药物生物信息学
林雪
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药物学基础
● 药物的基本概念及药物发现发展简史
● 药物作用原理及药物研发流程
● 第一章小结练习
药物研发方法学基础
● 现代药物工业形成简史及药物研发基本概念
● 药物研发伦理及药物研发基本方法
● 第二章小结练习
生物信息学在药物研发中的应用
● TTD药靶数据库
● PDB药靶结构数据库
● DGIdb基因药物相互作用数据库
● 第三章小结练习-1
● ChEMBL化学物质数据库理论及实践
● ChemSpider化学物质数据库理论及实践
● DrugBank药物综合数据库
● TCMBank中药综合数据库
● 基于受体药物设计
● 基于配体药物设计
● 分子对接和构效关系数据库
● CMap疾病-药物-基因连通图数据库
● 第三章小结练习-2
生物信息学药物研发前景展望
● 生物信息学与精准医疗及发展前景
AI+药物设计
● 人工智能药物设计理论与实践
药物研发生物信息学工具使用实践
● 药物作用预测
● 同源建模
● 分子对接
● 精准医疗
2022-2023版
● 第一章 药物学基础知识
● 第一课时 课程介绍
● 第二课时 药物的基本概念
● 第三课时 药物的起源和发展历史
● 第四课时 中国药物发展历程
● 第五课时 药物作用的基本原理
● 第六课时 药物研发过程
● 第二章 药物生物信息学
● 第七课时 药物生物信息学的概念及其在药学领域的应用
● 第八课时 疾病的分子机制及受体与疾病
● 第九课时 药靶的概念、分类及药物发现中的经典药靶
● 第十课时 药靶数据库-TTD详解(含随堂测试)
● 第十一课时 随堂测试1
● 第十二课时 药靶数据库-TTD使用实战
● 第十三课时 药靶相关综合数据库-DrugBank详解
● 第十四课时 药靶相关综合数据库-DrugBank使用
● 第十五课时 药靶相关综合数据库-DrugBank使用实战
● 第十六课时 靶点与生物活性数据库-ChEMBL详解
● 第十七课时 靶点与生物活性数据库-ChEMBL使用
● 第十八课时 靶点与生物活性数据库-ChEMBL使用实战
● 第十九课时 其他重要药物生物信息数据库-CMap原理
● 第二十课时 其他重要药物生物信息数据库-CMap使用及使用实战
● 第二十一课时 其他重要药物生物信息数据库-CMap使用实战
● 第二十二课时 其他重要药物生物信息学数据库-PDB
● 第二十三课时 其他重要药物生物信息学数据库-ChemSpider
● 第二十四课时 其他重要药物生物信息学数据库-10KMP
● 第三章 计算机辅助药物设计
● 第一课时 计算机辅助药物设计概述
● 第二课时 计算机辅助药物设计理论基础
● 第三课时 计算机辅助药物设计常用技术
● 第四课时 计算机辅助药物设计方法学-直接药物设计
● 第五课时 计算机辅助药物设计-间接药物设计
● 第六课时 计算机辅助药物设计-介于两者间的新方法和新策略
● 第七~九课时 基于配体药物设计
● 第十~十二课时 基于受体药物设计
● 第十三课时 计算机辅助药物设计成功案例-格列卫
● 第十四课时 计算机辅助药物设计-DPP4抑制剂
● 第十五课时 计算机辅助药物设计-蛋白酶抑制剂研究进展
● 第四章 药物基因组学
● 第四十课时 药物基因组学概述
● 第四十一课时 药物基因组学研究方法
● 第四十二课时 药物基因组学成功案例
● 第四十三课时 药物基因组学数据库PharmGKB简介
● 第四十四课时 药物基因组学数据库PharmGKB使用
● 第四十五课时 药物基因组学数据库PharmGKB使用实战
● 第四十六课时 抗凝药物个体化治疗策略
● 第四十七课时 口服降糖药物个体化治疗策略
● 第四十八课时 抗肿瘤药物个体化治疗策略
● 第五章 实践操作
● Cmap的使用
● Modeller的使用
● AutoDock的使用
● PharmGKB的使用
● 总复习
● 课程考核说明
● 拓展:生物医学大数据分析前沿—深度学习在药物研发中的应用
● 深度学习在药物研发中的应用
● 分子动力学模拟在药物研发中的应用
● 2023版
2021版
● 第四~六课时 疾病治疗的分子途径
● 第八~第十二课时 生物信息学——基因组到药物的桥梁
● 第八课时 生物信息学—基因组到药物的桥梁
● 第九课时 测序技术和序列分析概述
● 第十课时 序列比对
● 第十一课时 药靶识别生物信息学方法
● 第十二、十三课时 药靶识别生物信息学工具—Cmap&DrugBank
● 第十四课时 药靶确证、本章小结及答疑
● 第一~三课时 药物基因组学概述
● 第四~六课时 个体化治疗中的生物信息学—PharmGKB
● 第七~九课时 靶向抗肿瘤药物个体化治疗决策
● 第十~十二课时 抗凝药物个体化治疗决策
● 第一~三课时 前言
● 第十~十二课时 计算机辅助药物设计成功案例
● 第十三~十五课时 本章小结和答疑
拓展:生物医学大数据分析前沿—深度学习在药物研发中的应用
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