‍生物不是单独进化的。生物与生物之间，通过捕食、竞争、寄生、互利共生等种间关系，相互选择，相互适应，协同进化。如达尔文发现的彗星兰与它的传粉昆虫之间互相选择，彗星兰满足了传粉昆虫的食物，传粉昆虫帮彗星兰实现了异花传粉，有利于彗星兰种群的繁衍。猎豹和羚羊之间通过捕食关系相互选择，猎豹淘汰了羚羊种群中老弱病残的个体，羚羊使跑得快、反应敏捷的猎豹生存下来。生物与环境之间也能相互影响，协同进化。如光合生物的出现使地球上有了氧气，大气中出现臭氧层，改善了地球环境，而有氧环境又促进了好氧生物的进化。因此，协同进化体现在两个方面，生物与生物之间、生物与环境之间。

协同进化使地球上出现了不同种类的物种，以及不同类型的生态系统，因此协同进化是导致生物多样性的原因。分析地球上生物进化的历史，最重要的依据是化石。化石就是保存于地层中的古生物遗体、遗物和遗迹。从化石记录看，可把生物进化石分为地球形成、原始生命出现、古生代、中生代、新生代。生物进化是按照从原核生物到真核生物，从单细胞生物到多细胞生物，从简单到复杂，从水生到陆生，从低等到高等。

生物进化是非常复杂的，目前被广泛承认的进化理论是以达尔文的自然选择学说为核心的现代生物进化理论。但是也有别的科学家提出了中性学说。生物进化还有许多未解之谜，将不断的被探索被发现。‍