药物生物信息学

林雪

目录

  • 药物学基础
    • ● 药物的基本概念及药物发现发展简史
    • ● 药物作用原理及药物研发流程
    • ● 第一章小结练习
  • 药物研发方法学基础
    • ● 现代药物工业形成简史及药物研发基本概念
    • ● 药物研发伦理及药物研发基本方法
    • ● 第二章小结练习
  • 生物信息学在药物研发中的应用
    • ● TTD药靶数据库
    • ● PDB药靶结构数据库
    • ● DGIdb基因药物相互作用数据库
    • ● 第三章小结练习-1
    • ● ChEMBL化学物质数据库理论及实践
    • ● ChemSpider化学物质数据库理论及实践
    • ● DrugBank药物综合数据库
    • ● TCMBank中药综合数据库
    • ● 基于受体药物设计
    • ● 基于配体药物设计
    • ● 分子对接和构效关系数据库
    • ● CMap疾病-药物-基因连通图数据库
    • ● 第三章小结练习-2
  • 生物信息学药物研发前景展望
    • ● 生物信息学与精准医疗及发展前景
  • AI+药物设计
    • ● 人工智能药物设计理论与实践
  • 药物研发生物信息学工具使用实践
    • ● 药物作用预测
    • ● 同源建模
    • ● 分子对接
    • ● 精准医疗
  • 2022-2023版
    • ● 第一章 药物学基础知识
      • ● 第一课时 课程介绍
      • ● 第二课时 药物的基本概念
      • ● 第三课时 药物的起源和发展历史
      • ● 第四课时 中国药物发展历程
      • ● 第五课时 药物作用的基本原理
      • ● 第六课时 药物研发过程
    • ● 第二章 药物生物信息学
      • ● 第七课时 药物生物信息学的概念及其在药学领域的应用
      • ● 第八课时 疾病的分子机制及受体与疾病
      • ● 第九课时 药靶的概念、分类及药物发现中的经典药靶
      • ● 第十课时 药靶数据库-TTD详解(含随堂测试）
      • ● 第十一课时 随堂测试1
      • ● 第十二课时 药靶数据库-TTD使用实战
      • ● 第十三课时 药靶相关综合数据库-DrugBank详解
      • ● 第十四课时 药靶相关综合数据库-DrugBank使用
      • ● 第十五课时 药靶相关综合数据库-DrugBank使用实战
      • ● 第十六课时 靶点与生物活性数据库-ChEMBL详解
      • ● 第十七课时 靶点与生物活性数据库-ChEMBL使用
      • ● 第十八课时 靶点与生物活性数据库-ChEMBL使用实战
      • ● 第十九课时 其他重要药物生物信息数据库-CMap原理
      • ● 第二十课时 其他重要药物生物信息数据库-CMap使用及使用实战
      • ● 第二十一课时 其他重要药物生物信息数据库-CMap使用实战
      • ● 第二十二课时 其他重要药物生物信息学数据库-PDB
      • ● 第二十三课时 其他重要药物生物信息学数据库-ChemSpider
      • ● 第二十四课时 其他重要药物生物信息学数据库-10KMP
    • ● 第三章 计算机辅助药物设计
      • ● 第一课时 计算机辅助药物设计概述
      • ● 第二课时 计算机辅助药物设计理论基础
      • ● 第三课时 计算机辅助药物设计常用技术
      • ● 第四课时 计算机辅助药物设计方法学-直接药物设计
      • ● 第五课时 计算机辅助药物设计-间接药物设计
      • ● 第六课时 计算机辅助药物设计-介于两者间的新方法和新策略
      • ● 第七~九课时 基于配体药物设计
      • ● 第十～十二课时 基于受体药物设计
      • ● 第十三课时 计算机辅助药物设计成功案例-格列卫
      • ● 第十四课时 计算机辅助药物设计-DPP4抑制剂
      • ● 第十五课时 计算机辅助药物设计-蛋白酶抑制剂研究进展
    • ● 第四章 药物基因组学
      • ● 第四十课时 药物基因组学概述
      • ● 第四十一课时 药物基因组学研究方法
      • ● 第四十二课时 药物基因组学成功案例
      • ● 第四十三课时 药物基因组学数据库PharmGKB简介
      • ● 第四十四课时 药物基因组学数据库PharmGKB使用
      • ● 第四十五课时 药物基因组学数据库PharmGKB使用实战
      • ● 第四十六课时  抗凝药物个体化治疗策略
      • ● 第四十七课时 口服降糖药物个体化治疗策略
      • ● 第四十八课时 抗肿瘤药物个体化治疗策略
    • ● 第五章 实践操作
      • ● Cmap的使用
      • ● Modeller的使用
      • ● AutoDock的使用
      • ● PharmGKB的使用
    • ● 总复习
      • ● 课程考核说明
    • ● 拓展：生物医学大数据分析前沿—深度学习在药物研发中的应用
      • ● 深度学习在药物研发中的应用
      • ● 分子动力学模拟在药物研发中的应用
      • ● 2023版
  • 2021版
    • ● 第四～六课时 疾病治疗的分子途径
    • ● 第八～第十二课时 生物信息学——基因组到药物的桥梁
      • ● 第八课时 生物信息学—基因组到药物的桥梁
      • ● 第九课时 测序技术和序列分析概述
      • ● 第十课时 序列比对
    • ● 第十一课时 药靶识别生物信息学方法
    • ● 第十二、十三课时 药靶识别生物信息学工具—Cmap&DrugBank
    • ● 第十四课时 药靶确证、本章小结及答疑
    • ● 第一～三课时 药物基因组学概述
    • ● 第四～六课时 个体化治疗中的生物信息学—PharmGKB
    • ● 第七～九课时 靶向抗肿瘤药物个体化治疗决策
    • ● 第十～十二课时 抗凝药物个体化治疗决策
    • ● 第一～三课时 前言
    • ● 第十～十二课时 计算机辅助药物设计成功案例
    • ● 第十三～十五课时 本章小结和答疑
分子对接
  • 1 课堂学习
  • 2 课后作业

幻灯片


软件下载

  1. AutoDock

  2. ADT

  3. AMDock

数据下载

实验报告