生物信息学

仇书兴

目录

  • 1 《生物信息学》教学大纲
    • 1.1 课程概述
  • 2 第一章 生物信息学绪论
    • 2.1 绪论
  • 3 第二章  生物资源数据库
    • 3.1 生物资源数据库
  • 4 第三章  数据库检索
    • 4.1 数据库检索
  • 5 第四章  序列比对
    • 5.1 第一节  双序列比对
      • 5.1.1 第二节 多序列比对
        • 5.1.1.1 第三节 数据检索及序列比对实际应用
  • 6 第五章  核酸序列分析
    • 6.1 第一节 核酸序列基本信息分析
      • 6.1.1 第二节 基因组序列注释分析
        • 6.1.1.1 第三节 核酸序列分析常用软件及实际应用
  • 7 第六章  蛋白质序列信息分析
    • 7.1 第一节 蛋白质序列基本信息分析
      • 7.1.1 第二节 蛋白质结构分析
        • 7.1.1.1 第三节 蛋白质功能分析
          • 7.1.1.1.1 第四节 蛋白质序列信息分析实际应用实例
  • 8 第七章  蛋白质组学
    • 8.1 蛋白质组学
  • 9 第八章  分子进化与系统发育分析
    • 9.1 分子进化与系统发育分析
  • 10 第九章  生物信息学与人类复杂疾病
    • 10.1 第一节 生物信息学与人类复杂疾病
    • 10.2 第二节 考核评价与权重比例
第一节 生物信息学与人类复杂疾病

1.课前准备

(1) 熟悉课程教学大纲,对课程的讲授内容和方式有较好的理解;

(2) 加强课程的网络资源库建设;

(3) 收集本次教学活动中拟采用的案例。

1.1课外学习评价

针对上次要求巩固、拓展的学习内容,掌握系统发育模型的组成、建立与分析,分子进化树的构建;构建进化树的原理和算法对要求课前预习的内容进行预习。

1.2教学方案设计

(1) 回顾上次课程的主要内容;

(2) 本次课程的重点和难点:人类疾病、复杂疾病及分子机理;基因芯片技术;蛋白质组学及蛋白质表达;转录调控的高通量分析;高通量基因分型分析生物分子网络;

(3) 教学手段主要是借助PPT和讲义完成教学内容;

(4) 教学过程中结合学生情况举出一些案例;

(5) 通过课程论文和课堂讨论来检查教学目标的完成情况。

2.课内教学

2.1教学内容

主要教学内容有:

(1) 人类疾病及复杂疾病;

(2) 复杂疾病发生的分子机理;

(3) 复杂疾病的分子机理分析;

Ø  基因芯片技术

Ø  蛋白质组学及蛋白质表达分析

Ø  转录调控的高通量分析

Ø  高通量基因分型分析

(4)典型的生物分子网络简介

(5)复杂分子生物网络的分析及构建

对于基本概念性的问题以讲授为主,对于基本技能方面的可以通过学生讨论的方式进行,要求学生达到举一反三的目的。

主要包含的知识点有:(1)人类疾病及复杂疾病;(2) 复杂疾病发生的分子机理;(3) 基因芯片技术;(4)蛋白质组学及蛋白质表达分析;(5)转录调控的高通量分析;(6)高通量基因分型分析;(7)典型的生物分子网络简介;(8)复杂分子生物网络的分析及构建。

2.2 教学方法:

讲授+启发式+讨论式

2.3 课内小结:

通过本章学习,使学生能够掌握人类疾病、复杂疾病及分子机理;基因芯片技术;蛋白质组学及蛋白质表达;转录调控的高通量分析;高通量基因分型分析生物分子网络对课堂上积极回答问题的学生提出表扬,最后要求学生预习下次课的主要内容。

3.课后巩固与拓展

(1) 将本章的知识点自己编成测试题,记在笔记本中;

(2)预习下节课的主要内容;

(3)查阅学习相关的文献资料。

4.单元(章)考核与评价

本章内容的考核方式为提交课程作业/课下复习本章节知识要点/预习下一章节学习内容,掌握人类疾病、复杂疾病及分子机理;基因芯片技术;蛋白质组学及蛋白质表达;转录调控的高通量分析;高通量基因分型分析生物分子网络。

本章内容的评价权重为7%,过程评价促进学生学习积极主动性的提高,增强学生自主学习能力。其中课后习题、在线考核占4%,期末考试测试占3%。

考核方式与权重比例列表

                       

 

考核方式

 
 

评价权重

 
 

备注

 
 

课后习题、在线测试

 
 

4%

 
 

在线测试要求学生课堂内完成

 
 

期末考试

 
 

3%

 

 

合计

 
 

7%