医学生物化学

周会明

目录

  • 1 蛋白质的结构与功能
    • 1.1 蛋白质的分子组成
    • 1.2 蛋白质的一级结构
    • 1.3 蛋白质的空间结构(二、三、四级结构)
    • 1.4 蛋白质结构与功能的关系
    • 1.5 蛋白质的理化性质
  • 2 核酸的结构与功能
    • 2.1 核苷酸分子组成及一级结构
    • 2.2 DNA二级结构
    • 2.3 DNA高级结构及功能
    • 2.4 mRNA、tRNA、rRNA及其他RNA
    • 2.5 核酸的理化性质
    • 2.6 核酶与核酸酶定义及应用
  • 3 维生素
    • 3.1 脂溶性维生素的生理功能及缺乏症
    • 3.2 水溶性维生素的生理功能及缺乏症
  • 4 酶
    • 4.1 酶的分子结构与功能
    • 4.2 酶的工作原理
    • 4.3 酶促反应动力学
    • 4.4 酶的调节
  • 5 生物氧化
    • 5.1 两条呼吸链的组成和排列顺序
    • 5.2 高能化合物和ATP的生成
    • 5.3 氧化磷酸化的机制
    • 5.4 影响氧化磷酸化的因素
    • 5.5 胞质中的NADH的氧化方式
  • 6 糖代谢
    • 6.1 糖的无氧氧化
    • 6.2 糖有氧氧化
    • 6.3 磷酸戊糖途径
    • 6.4 糖原的合成与分解
    • 6.5 糖异生
    • 6.6 血糖及其调节
  • 7 脂质代谢
    • 7.1 脂肪的合成代谢
    • 7.2 脂肪的分解代谢
    • 7.3 酮体的代谢
    • 7.4 胆固醇及磷脂代谢
    • 7.5 血脂的代谢
  • 8 氨基酸代谢
    • 8.1 蛋白质的营养价值
    • 8.2 氨基酸的转氨基作用
    • 8.3 α-酮酸代谢
    • 8.4 氨的来源与转运
    • 8.5 尿素合成-鸟氨酸循环
    • 8.6 特殊氨基酸代谢
  • 9 核苷酸代谢
    • 9.1 核苷酸的合成代谢
    • 9.2 核苷酸的分解代谢
  • 10 非营养物质代谢
    • 10.1 生物转化作用
    • 10.2 胆汁酸的代谢及调节
    • 10.3 血红素的生物合成
    • 10.4 胆色素代谢与黄疸
  • 11 DNA的生物合成
    • 11.1 复制的基本规律
    • 11.2 DNA复制的酶学和拓扑学变化
    • 11.3 DNA复制的过程
  • 12 DNA损伤与损伤修复
    • 12.1 DNA损伤与损伤修复
  • 13 RNA的生物合成
    • 13.1 转录的模板和酶
    • 13.2 原核生物转录过程
    • 13.3 真核生物的转录及转录后修饰
  • 14 蛋白质的生物合成
    • 14.1 蛋白质生物合成的体系
    • 14.2 蛋白质生物合成的过程
    • 14.3 蛋白质合成的干扰和抑制
酶促反应动力学


酶促反应动力学:

    研究各种因素对酶促反应速率的影响,并加以定量的阐述。影响因素包括酶浓度、底物浓度、pH、温度、抑制剂、激活剂等。

一、底物浓度对反应速度的影响

1. 研究前提

   ① 单底物、单产物反应;

   ② 酶促反应速率一般在规定的反应条件下进行;

   ③ 反应速率取其初速率(底物的消耗量在5﹪以内);

   ④ 底物浓度远远大于酶浓度。

2. 其他因素不变,底物浓度对反应速率的影响呈矩形双曲线关系。

   ① [S]较低时,V[S]成正比,为一级反应;

   ② 随着[S]增高,V[S]不再成正比例加速,为混合级反应;

   ③ [S]高达极大时,V不再增加,达Vmax,为零级反应。

2.1曼式方程式

2.1.1中间产物学说

    [S]很低时,活性中心未完全与S结合,[S]增大,[ES]增大,[P]增加,V增大;

    [S]达到一定浓度后,活性中心完全被S饱和,[S]增大,[ES]不增加,[P]不增加,V恒定。

2.1.2米曼式方程式

2.2 KmVmax的意义

2.2.1米氏常数(Km)的意义

     V1/2Vmax时,可得:  Km=[S]

因此,Km值等于酶促反应速率为最大反应速率一半时的底物浓度,单位mol/L

     意义:

    a. Km是酶的特征性常数之一,只与酶的结构、底物和反应环境(如pH、温度等)有关,与酶的浓度无关;

b. Km可近似表示酶对底物的亲和力,Km愈小,表示达到最大反应速度时所需的底物浓度愈低,酶与底物的亲和力愈大;反之,亲和力则愈小。

c. 同一酶对于不同底物有不同的Km值,其中Km最小的底物是该酶的天然底物或最适底物。

2.2.2  最大反应速率(Vmax)的意义

Vmax是酶完全被底物饱和时的反应速度,与酶浓度呈正比。

2.3 KmVmax值的测定

    双倒数作图法(林贝式作图),1/[S]为横坐标,1/V为纵坐标,纵轴截距为1/Vmax,横轴截距为-1/Km。可直接算出KmVmax

二、酶浓度对反应速度的影响

    [S]>>[E],酶可被底物饱和的情况下,V[E]成正比。

三、温度对反应速度的影响

1. 双重影响

 T升高,V增大;

    T继续升高,V降低(高温会使蛋白质变性)。

2. 最适温度

V最大时的环境温度。

3. 应用意义

如低温麻醉;疫苗、生物样本的低温保存;高温高压灭菌等。

    注:酶的最适温度不是酶的特征性常数;低温使酶的活性降低但并不使酶破坏;高温时酶变性失活。

四、pH对反应速度的影响

1. 酶的最适pH (optimum pH)

酶催化活性最高时反应体系的pH值。

2. 最适pH不是酶的特征性常数。

3. 体内大部分酶最适pH为中性,但少数例外。

五、抑制剂对酶促反应速度的影响

酶的抑制剂:能使酶的催化活性下降而不引起酶蛋白变性的物质。

抑制作用的类型(根据抑制剂与酶结合的紧密程度):

   不可逆性抑制

   可逆性抑制:竞争性抑制、非竞争性抑制、反竞争性抑制。

1. 不可逆性抑制作用

1.1 概念

     抑制剂通常以共价键与酶活性中心的必需基团结合,使酶失活;抑制剂不可用透析、超滤等方法去除。

1.2 举例

1.2.1有机磷中毒

    抑制羟基酶的活性,可用解磷定(PAM)解毒。

 具体机制:

有机磷化合物能特异地与胆碱酯酶活性中心丝氨酸残基的羟基结合,使酶失活,造成乙酰胆碱在体内积蓄,出现胆碱能神经过度兴奋而出现一系列中毒症状。

解磷定的-OH更易与有机磷结合,使胆碱酯酶游离而恢复活性。

1.2.2 重金属离子及砷中毒:

    抑制巯基酶的活性,可用二巯基丙醇(BAL)解毒。

 具体机制:

重金属离子能与酶分子的巯基共价结合,使酶失活。

二巯基丙醇分子中含有2个巯基,更易与毒剂结合,使巯基酶的活性恢复而进行解毒。

2. 可逆性抑制作用

抑制剂通常以非共价键与酶或酶-底物复合物可逆性结合,使酶的活性降低或丧失;抑制剂可用透析、超滤等方法除去。

1.1 竞争性抑制作用

1.1.1概念

    抑制剂与底物的结构相似,能与底物竞争酶的活性中心,从而阻碍酶底物复合物的形成,使酶的活性降低。       

1.1.2特点

     IS结构类似,竞争酶的活性中心;

     抑制程度取决于抑制剂与酶的相对亲和力及底物浓度;

     动力学特点:Vmax不变,Km增大。  

1.1.3举例

如:磺胺类药物

    磺胺类药物抑菌机制:

    某些细菌生长繁殖时,在菌体内FH2合成酶的催化下,利用对氨基苯甲酸(PABA)等物质合成FH2。磺胺类药物与对氨基苯甲酸的结构相似,是FH2合成酶的竞争性抑制剂,可抑制FH2的合成,进而使FH4生成减少,核酸的合成受阻,细菌的生长繁殖受到抑制。人类能直接利用叶酸,故核酸的合成不受磺胺类药物的干扰。

1.2 非竞争性抑制作用

1.2.1概念

    抑制剂不与底物竞争酶的活性中心,而是与活性中心以外的必需基团相结合,使酶的构象改变而失去活性1.2.2特点

     动力学特点:Vmax降低,Km不变

     I不影响ES结合,因此Km不变;ESI不能解离产生PE,所以Vmax降低。

1.2.3举例

    一氧化碳中毒、氰化物中毒

1.3 反竞争性抑制

1.3.1概念

    抑制剂只能与酶-底物复合物(ES)结合,使ES不能分解成产物。

1.3.2特点

     抑制剂只与酶-底物复合物结合;

     抑制程度取决与抑制剂的浓度及底物的浓度;

     动力学特点:Vmax降低,Km降低。

 

小结:

  对各种可逆性抑制作用的比较

六、激活剂对反应速度的影响

    使酶由无活性变为有活性或使酶活性增加的物质称为激活剂,如金属离子和小分子化合物。包括必需激活剂和非必需激活剂两种。