DNA生物合成过程
目前有关复制的知识主要来自于原核生物实验,所以主要以原核生物来叙述。复制是连续的过程,为方便叙述,可人为地把它分为起始、延长和终止三个阶段。
一、复制的起始:
原核生物已固定的起始点开始,同时向各个方向进行复制,复制时双链分开成双股,新链沿张开的模板成Y字形的复制叉(replication fork)以便作为DNA合成的模板。大肠杆菌的复制起始点由DnaA蛋白识别,DnaB蛋白(解螺旋酶)在DnaC蛋白的协同下,使双链解开足够用于复制的长度,并且逐步置换出DnaA蛋白,形成引发前体复合物。DNA TopoⅡ促进复制叉的不断解链。双链解开后,SSB结合到开放的单链上,起到稳定和保护单链模板的作用,引物酶在入进来,组成引发体(primosome),包括双链DnaB、DnaC、解螺旋酶、DnaG即引物酶和DNA起始复合区域)。然后,引物酶5'→3'方向合成RNA引物,其3'-OH成为进一步合成DNA的起点。由DNA-pol Ⅲ的β亚基辨认引物,在DNA-pol Ⅲ催化下将第一个脱氧核苷酸加到引物的3'-OH上,新DNA链的合成即已开始。

DNA的生物合成(复制)
二、DNA链的延长
在DNA-pol Ⅲ催化下自引物的3'-OH开始,沿5'→3'方向逐个地加入脱氧核苷酸,使DNA链得以延长。DNA聚合酶以3'→5'方向模板链为模板时,随着复制叉移动方向,可以连续合成前导链(leading strand);以5'→3'方向模板链为模板合成的互补链也是沿着5'→3'方向延伸,但与复制叉的前进方向相反,只能倒着合成冈崎片段(Okaziki fragment),合成冈崎片段时,当DNA链延长到下一个引物前方时,在RNA酶和DNA-polⅠ的作用下,切除引物,并继续延长DNA链,填满切除引物后形成的空隙(gap),最后由DNA连接酶通过生成磷酸二酯键将两个片段连接起来,封闭缺口(nick)。
三、复制的终止
复制的终止与DNA分子的形状有关。对线性DNA,当复制叉到达分子末端时,复制即终止。一般说来,DNA链复制的终止不需要特定的信号。对于环状DNA分子,两个复制叉或在一个特定部位相遇,即一个复制叉在此停止,“等待”另一个移动较慢或需移动较长距离的复制叉,这意味着有一个特异的终止信号。
环状DNA分子的复制方式:
多数原核生物DNA,比如细菌染色体DNA、大肠杆菌的质粒、某些噬菌体基因组、双链DNA病毒基因组以及真核生物的线粒体DNA都为共价闭合环状的DNA分子。
真核生物DNA复制特点除了上述几项之外,还有如下几点:①真核生物DNA复制过程中的引物及冈崎片段的长度均小于原核生物。动物细胞中的引物约为10个核苷酸,冈崎片段约有100~200个核苷酸;②真核细胞在复制时,还同步合成组蛋白,形成核小体;③真核生物染色体在全部复制完成以前,各个起始点上不能再开始下一轮的DNA复制,而在快速生长的原核生物中,在起始点上可以连续开始新的DNA复制。
端粒及端粒酶:真核生物线性染色体的DNA的两个末段具有特殊的端粒结构,对于染色体DNA的稳定十分重要,当DNA复制完成时,两个新合成的子代链的3'-OH末段均因RNA引物被水解而产生一段空缺,需要端粒酶的作用才能弥补。
逆转录和其他复制方式
逆转录:是指以RNA为模板,利用宿主细胞中4种dNTP为原料,在引物的3'端以5'→3'方向合成与RNA互补的DNA链的过程,此过程与中心法则方向相反,故称为逆转录(reverse transcription)。在逆转录过程中以RNA指导的DNA聚合酶称为逆转录酶(reverse transcriptase)。
实际上,逆转录并非转录,而是一种复制形式,必须有引物存在才能完成。
逆转录酶(reverse transcriplase)是逆转录病毒RNA编码多功能酶:
具有RNA指导的DNA聚合酶活性;
具有RNA酶H(RNaseH)活性,能特异性水解RNA-DNA杂交体上的RNA;
具有DNA指导的DNA聚合酶活性,以逆转录合成的单链DNA为模板合成互补DNA链。
逆转录酶对DNA没有3'→5'外切酶活性,因此它没有校对功能。逆转录的错误率相对较高,这可能是致瘤病毒较快出现新病毒株的一个原因。
逆转录病毒(retroviruses)基因组核酸是RNA,在宿主细胞中须转变成DNA,才能进行基因表达和基因组复制。
逆转录反应过程包括以RNA为模板合成DNA,杂化双链上RNA水解,以及再以单链DNA为模板合成双链DNA三步,逆转录现象的发现,加深了人们对中心法则的认识,括宽了RNA病毒致癌、致病的研究。
在基因工程操作上,还可用逆转录酶制备cDNA。
逆转录方式:


