质粒DNA的提取与纯化
一、仪器和材料
恒温振荡培养箱,高速冷冻离心机,旋涡振荡器,水浴锅,1.5mL离心管,
50mL离心管,不同型号的吸头,微量移液器,微波炉,电泳仪,制胶槽,
电泳槽,梳子,锥形瓶,电子天平,手套,紫外灯,Eppendorf管等。
菌体: E.coli DH5a受体菌,具有Amp'标记的质粒pUC19。
二、实验试剂
LB培养基,抗生素(氨苄青霉素),溶液I,溶液II,溶液II,RNase A母液,TE缓冲液,饱和酚,氯仿/异戊醇混合液,酚/氯仿/异戊醇(PCI)混合液,预冷无水乙醇,TAE 电泳缓冲液(10X),上样缓冲液(6X),琼脂糖,溴化乙锭(EB), DNA相对分子质量标准物DNA Marker λ/HinlII, 5mol/L pH 5. 2的醋酸钠。
三、实验步骤
1.菌体培养
(1) 配制40ml液体LB培养基(加入5%葡萄糖)、100mL固体LB培养基、并准备足量的移液管、200μ 1微量移液器头、1000μL微量移液器头、50mL离心管、1. 5mL离心管,灭菌备用。
(2) 向液体LB培养基移取32μ 1氨苄青得素,混合均匀。
(3) 将提前活化的E. coli DH5a 受体菌,接种于液体LB培养基中。将锥形瓶放入恒温震荡培养箱中,37℃,200r/min培养12-16小时。
2.质粒DNA的提取
(1) 称量50mL离心管重量W1,取30mL菌液于已称重的50mL离心管中,配平后6000r/min离心5min。
(2)弃上清液,向离心管中加入5mL溶液I,涡旋振荡,6000r/min离心5min。
(3) 弃上清并称重W2,求W=W2-W1。
(4) 按照1.0mL/100mg菌体的量加入溶液I,充分涡旋振荡,冰浴5min,再按照2. 0mL/100mg菌体的量加入溶液II,温和颠倒混匀,冰浴2min,然后再按照1. 5mL/100mg菌体的量加入溶液II,温和颠倒混匀,冰浴10min,平衡后12000r/min 离心15min。
(5) 取上清液至新50mL离心管内,记录体积,加入两倍体积的冰乙醇,混匀后在-20℃环境下保存30min。取出后12000r/min离心15min,弃上清,加入5mL 70%乙醇,12000r/min离心5min,弃上清,加入5mL 70%乙醇,12000r/min 离心5min, 弃上清,37℃放置5-10min。
(6) 取出离心管,加入1mLTE溶液得到粗提物,加入RNase A液,使溶液浓度为150 μg/mL,37℃保存60-120min。
3.质粒DNA的纯化:
(1) 取500μl粗提物于1. 5mL离心管中,加入等体积的Tris饱和酚,混匀,12000r/min 离心10min。.
(2) 转移上清液(体积V1)至新管,加入等V的酚:氯仿:异戊醇溶液,混匀,12000r/min 离心5min。
(3) 转移上清(体积V2) 至新管,加入等V2的氯仿:异戊醇溶液,混匀,12000r/min 离心5min。
(4)转移上清液(体积V3)至新管,加入1/10 V3的3M NaAc 溶液(pH5.2),再加入2V4(V4=V3 + 1/10V3)的冰乙醇,混匀,-20℃保存30-60min,取出后12000r/min离心15min。
(5) 弃上清,加入500μL 70%乙醇,10000r/min 离心2min, 再加入500μL 70%乙醇,10000r/min 离心2min,37°C保存5- 10min。
(6)取出离心管,向只离心管中加入25μL TE溶液,溶解沉淀后,转移入另- -只离心管中,再取25μL TE溶液加入第- - 只离心管中,溶解后再移入另一只离心管中,得到50μL 纯化质粒DNA。
4.DNA纯度检测
(1) 取40mL TAE (1X)于300mL锥形瓶中,加入0.4g琼脂糖,放入微波炉内使其熔化,60"C时倒入准备好的制胶槽中。
(2) 取5.0μL纯化DNA加入1.0μL上样缓冲液,混合,进行点样。
(3)点样完毕后,100V,200mA 条件下电泳30min。
(4) 电泳完毕后,进行EB染色,用凝胶成像仪拍照,得到实验结果。