(一)蒙医基础理论的形成
蒙医学是在蒙古族游牧文化基础上产生和发展的传统民族医学，是在蒙古地区定居和生活的蒙古族和与蒙古族血统有关的古代毡帐部落及其他各民族人民在与自然界作斗争，特别是长期与疾病作斗争的实践中积累的经验结晶。蒙医学把人体看作是一个对立统一的有机整体，不仅从宏观的角度来研究人体各部内在动态性生命活动关系，而且把人体与自然环境看作为一个整体，研究及诠释人体生命活动规律。蒙医学在保持机体健康上，是以注重预防，增强体质，发挥机体内在的抵抗力和自我调节能力及辨证施治为主的一门具有蒙古民族特色的传统医学。蒙医学是在长期临床实践中逐渐丰富和发展起来的，同时也吸收了藏、汉等兄弟民族及古印度阿育吠陀(Ayur-Veda)医学的部分基础理论逐渐完善和发展起来，形成了独特的民族医学理论体系特色和优势。蒙医基础理论是各临床各学科的理论基础。
(二)蒙医学基础理论的范围和研究对象
从广义来说，蒙医基础理论包括古代哲学范畴的阴阳五行学说、生理学、病理学、诊断学、治疗原则与方法学等五大内容。