳后的凝胶照相:将染色后的凝胶置于紫外灯下进行照相。摄影用的紫外模式。选择合适曝光时间,一般为5秒左右。
大致分子量位置相同,成功。拿着剩下的菌液继续摇菌
11.大提 按说明书走,提完电泳,测OD值。