医学生物化学

周会明

目录

  • 1 蛋白质的结构与功能
    • 1.1 蛋白质的分子组成
    • 1.2 蛋白质的一级结构
    • 1.3 蛋白质的空间结构(二、三、四级结构)
    • 1.4 蛋白质结构与功能的关系
    • 1.5 蛋白质的理化性质
  • 2 核酸的结构与功能
    • 2.1 核苷酸分子组成及一级结构
    • 2.2 DNA二级结构
    • 2.3 DNA高级结构及功能
    • 2.4 mRNA、tRNA、rRNA及其他RNA
    • 2.5 核酸的理化性质
    • 2.6 核酶与核酸酶定义及应用
  • 3 维生素
    • 3.1 脂溶性维生素的生理功能及缺乏症
    • 3.2 水溶性维生素的生理功能及缺乏症
  • 4 酶
    • 4.1 酶的分子结构与功能
    • 4.2 酶的工作原理
    • 4.3 酶促反应动力学
    • 4.4 酶的调节
  • 5 生物氧化
    • 5.1 两条呼吸链的组成和排列顺序
    • 5.2 高能化合物和ATP的生成
    • 5.3 氧化磷酸化的机制
    • 5.4 影响氧化磷酸化的因素
    • 5.5 胞质中的NADH的氧化方式
  • 6 糖代谢
    • 6.1 糖的无氧氧化
    • 6.2 糖有氧氧化
    • 6.3 磷酸戊糖途径
    • 6.4 糖原的合成与分解
    • 6.5 糖异生
    • 6.6 血糖及其调节
  • 7 脂质代谢
    • 7.1 脂肪的合成代谢
    • 7.2 脂肪的分解代谢
    • 7.3 酮体的代谢
    • 7.4 胆固醇及磷脂代谢
    • 7.5 血脂的代谢
  • 8 氨基酸代谢
    • 8.1 蛋白质的营养价值
    • 8.2 氨基酸的转氨基作用
    • 8.3 α-酮酸代谢
    • 8.4 氨的来源与转运
    • 8.5 尿素合成-鸟氨酸循环
    • 8.6 特殊氨基酸代谢
  • 9 核苷酸代谢
    • 9.1 核苷酸的合成代谢
    • 9.2 核苷酸的分解代谢
  • 10 非营养物质代谢
    • 10.1 生物转化作用
    • 10.2 胆汁酸的代谢及调节
    • 10.3 血红素的生物合成
    • 10.4 胆色素代谢与黄疸
  • 11 DNA的生物合成
    • 11.1 复制的基本规律
    • 11.2 DNA复制的酶学和拓扑学变化
    • 11.3 DNA复制的过程
  • 12 DNA损伤与损伤修复
    • 12.1 DNA损伤与损伤修复
  • 13 RNA的生物合成
    • 13.1 转录的模板和酶
    • 13.2 原核生物转录过程
    • 13.3 真核生物的转录及转录后修饰
  • 14 蛋白质的生物合成
    • 14.1 蛋白质生物合成的体系
    • 14.2 蛋白质生物合成的过程
    • 14.3 蛋白质合成的干扰和抑制
DNA复制的过程


                                               DNA生物合成过程

目前有关复制的知识主要来自于原核生物实验,所以主要以原核生物来叙述。复制是连续的过程,为方便叙述,可人为地把它分为起始、延长和终止三个阶段。

一、复制的起始:

原核生物已固定的起始点开始,同时向各个方向进行复制,复制时双链分开成双股,新链沿张开的模板成Y字形的复制叉(replication fork)以便作为DNA合成的模板。大肠杆菌的复制起始点由DnaA蛋白识别,DnaB蛋白(解螺旋酶)在DnaC蛋白的协同下,使双链解开足够用于复制的长度,并且逐步置换出DnaA蛋白,形成引发前体复合物。DNA TopoⅡ促进复制叉的不断解链。双链解开后,SSB结合到开放的单链上,起到稳定和保护单链模板的作用,引物酶在入进来,组成引发体(primosome),包括双链DnaBDnaC、解螺旋酶、DnaG即引物酶和DNA起始复合区域)。然后,引物酶5'→3'方向合成RNA引物,其3-OH成为进一步合成DNA的起点。由DNA-pol Ⅲ的β亚基辨认引物,在DNA-pol Ⅲ催化下将第一个脱氧核苷酸加到引物的3-OH上,新DNA链的合成即已开始。

DNA的生物合成(复制)

二、DNA链的延长

DNA-pol Ⅲ催化下自引物的3-OH开始,沿5'→3'方向逐个地加入脱氧核苷酸,使DNA链得以延长。DNA聚合酶以3'→5'方向模板链为模板时,随着复制叉移动方向,可以连续合成前导链(leading strand);以5'→3'方向模板链为模板合成的互补链也是沿着5'→3'方向延伸,但与复制叉的前进方向相反,只能倒着合成冈崎片段(Okaziki fragment),合成冈崎片段时,当DNA链延长到下一个引物前方时,在RNA酶和DNA-polⅠ的作用下,切除引物,并继续延长DNA链,填满切除引物后形成的空隙(gap),最后由DNA连接酶通过生成磷酸二酯键将两个片段连接起来,封闭缺口(nick)。

三、复制的终止

复制的终止与DNA分子的形状有关。对线性DNA,当复制叉到达分子末端时,复制即终止。一般说来,DNA链复制的终止不需要特定的信号。对于环状DNA分子,两个复制叉或在一个特定部位相遇,即一个复制叉在此停止,“等待”另一个移动较慢或需移动较长距离的复制叉,这意味着有一个特异的终止信号。

环状DNA分子的复制方式:

多数原核生物DNA,比如细菌染色体DNA、大肠杆菌的质粒、某些噬菌体基因组、双链DNA病毒基因组以及真核生物的线粒体DNA都为共价闭合环状的DNA分子。

真核生物DNA复制特点除了上述几项之外,还有如下几点:①真核生物DNA复制过程中的引物及冈崎片段的长度均小于原核生物。动物细胞中的引物约为10个核苷酸,冈崎片段约有100~200个核苷酸;②真核细胞在复制时,还同步合成组蛋白,形成核小体;③真核生物染色体在全部复制完成以前,各个起始点上不能再开始下一轮的DNA复制,而在快速生长的原核生物中,在起始点上可以连续开始新的DNA复制。

端粒及端粒酶:真核生物线性染色体的DNA的两个末段具有特殊的端粒结构,对于染色体DNA的稳定十分重要,当DNA复制完成时,两个新合成的子代链的3-OH末段均因RNA引物被水解而产生一段空缺,需要端粒酶的作用才能弥补。

逆转录和其他复制方式

逆转录:是指以RNA为模板,利用宿主细胞中4dNTP为原料,在引物的3'端以5'→3'方向合成与RNA互补的DNA链的过程,此过程与中心法则方向相反,故称为逆转录(reverse transcription)。在逆转录过程中以RNA指导的DNA聚合酶称为逆转录酶(reverse transcriptase)。

实际上,逆转录并非转录,而是一种复制形式,必须有引物存在才能完成。

逆转录酶(reverse transcriplase)是逆转录病毒RNA编码多功能酶:

具有RNA指导的DNA聚合酶活性;

具有RNAH(RNaseH)活性,能特异性水解RNA-DNA杂交体上的RNA

具有DNA指导的DNA聚合酶活性,以逆转录合成的单链DNA为模板合成互补DNA链。

逆转录酶对DNA没有3'→5'外切酶活性,因此它没有校对功能。逆转录的错误率相对较高,这可能是致瘤病毒较快出现新病毒株的一个原因。

逆转录病毒(retroviruses)基因组核酸是RNA,在宿主细胞中须转变成DNA,才能进行基因表达和基因组复制。

逆转录反应过程包括以RNA为模板合成DNA,杂化双链上RNA水解,以及再以单链DNA为模板合成双链DNA三步,逆转录现象的发现,加深了人们对中心法则的认识,括宽了RNA病毒致癌、致病的研究。

在基因工程操作上,还可用逆转录酶制备cDNA

逆转录方式: