职称:副教授
单位:景德镇学院
部门:生物与环境工程学院
职位:生物工程专业教师
主讲教师:齐欢欢
教师团队:共3位
学校: | 景德镇学院 |
开课院系: | 生物与环境工程学院 |
专业大类: | 理学 |
开课专业: | 生物工程 |
课程英文名称: | Bioinformatics |
学分: | 2 |
课时: | 32 |
生物信息学(Bioinformatics)将分子生物学、基因组学、数学、计算机网络信息等科学相结合形成了一门新学科,该学科利用生物学、计算机科学和信息技术揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。随着基因组学的不断发展,许多基因组分析公司、科研机构、高校对掌握生物信息学知识的学生有了较大的人才需求,了解生物信息学基础知识,将为生物工程专业学生就业拓展道路和方向,为他们的科研和工作提供便利。《生物信息学》是生物工程专业的选修课之一,也可以作为风景园林、信息工程等生物相近专业或信息工程类专业甚至其他专业感兴趣同学的跨专业公共选修课程使用。主要内容包括:文献的获取、生物信息学数据库,生物信息学软件,核酸与蛋白质序列数据资源、系统发育分析、蛋白质分析等。其先导课程有计算机基础、生物化学、分子生物学。课程为2学分、32学时,分16周完成教学。选用的教材为刘娟编著的《生物信息学》普通高等教育“十一五”国家级规划教材。课程侧重于常用生物信息学工具的介绍,强调课外实践训练,突出课程的应用性特点。目前《生物信息学》已经在学校超星学习通网络平台建立了课程,具备了一定的网络教学基础。 《生物信息学》课程自2013年生物工程专业开始招生起,就列入该专业人才培养方案当中,并于2016年首次开始授课。截至目前共有13生工47人;14生工40人;15生工50人;16生工40人;17生工47人,18生工41人;19生工47人,7届合计312人选修了该课程。2017级生物工程班第一次使用了在线课程开展线上教学,截至本学期,参与线上教学学生合计135人次。学生线上学习的参与度远高于传统教学模式,对学生的主动性和积极性的调动很有帮助。从该课程还衍生出一些科研项目和课题,作为教师教研科研项目,也为毕业生撰写毕业论文提供了素材。到今年为止,项目负责人指导了15名毕业生开展生物信息学相关的毕业论文工作。
课程章节 | | 文件类型 | | 修改时间 | | 大小 | | 备注 | |
1.1 课程介绍 |
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1.2 概论(生物信息学简介) |
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1.3 生物信息学的知识体系、课程及资源 |
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1.4 生物信息学主要学习的内容 |
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2.1 核酸的结构 |
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2.2 中心法则与蛋白质的结构 |
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2.3 基因工程与分子系统发生分析 |
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3.1 PCR及引物设计原理 |
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3.2 引物设计软件的使用 |
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4.1 文献检索 |
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4.2 文献阅读和分类 |
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5.1 生物信息数据库概述 |
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5.2 三大生物信息学门户网站简介和展示 |
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5.3 genbank序列下载、提交及refseq |
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5.4 genbank序列数据及其注释的解读 |
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6.1 生物序列的相似性搜索 |
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7.1 DNAstar软件包简介 |
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8.1 phylip系统发生树的构建 |
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9.1 蛋白质结构的生物信息学分析 |
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9.2 案例1:埃博拉病毒gp蛋白的生物信息学简易分析 |
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10.1 转录组与宏基因组简介 |
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11.1 linux操作系统简介 |
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11.2 python语言和R语言简介 |
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12.1 华大基因简介 |
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13.1 教学大纲 |
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13.2 生物信息学电子讲义 |
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13.4.1 新型冠状病毒研究文献1篇 |
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13.4.2 核酸测序技术文献 |
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13.4.3 生物信息学学科发展报告(2013-2017) |
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13.4.4 生物信息学文献 |
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