《生物信息学》教学大纲
课程编码：1717104602
课程名称：生物信息学
学时/学分：32/2
关联课程：《生物化学》、《分子生物学》、《基因工程》、《高等数学》、《计算机语言》
适用专业：生物技术
开课教研室：生物技术教研室
课程类别与性质：专业课程、选修
一、课时分配与考核权重
按照学校整体要求，基于对教学目标及基本知识、基本技能、基本素养的分析，本课程的内容依据高等学校生物技术专业教育的培养目标以及毕业生基本要求和培养方案，选定生物信息学绪论、生物信息学数据资源库、数据库检索、序列比对、核酸序列分析、基因组学、蛋白序列信息分析、蛋白结构分析等9部分内容，共32学时，2学分。要求教师在讲授过程中围绕课内教与学、课外导与做、线上线下紧密结合等环节，推进考评方式改革，重视过程性评价，突出基于能力的非标准化答案考试改革。基于该教学考核评价思路，本课程主要以课程论文、课堂讨论、课后作业、其中测试、期末测试等方式对学生进行考核评价，其中课程论文、课堂讨论、课后作业、其中测试等过程性评价占评价权重的60%，期末考试占评价权重的40%。
课时分配与考核权重一览表
| 序号 | 章节 | 课时数/学时 | 评价方法及考核权重 |
| 1 | 第一章 绪论 | 2 | 1、本部分内容以课程论文和课堂讨论的方式进行考核,考核权重为6%； 2、课后习题、在线考核占4%，期末考试测试占2%。 |
| 2 | 第二章 生物资源数据库 | 2 | 1、本部分内容以课程论文和课后作业的方式进行考核,考核权重为6%； 2、课后习题、在线考核占4%，期末考试测试占2%。 |
| 3 | 第三章 数据库检索 | 2 | 1、本部分内容以课程论文和课后作业的方式进行考核,考核权重为7%； 2、课后习题、在线考核占4%，期末考试测试占3%。 |
| 4 | 第四章 序列比对及其实际应用 | 6 | 1、本部分内容以课程论文和课后作业的方式进行考核,考核权重为18%； 2、课后习题、在线考核占11%，期末考试测试占7%。 |
| 5 | 第五章 核酸序列分析 | 6 | 1、本部分内容以课程论文和课堂讨论的方式进行考核,考核权重为18%； 2、课后习题、在线考核占11%，期末考试测试占7%。 |
| 6 | 第六章 蛋白质序列信息分析 | 8 | 1、本部分内容以课程论文和课堂讨论的方式进行考核,考核权重为24%； 2、课后习题、在线考核占14%，期末考试测试占10%。 |
| 7 | 第七章 蛋白质组学 | 2 | 1、本部分内容以课程论文和课后作业的方式进行考核,考核权重为7%； 2、课后习题、在线考核占4%，期末考试测试占3%。 |
| 8 | 第八章 分子进化与系统发育分析 | 2 | 1、本部分内容以课程论文和课后作业的方式进行考核,考核权重为7%； 2、课后习题、在线考核占4%，期末考试测试占3%。 |
| 9 | 第九章 生物信息学与人类复杂疾病 | 2 | 1、本部分内容以课程论文和课后作业的方式进行考核,考核权重为7%； 2、课后习题、在线考核占4%，期末考试测试占3%。 |
| 10 | 平时成绩 | 60% | |
| 11 | 期末考试 | 40% | |
| 合计 | 32 | 100% | |
二、课程资源库
1.参考书
[1] 生物信息学教程，蔡禄，化学工业出版社，2006
[2] 生物信息基础及应用，王举 王兆月 田心，清华大学出版社，2014
[3] 生物信息学教程，李霞 李亦学 廖飞 编，人民卫生出版社， 2010
[4] 生物信息学，(第二版)张阳德主编. 科学出版社, 2009
[5]《生物信息学算法导论（An Introduction to BioinformaticsAlgorithms ）》，琼斯，帕夫纳著，王翼飞等译，化学工业出版社，2007年
2.期刊
[1]《生物信息学》
[2] 《Bioinformatics》
[3] 《BMC Bioinformatics》
3.网络资源
[1]华中农业大学国家精品课程生物信息学网站
(http://nhjy.hzau.edu.cn/kech/swxxx/index.htm)
[2]西南交通大学生物信息学精品课程网站
(http://jpkc.swjtu.edu.cn/C54/Course/Index.htm）
[3]东南大学生物信息学网络学习平台
(http://bioinfo.seu.edu.cn/xsun/courses.htm)
[4]美国国立生物技术信息中心
( http://www.ncbi.nlm.nih.gov)
[5]http://www.homolog.us/blogs/
[6]https://www.plob.org/tag/
