制药设备与工程设计是制药工程专业基础必修课程。本课程在先修课程《化工原理》、《药品生产质量管理》、《制药过程安全与环保》的基础上，教授学生运用工程基础理论知识针对制药反应和加工过程进行工程学分析，建立GMP生产的初步概念，为制药设备合理选型提供理论基础。该课程以制药工艺过程为教学背景，使学生在理论上掌握单元有机反应的设备，化学合成制药和制剂厂车间工艺设计的多个环节，并通过多种案例分析讨论，以利于培养学生在制药工程中的观察分析、思维理解和独立解决问题的能力。另外，该课程介绍制药工程初步设计和洁净厂房设计，培养学生树立“人机料环法”五位一体的工程、环境、法规观念。