药物生物信息学

林雪

目录

  • 1 课程介绍
    • 1.1 课程介绍
  • 2 药物作用基础
    • 2.1 药物作用基础1-2
  • 3 药物研发原理及技术
    • 3.1 药物研发原理及技术1-4
  • 4 药靶与药物发现
    • 4.1 药靶与药物发现1-4
  • 5 配体与药物发现
  • 6 2024-2025版
    • 6.1 药物学基础
      • 6.1.1 药物的基本概念及药物发现发展简史
      • 6.1.2 药物作用原理及药物研发流程
      • 6.1.3 第一章小结练习
    • 6.2 药物研发方法学基础
      • 6.2.1 现代药物工业形成简史及药物研发基本概念
      • 6.2.2 药物研发伦理及药物研发基本方法
      • 6.2.3 第二章小结练习
    • 6.3 生物信息学在药物研发中的应用
      • 6.3.1 TTD药靶数据库
      • 6.3.2 PDB药靶结构数据库
      • 6.3.3 DGIdb基因药物相互作用数据库
      • 6.3.4 第三章小结练习-1
      • 6.3.5 ChEMBL化学物质数据库理论及实践
      • 6.3.6 ChemSpider化学物质数据库理论及实践
      • 6.3.7 DrugBank药物综合数据库
      • 6.3.8 TCMBank中药综合数据库
      • 6.3.9 基于受体药物设计
      • 6.3.10 基于配体药物设计
      • 6.3.11 分子对接和构效关系数据库
      • 6.3.12 CMap疾病-药物-基因连通图数据库
      • 6.3.13 第三章小结练习-2
    • 6.4 生物信息学药物研发前景展望
      • 6.4.1 生物信息学与精准医疗及发展前景
    • 6.5 AI+药物设计
      • 6.5.1 人工智能药物设计理论与实践
    • 6.6 药物研发生物信息学工具使用实践
      • 6.6.1 药物作用预测
      • 6.6.2 同源建模
      • 6.6.3 分子对接
      • 6.6.4 精准医疗
  • 7 2022-2023版
    • 7.1 第一章 药物学基础知识
      • 7.1.1 第一课时 课程介绍
      • 7.1.2 第二课时 药物的基本概念
      • 7.1.3 第三课时 药物的起源和发展历史
      • 7.1.4 第四课时 中国药物发展历程
      • 7.1.5 第五课时 药物作用的基本原理
      • 7.1.6 第六课时 药物研发过程
    • 7.2 第二章 药物生物信息学
      • 7.2.1 第七课时 药物生物信息学的概念及其在药学领域的应用
      • 7.2.2 第八课时 疾病的分子机制及受体与疾病
      • 7.2.3 第九课时 药靶的概念、分类及药物发现中的经典药靶
      • 7.2.4 第十课时 药靶数据库-TTD详解(含随堂测试）
      • 7.2.5 第十一课时 随堂测试1
      • 7.2.6 第十二课时 药靶数据库-TTD使用实战
      • 7.2.7 第十三课时 药靶相关综合数据库-DrugBank详解
      • 7.2.8 第十四课时 药靶相关综合数据库-DrugBank使用
      • 7.2.9 第十五课时 药靶相关综合数据库-DrugBank使用实战
      • 7.2.10 第十六课时 靶点与生物活性数据库-ChEMBL详解
      • 7.2.11 第十七课时 靶点与生物活性数据库-ChEMBL使用
      • 7.2.12 第十八课时 靶点与生物活性数据库-ChEMBL使用实战
      • 7.2.13 第十九课时 其他重要药物生物信息数据库-CMap原理
      • 7.2.14 第二十课时 其他重要药物生物信息数据库-CMap使用及使用实战
      • 7.2.15 第二十一课时 其他重要药物生物信息数据库-CMap使用实战
      • 7.2.16 第二十二课时 其他重要药物生物信息学数据库-PDB
      • 7.2.17 第二十三课时 其他重要药物生物信息学数据库-ChemSpider
      • 7.2.18 第二十四课时 其他重要药物生物信息学数据库-10KMP
    • 7.3 第三章 计算机辅助药物设计
      • 7.3.1 第一课时 计算机辅助药物设计概述
      • 7.3.2 第二课时 计算机辅助药物设计理论基础
      • 7.3.3 第三课时 计算机辅助药物设计常用技术
      • 7.3.4 第四课时 计算机辅助药物设计方法学-直接药物设计
      • 7.3.5 第五课时 计算机辅助药物设计-间接药物设计
      • 7.3.6 第六课时 计算机辅助药物设计-介于两者间的新方法和新策略
      • 7.3.7 第七~九课时 基于配体药物设计
      • 7.3.8 第十～十二课时 基于受体药物设计
      • 7.3.9 第十三课时 计算机辅助药物设计成功案例-格列卫
      • 7.3.10 第十四课时 计算机辅助药物设计-DPP4抑制剂
      • 7.3.11 第十五课时 计算机辅助药物设计-蛋白酶抑制剂研究进展
    • 7.4 第四章 药物基因组学
      • 7.4.1 第四十课时 药物基因组学概述
      • 7.4.2 第四十一课时 药物基因组学研究方法
      • 7.4.3 第四十二课时 药物基因组学成功案例
      • 7.4.4 第四十三课时 药物基因组学数据库PharmGKB简介
      • 7.4.5 第四十四课时 药物基因组学数据库PharmGKB使用
      • 7.4.6 第四十五课时 药物基因组学数据库PharmGKB使用实战
      • 7.4.7 第四十六课时  抗凝药物个体化治疗策略
      • 7.4.8 第四十七课时 口服降糖药物个体化治疗策略
      • 7.4.9 第四十八课时 抗肿瘤药物个体化治疗策略
    • 7.5 第五章 实践操作
      • 7.5.1 Cmap的使用
      • 7.5.2 Modeller的使用
      • 7.5.3 AutoDock的使用
      • 7.5.4 PharmGKB的使用
    • 7.6 总复习
      • 7.6.1 课程考核说明
    • 7.7 拓展：生物医学大数据分析前沿—深度学习在药物研发中的应用
      • 7.7.1 深度学习在药物研发中的应用
      • 7.7.2 分子动力学模拟在药物研发中的应用
      • 7.7.3 2023版
  • 8 2021版
    • 8.1 第四～六课时 疾病治疗的分子途径
    • 8.2 第八～第十二课时 生物信息学——基因组到药物的桥梁
      • 8.2.1 第八课时 生物信息学—基因组到药物的桥梁
      • 8.2.2 第九课时 测序技术和序列分析概述
      • 8.2.3 第十课时 序列比对
    • 8.3 第十一课时 药靶识别生物信息学方法
    • 8.4 第十二、十三课时 药靶识别生物信息学工具—Cmap&DrugBank
    • 8.5 第十四课时 药靶确证、本章小结及答疑
    • 8.6 第一～三课时 药物基因组学概述
    • 8.7 第四～六课时 个体化治疗中的生物信息学—PharmGKB
    • 8.8 第七～九课时 靶向抗肿瘤药物个体化治疗决策
    • 8.9 第十～十二课时 抗凝药物个体化治疗决策
    • 8.10 第一～三课时 前言
    • 8.11 第十～十二课时 计算机辅助药物设计成功案例
    • 8.12 第十三～十五课时 本章小结和答疑
第一～三课时 药物基因组学概述

药物基因组学概述

介绍药物基因部分的基础知识：

课程内容：

1. 药物基因组学渊源、任务、研究内容

2. 药物基因组学常用研究方法

3. 药物基因组学面临的挑战

4. 问题思考


授课目标

掌握药物基因组学关研究方法

了解药物基因组学的形成、概念、主要任务、研究内容、面临的挑战


课程资源：

1. 授课视频

2. 幻灯下载

3. 参考文献

《药物基因组学理论与应用》卢兹凡等，科学出版社，ISBN：9787030572684

4. 实验数据

无