1.课前准备
(1) 熟悉课程教学大纲,对课程的讲授内容和方式有较好的理解;
(2) 加强课程的网络资源库建设;
(3) 收集本次教学活动中拟采用的案例。
1.1课外学习评价
针对上次要求巩固、拓展的学习内容,准确掌握生物信息学、数据库、基因组学与后基因组学的概念、生物信息学的相关术语、生物信息学研究的基本内容、基本原理与生物学基础及本学科的重要性。对要求课前预习的内容进行预习。
1.2教学方案设计
(1) 回顾上次课程的主要内容;
(2) 本次课程的重点和难点:DNA、RNA与蛋白质序列数据库;蛋白质结构数据库、蛋白质分类数据库;数据格式;基因组数据库。
(3) 教学手段主要是借助PPT和讲义完成教学内容;
(4) 教学过程中结合学生专业情况举出一些案例;
(5) 通过课程论文和课后作业来检查教学目标的完成情况。
2.课内教学
2.1教学内容
主要教学内容有:
(1)生物数据库的定义、特点及分类
(2)生物信息计算机基础知识简介
(3)常用分子生物信息数据库介绍
(4)生物信息数据存储格式
(5) 生物信息的提交
(6)其他数据库。
对于基本概念性的问题以讲授为主,对于基本技能方面的可以通过学生讨论的方式进行,要求学生达到举一反三的目的。
主要包含的知识点有:(1)常用核酸和蛋白质序列和结构数据库的种类和内容;
(2)生物数据库资源(如NCBI,UCSC和EMBL等)其各自的特点及它们之间的联系;(3)DNA序列的存储数据库(如GenBank,DDBJ,EMBL等)中一些关键序列号的意义和数据库内部结构的组织(4)蛋白质序列的存储数据库(如UniProt等)中一些关键序列号的意义和数据库内部结构的组织(5)公共基因表达数据库、表达序列标签数据库dbEST(6)数据格式(7)基因组数据库(8)蛋白质序列与模式、同源性数据库。
2.2 教学方法:
讲授+启发式+讨论式
2.3 课内小结:(时间10-15分钟)
通过本章教学,使学生能够掌握DNA、RNA与蛋白质序列数据库;蛋白质结构数据库、蛋白质分类数据库;数据格式;基因组数据库。对课堂上积极回答问题的学生提出表扬,最后要求学生预习下次课的主要内容。
3.课后巩固与拓展
(1) 将本章的知识点自己编成测试题,记在笔记本中;
(2)预习下节课的主要内容;
(3)查阅学习专业相关的文献。
4.单元(章)考核与评价
本章内容的考核方式为提交课程作业/课下复习本章节知识要点/预习下一章节学习内容,要求学生掌握DNA、RNA与蛋白质序列数据库;蛋白质结构数据库、蛋白质分类数据库;数据格式、数据提交;基因组数据库。
本章内容的评价权重为6%,过程评价促进学生学习积极主动性的提高,增强学生自主学习能力。其中课后习题、在线考核占4%,期末考试测试占2%。
考核方式与权重比例列表
| 考核方式 | 评价权重 | 备注 |
| 课后习题、在线测试 | 4% | 在线测试要求学生课堂内完成 |
| 期末考试 | 2% | |
| 合计 | 6% |

