微生物育种学是一门综合运用微生物学、分子生物学等理论与方法，从自然界中获得特定微生物或对现有菌种进行定向改造的学科。与之配套的《微生物育种实验》是生物工程专业继微生物学、生物化学、分子生物学后开设，并与微生物代谢工程、发酵工程、生物信息学、生物制药学等课程平行的一门重要必修课。实验内容包括传统微生物菌种资源筛选、16S rRNA基因测序、紫外诱变与基因定点突变等育种技术。 该实验课程实践性、技术性强，综合运用生物工程上、下游技术的基础理论，以开发微生物资源为目标，充分展现合成生物学、生物信息学等新技术、新方法在工业微生物菌种选育中的应用。通过本课程学习，学生将掌握微生物育种的原理与具体方法，为从事生物工程领域的生产和科学研究奠定良好基础。
本课程建设获得浙江工商大学校级精品在线开放课程项目（2018年）的资助。