高通量测序技术原理与数据分析

邵娇芳 林长松 武剑

目录

  • 1 测序导论
    • 1.1 测序那些事
    • 1.2 国内外测序行业发展现状
  • 2 测序历史及技术原理
    • 2.1 测序研究对象
    • 2.2 测序技术起源
      • 2.2.1 Sanger测序技术
    • 2.3 测序技术现状
      • 2.3.1 概要及发展
      • 2.3.2 Illumina边合成边测序
      • 2.3.3 Ion Torrent半导体测序
      • 2.3.4 华大/CG纳米球测序
      • 2.3.5 PacBio单分子实时测序
      • 2.3.6 Oxford纳米孔测序
    • 2.4 本章小结与课堂实录
  • 3 测序数据预处理及质量控制
    • 3.1 预处理与质量控制
    • 3.2 本章小结与课堂实录
  • 4 基因组测序分析
    • 4.1 基因组测序内容及应用
    • 4.2 从头测序数据分析
    • 4.3 重测序数据分析
    • 4.4 基因组测序应用
    • 4.5 本章小结与课堂实录
  • 5 表观基因组测序分析
    • 5.1 表观基因组学概念及研究内容
    • 5.2 组蛋白修饰检测
    • 5.3 DNA甲基化检测
    • 5.4 染色质可及性检测
    • 5.5 蛋白质-核酸结合
    • 5.6 本章小结与课堂实录
  • 6 转录组测序数据分析
    • 6.1 转录组建库及测序
    • 6.2 转录组测序分析
    • 6.3 miRNA测序
  • 7 转录组高级分析
    • 7.1 蛋白质-DNA结合
    • 7.2 蛋白质-RNA结合
  • 8 单细胞转录组
    • 8.1 宏基因组概念及发展
    • 8.2 宏基因组研究策略及分析方法
  • 9 单细胞表观基因组
    • 9.1 单细胞测序
    • 9.2 技术发展
    • 9.3 产业趋势
  • 10 免疫组库测序
    • 10.1 软件安装使用
    • 10.2 文本处理综合应用
    • 10.3 实验用服务器配置及使用
  • 11 16S/18S/ITS扩增子宏基因组测序
    • 11.1 16S rRNA数据分析
  • 12 宏基因组测序
    • 12.1 宏基因组测序分析
    • 12.2 宏基因组测序的应用
单细胞测序