1.课前准备
(1) 熟悉课程教学大纲,对课程的讲授内容和方式有较好的理解;
(2) 加强课程的网络资源库建设;
(3) 收集本次教学活动中拟采用的案例。
1.1课外学习评价
针对上次要求巩固、拓展的学习内容,要求学生掌握常用生物信息中心浏览及查询应用;数据查询应用;PUBMED使用应用;相似性搜索应用;双序列比对应用;序列的点阵分析应用;序列比对常用软件及其应用。对要求课前预习的内容进行预习。
1.2教学方案设计
(1) 回顾上次课程的主要内容;
(2) 本次课程的重点和难点:核酸序列检索;分子质量、碱基组成、碱基分布、序列转换、核酸序列基本分析;序列变换;限制性酶切分析;克隆测序分析;测序中载体序列的识别与去除;核酸序列拼接;核酸序列的电子延伸;开放阅读框(ORF)分析;基因组序列编码区/内含子结构分析;CpG岛分析;cDNA和Genomic DNA比对;基因启动子分析;引物设计;密码子偏好性分析;序列提交。
(3) 教学手段主要是借助PPT和讲义完成教学内容;
(4) 教学过程中结合学生情况举出一些案例;
(5) 通过课程论文和课堂讨论来检查教学目标的完成情况。
2.课内教学
2.1教学内容
主要教学内容有:
(1)核酸序列检索
(2)分子质量、碱基组成、碱基分布、序列转换、核酸序列基本分析
(3)序列变换
(4)限制性酶切分析
(5)克隆测序分析
(6)测序中载体序列的识别与去除
(7)核酸序列拼接
(8)核酸序列的电子延伸
(9)开放阅读框(ORF)分析
(10)基因组序列编码区/内含子结构分析
(11) CpG岛分析
(12) cDNA和GenomicDNA比对
(13)基因启动子分析
(14)引物设计
(15)密码子偏好性分析
(16)序列提交
对于基本概念性的问题以讲授为主,对于基本技能方面的可以通过学生讨论的方式进行,要求学生达到举一反三的目的。
主要包含的知识点有:核酸序列检索;分子质量、碱基组成、碱基分布、序列转换、核酸序列基本分析;序列变换;限制性酶切分析;克隆测序分析;测序中载体序列的识别与去除;核酸序列拼接;核酸序列的电子延伸;开放阅读框(ORF)分析;基因组序列编码区/内含子结构分析;CpG岛分析;cDNA和Genomic DNA比对;基因启动子分析;密码子偏好性分析。
2.2 教学方法:
讲授+启发式+讨论式
2.3 课内小结:
通过本章学习,使学生能够掌握核酸序列检索;分子质量、碱基组成、碱基分布、序列转换、核酸序列基本分析;序列变换;限制性酶切分析;克隆测序分析;测序中载体序列的识别与去除;核酸序列拼接;核酸序列的电子延伸;开放阅读框(ORF)分析;基因组序列编码区/内含子结构分析;CpG岛分析;cDNA和Genomic DNA比对;基因启动子分析;引物设计;密码子偏好性分析;序列提交。对课堂上积极回答问题的学生提出表扬,最后要求学生预习下次课的主要内容。
3.课后巩固与拓展
(1) 将本章的知识点自己编成测试题,记在笔记本中;
(2)预习下节课的主要内容;
(3)查阅学习专业相关的文献资料。
4.单元(章)考核与评价
本章内容的考核方式为提交课程作业/课下复习本章节知识要点/预习下一章节学习内容,要求学生掌握核酸序列检索;分子质量、碱基组成、碱基分布、序列转换、核酸序列基本分析;序列变换;限制性酶切分析;克隆测序分析;测序中载体序列的识别与去除;核酸序列拼接;核酸序列的电子延伸;开放阅读框(ORF)分析;基因组序列编码区/内含子结构分析;CpG岛分析;cDNA和Genomic DNA比对;基因启动子分析;引物设计;密码子偏好性分析;序列提交。
本章内容的评价权重为6%,过程评价促进学生学习积极主动性的提高,增强学生自主学习能力。其中课后习题、在线考核占3%,期末考试测试占3%。
考核方式与权重比例列表
| 考核方式 | 评价权重 | 备注 |
| 课后习题、在线测试 | 6% | 在线测试要求学生课堂内完成 |
| 期末考试 | 3% | |
| 合计 | 3% |

